| 摘要（中文） | 第7-8页 |
| 摘要（英文） | 第8页 |
| 第一章 文献综述——分子标记在林木改良中的应用 | 第9-26页 |
| 1． 分子标记的分类及作用 | 第9-10页 |
| 2． 林木上常用的分子标记技术 | 第10-14页 |
| 2．1 SSCP | 第10-11页 |
| 2．2 AFLP | 第11页 |
| 2．3 ISSR | 第11-12页 |
| 2．4 RAPD标记技术 | 第12-14页 |
| 2．4．1 RAPD原理 | 第12页 |
| 2．4．2 RAPD特点 | 第12-13页 |
| 2．4．3 RAPD应用 | 第13-14页 |
| 3． 分子标记在林木改良中的应用 | 第14-26页 |
| 3．1 构建无性系指纹图谱 | 第14-15页 |
| 3．2 群体遗传变异研究 | 第15页 |
| 3．3 遗传图谱 | 第15-22页 |
| 3．3．1 图谱构建原理 | 第16页 |
| 3．3．2 分离群体 | 第16-19页 |
| 3．3．2．1 F1群体 | 第16页 |
| 3．3．2．2 F2群体 | 第16-17页 |
| 3．3．2．3 重组近交系（Recombinant Inbreed Lines，RIL） | 第17页 |
| 3．3．2．4 回交（Backcross，BS）群体 | 第17-18页 |
| 3．3．2．5 加倍单倍体（Doubled Haploids，DH） | 第18页 |
| 3．3．2．6 单倍体胚乳作图群体 | 第18-19页 |
| 3．3．3 遗传图谱的制作 | 第19-21页 |
| 3．3．3．1 分子标记数据的收集和处理 | 第19页 |
| 3．3．3．2 连锁的两点检验 | 第19-20页 |
| 3．3．3．3 利用MLE（最大似然估计）法估计重组值 | 第20页 |
| 3．3．3．4 多点分析与基因直线排序 | 第20页 |
| 3．3．3．5 作图软件 | 第20-21页 |
| 3．3．4 林木构建分子标记图谱现状 | 第21-22页 |
| 3．4 数量性状基因定位 | 第22-23页 |
| 3．5 分子标记辅助选择育种 | 第23-24页 |
| 3．6 图位克隆 | 第24页 |
| 3．7 比较基因组研究 | 第24-26页 |
| 第二章 黄山松分子标记连锁图谱构建 | 第26-41页 |
| 1． 材料和方法 | 第27-30页 |
| 1．1 材料 | 第27页 |
| 1．1．1 黄山松材料 | 第27页 |
| 1．1．2 PCR仪器 | 第27页 |
| 1．1．3 PCR试剂 | 第27页 |
| 1．1．4 随机引物 | 第27页 |
| 1．2 方法 | 第27-30页 |
| 1．2．1 种子胚乳挑取 | 第27-28页 |
| 1．2．2 胚乳DNA样品制备 | 第28页 |
| 1．2．3 DNA浓度测定 | 第28-29页 |
| 1．2．4 DNA纯度鉴定 | 第29页 |
| 1．2．5 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第29页 |
| 1．2．6 样品稀释冻存 | 第29页 |
| 1．2．7 RAPD扩增 | 第29-30页 |
| 1．2．8 引物筛选 | 第30页 |
| 1．2．9 RAPD扩增及数据收集 | 第30页 |
| 2． 结果与分析 | 第30-35页 |
| 2．1 RAPD实验方案优化 | 第30页 |
| 2．2 RAPD扩增 | 第30-31页 |
| 2．3 遗传图谱构建 | 第31-35页 |
| 3． 讨论 | 第35-40页 |
| 3．1 RAPD扩增影响因子 | 第35-36页 |
| 3．2 RAPD多态性 | 第36-37页 |
| 3．3 双引物筛选 | 第37页 |
| 3．4 偏分离分析 | 第37-38页 |
| 3．5 连锁图谱构建 | 第38-39页 |
| 3．6 分子标记与染色体的对应及在其上的分布 | 第39-40页 |
| 4． 结论 | 第40-41页 |
| 第三章 黄山松群体遗传多样性分析 | 第41-51页 |
| 1． 材料和方法 | 第41-45页 |
| 1．1 黄山松材料 | 第41-43页 |
| 1．2 DNA样品制备及浓度测定 | 第43页 |
| 1．3 RAPD扩增 | 第43-44页 |
| 1．4 引物筛选 | 第44页 |
| 1．5 RAPD扩增及数据收集和分析 | 第44页 |
| 1．6 表型多样性水平分析 | 第44页 |
| 1．7 遗传距离与聚类分析 | 第44-45页 |
| 2． 结果与分析 | 第45-48页 |
| 2．1 RAPD扩增结果 | 第45-47页 |
| 2．2 遗传多样性 | 第47页 |
| 2．3 聚类分析 | 第47-48页 |
| 3． 讨论 | 第48-51页 |
| 3．1 RAPD基因型确定 | 第48页 |
| 3．2 遗传多样性 | 第48-49页 |
| 3．3 聚类分析 | 第49-50页 |
| 3．4 RAPD检测多态性的可靠性 | 第50-51页 |
| 第四章 微流控DNA分离芯片检测多态性片段的研究 | 第51-57页 |
| 1． 材料与方法 | 第51-53页 |
| 1．1 黄山松DNA样品 | 第51页 |
| 1．2 PCR产物检测 | 第51-53页 |
| 1．2．1 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第51-52页 |
| 1．2．2 微流控DNA分离芯片检测 | 第52-53页 |
| 2． 结果与分析 | 第53-55页 |
| 2．1 芯片检测与琼脂糖凝胶电泳检测比较 | 第53页 |
| 2．2 采用微流控芯片在不同参数下的比较 | 第53页 |
| 2．3 RAPD片段的软件分析叠加图 | 第53-55页 |
| 3． 讨论 | 第55-56页 |
| 3．1 利用琼脂糖凝胶电泳和微流控芯片方法对RAPD片段的比较分析 | 第55页 |
| 3．2 采用微流控芯片在不同参数下的比较分析 | 第55-56页 |
| 3．3 微流控芯片对黄山松RAPD片段的多态性确认分析 | 第56页 |
| 4． 结论 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
