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多肽9R-P201诱导肝癌HepG2细胞的转录组分析以及长非编码RNA RP11-224O19.2的调控与功能研究

摘要第6-7页
Abstract第7页
第1章 绪论第11-25页
    1.1 肝细胞癌研究进展第11-12页
    1.2 lncRNA与肝癌第12-19页
        1.2.1 lncRNA综述第12-14页
        1.2.2 lncRNA的调控机制第14-18页
        1.2.3 lncRNA在肝癌中的研究进展第18-19页
    1.3 抗肿瘤多肽的研究进展第19-21页
    1.4 课题研究目的、意义和内容第21-25页
        1.4.1 本课题的研究目的和意义第21-22页
        1.4.2 本课题的研究内容第22-23页
        1.4.3 本课题创新点第23-25页
第2章 多肽9R-201对肝癌HepG2细胞表达谱的作用第25-49页
    2.1 材料与方法第25-33页
        2.1.1 细胞培养与多肽9R-P201处理细胞第25-27页
        2.1.2 mRNA水平检测多肽9R-P201处理细胞后FoxM1的表达量变化第27-29页
        2.1.3 转录组测序样品的制备第29-30页
        2.1.4 RNA文库构建及转录组测序第30页
        2.1.5 测序数据的处理、比对和拼接第30-31页
        2.1.6 转录组差异表达分析第31页
        2.1.7 差异表达mRNAs和lncRNAs结构特征比较分析第31页
        2.1.8 差异表达lncRNAs靶基因的预测第31-32页
        2.1.9 差异表达mRNAs和lncRNAs靶基因的功能注释和富集分析第32页
        2.1.10 差异表达lncRNAs及mRNAs调控网路图构建第32页
        2.1.11 差异表达mRNAs和lncRNAs的实时荧光定量PCR验证第32-33页
        2.1.12 统计分析第33页
    2.2 结果与分析第33-45页
        2.2.1 多肽9R-P201处理HepG2细胞及FoxM1表达变化第33-36页
        2.2.2 转录组测序样品总RNA纯度及完整性鉴定第36-37页
        2.2.3 测序原始数据处理、比对和拼接第37-38页
        2.2.4 差异表达mRNAs和lncRNAs的筛选第38-39页
        2.2.5 差异表达mRNAs和lncRNAs的结构特征比较分析第39-40页
        2.2.6 差异表达lncRNAs靶基因的预测第40页
        2.2.7 差异表达mRNAs和lncRNAs靶基因功能注释和功能富集分析第40-42页
        2.2.8 差异表达mRNAs和lncRNAs调控网络图构建第42-44页
        2.2.9 差异表达mRNAs和lncRNAs的荧光定量PCR验证第44-45页
    2.3 讨论第45-47页
    2.4 本章小结第47-49页
第3章 RP11-224019.2功能与调控机制初步研究第49-64页
    3.1 材料与方法第49-54页
        3.1.1 RNA-seq数据集和肝癌病例的下载第49页
        3.1.2 细胞培养及常规操作第49页
        3.1.3 细胞转染第49-50页
        3.1.4 靶向于RP11-224O19.2的siRNA筛选第50-51页
        3.1.5 CCK8实验检测细胞增殖第51页
        3.1.6 平板克隆形成实验第51-52页
        3.1.7 细胞划痕实验第52页
        3.1.8 Transwell细胞迁移实验第52页
        3.1.9 Transwell细胞侵袭实验第52页
        3.1.10 细胞凋亡检测第52-53页
        3.1.11 TGFB2在干扰RP11-224019.2后的表达量变化情况第53页
        3.1.12 共表达网络分析第53-54页
        3.1.13 数据分析第54页
    3.2 结果与分析第54-61页
        3.2.1 RP11-224O19.2在肝癌组织中上调并预示着差的预后状况第54-56页
        3.2.2 靶向RP11-224O19.2的siRNA筛选结果第56-57页
        3.2.3 RP11-224O19.2对HepG2细胞增殖、克隆形成和凋亡的作用第57-58页
        3.2.4 RP11-224O19.2对HepG2细胞迁移和侵袭能力的作用第58-59页
        3.2.5 RP11-224O19.2作用机制初步研究第59-61页
    3.3 讨论第61-63页
    3.4 本章小结第63-64页
结论第64-65页
致谢第65-66页
参考文献第66-74页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第74页

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