摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7页 |
第1章 绪论 | 第11-25页 |
1.1 肝细胞癌研究进展 | 第11-12页 |
1.2 lncRNA与肝癌 | 第12-19页 |
1.2.1 lncRNA综述 | 第12-14页 |
1.2.2 lncRNA的调控机制 | 第14-18页 |
1.2.3 lncRNA在肝癌中的研究进展 | 第18-19页 |
1.3 抗肿瘤多肽的研究进展 | 第19-21页 |
1.4 课题研究目的、意义和内容 | 第21-25页 |
1.4.1 本课题的研究目的和意义 | 第21-22页 |
1.4.2 本课题的研究内容 | 第22-23页 |
1.4.3 本课题创新点 | 第23-25页 |
第2章 多肽9R-201对肝癌HepG2细胞表达谱的作用 | 第25-49页 |
2.1 材料与方法 | 第25-33页 |
2.1.1 细胞培养与多肽9R-P201处理细胞 | 第25-27页 |
2.1.2 mRNA水平检测多肽9R-P201处理细胞后FoxM1的表达量变化 | 第27-29页 |
2.1.3 转录组测序样品的制备 | 第29-30页 |
2.1.4 RNA文库构建及转录组测序 | 第30页 |
2.1.5 测序数据的处理、比对和拼接 | 第30-31页 |
2.1.6 转录组差异表达分析 | 第31页 |
2.1.7 差异表达mRNAs和lncRNAs结构特征比较分析 | 第31页 |
2.1.8 差异表达lncRNAs靶基因的预测 | 第31-32页 |
2.1.9 差异表达mRNAs和lncRNAs靶基因的功能注释和富集分析 | 第32页 |
2.1.10 差异表达lncRNAs及mRNAs调控网路图构建 | 第32页 |
2.1.11 差异表达mRNAs和lncRNAs的实时荧光定量PCR验证 | 第32-33页 |
2.1.12 统计分析 | 第33页 |
2.2 结果与分析 | 第33-45页 |
2.2.1 多肽9R-P201处理HepG2细胞及FoxM1表达变化 | 第33-36页 |
2.2.2 转录组测序样品总RNA纯度及完整性鉴定 | 第36-37页 |
2.2.3 测序原始数据处理、比对和拼接 | 第37-38页 |
2.2.4 差异表达mRNAs和lncRNAs的筛选 | 第38-39页 |
2.2.5 差异表达mRNAs和lncRNAs的结构特征比较分析 | 第39-40页 |
2.2.6 差异表达lncRNAs靶基因的预测 | 第40页 |
2.2.7 差异表达mRNAs和lncRNAs靶基因功能注释和功能富集分析 | 第40-42页 |
2.2.8 差异表达mRNAs和lncRNAs调控网络图构建 | 第42-44页 |
2.2.9 差异表达mRNAs和lncRNAs的荧光定量PCR验证 | 第44-45页 |
2.3 讨论 | 第45-47页 |
2.4 本章小结 | 第47-49页 |
第3章 RP11-224019.2功能与调控机制初步研究 | 第49-64页 |
3.1 材料与方法 | 第49-54页 |
3.1.1 RNA-seq数据集和肝癌病例的下载 | 第49页 |
3.1.2 细胞培养及常规操作 | 第49页 |
3.1.3 细胞转染 | 第49-50页 |
3.1.4 靶向于RP11-224O19.2的siRNA筛选 | 第50-51页 |
3.1.5 CCK8实验检测细胞增殖 | 第51页 |
3.1.6 平板克隆形成实验 | 第51-52页 |
3.1.7 细胞划痕实验 | 第52页 |
3.1.8 Transwell细胞迁移实验 | 第52页 |
3.1.9 Transwell细胞侵袭实验 | 第52页 |
3.1.10 细胞凋亡检测 | 第52-53页 |
3.1.11 TGFB2在干扰RP11-224019.2后的表达量变化情况 | 第53页 |
3.1.12 共表达网络分析 | 第53-54页 |
3.1.13 数据分析 | 第54页 |
3.2 结果与分析 | 第54-61页 |
3.2.1 RP11-224O19.2在肝癌组织中上调并预示着差的预后状况 | 第54-56页 |
3.2.2 靶向RP11-224O19.2的siRNA筛选结果 | 第56-57页 |
3.2.3 RP11-224O19.2对HepG2细胞增殖、克隆形成和凋亡的作用 | 第57-58页 |
3.2.4 RP11-224O19.2对HepG2细胞迁移和侵袭能力的作用 | 第58-59页 |
3.2.5 RP11-224O19.2作用机制初步研究 | 第59-61页 |
3.3 讨论 | 第61-63页 |
3.4 本章小结 | 第63-64页 |
结论 | 第64-65页 |
致谢 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-74页 |
攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第74页 |