玉米和水稻产量及品质性状的关联分析研究
| 致谢 | 第7-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 目录 | 第11-13页 |
| 缩写清单 | 第13-14页 |
| 1 引言 | 第14-15页 |
| 2 文献综述 | 第15-26页 |
| 2.1 连锁分析与关联分析 | 第15-19页 |
| 2.1.1 连锁分析 | 第15-16页 |
| 2.1.2 关联分析 | 第16-19页 |
| 2.1.2.1 关联分析概念与优点 | 第16-17页 |
| 2.1.2.2 关联分析研究方法 | 第17-19页 |
| 2.2 全基因组关联分析 | 第19-22页 |
| 2.2.1 SNP标记 | 第19-20页 |
| 2.2.2 GWAS的提出 | 第20页 |
| 2.2.3 GWAS的设计 | 第20-21页 |
| 2.2.4 GWAS发展中存在的问题 | 第21-22页 |
| 2.3 关联分析在植物中的应用 | 第22-23页 |
| 2.4 本研究的背景、目的和意义 | 第23-26页 |
| 2.4.1 玉米三个穗部性状的遗传结构研究 | 第23-24页 |
| 2.4.2 水稻三个品质性状的遗传结构研究 | 第24-25页 |
| 2.4.3 研究目的及意义 | 第25-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-33页 |
| 3.1 关联分析材料 | 第26-28页 |
| 3.1.1 玉米NAM群体及穗部三个性状 | 第26-27页 |
| 3.1.2 水稻RIL群体及三个品质性状 | 第27-28页 |
| 3.2 关联分析步骤 | 第28-33页 |
| 3.2.1 GMDR-GPU的使用 | 第28-29页 |
| 3.2.2 遗传模型(全模型) | 第29-30页 |
| 3.2.3 一维和二维扫描显著位点 | 第30-31页 |
| 3.2.3.1 全基因组范围内一维扫描 | 第30页 |
| 3.2.3.2 全基因组范围内二维扫描 | 第30-31页 |
| 3.2.4 效应值估算 | 第31页 |
| 3.2.5 遗传率估算 | 第31-33页 |
| 4 结果分析 | 第33-48页 |
| 4.1 玉米穗部三个性状关联分析结果 | 第33-42页 |
| 4.1.1 不同遗传模型下遗传率的比较 | 第33-34页 |
| 4.1.2 三个穗部性状的QTS信息 | 第34-36页 |
| 4.1.3 遗传主效应及环境互作效应 | 第36-40页 |
| 4.1.3.1 穗长QTS的遗传效应 | 第37-38页 |
| 4.1.3.2 穗行数QTS的遗传效应 | 第38-39页 |
| 4.1.3.3 穗粗QTS的遗传效应 | 第39-40页 |
| 4.1.4 QTS遗传效应模式 | 第40-42页 |
| 4.2 水稻三个品质性状关联分析结果 | 第42-48页 |
| 4.2.1 蒙特卡洛模拟 | 第42-46页 |
| 4.2.1.1 模拟程序设计 | 第42页 |
| 4.2.1.2 模拟结果分析 | 第42-46页 |
| 不同群体大小 | 第42-43页 |
| 不同遗传率 | 第43-46页 |
| 4.2.2 水稻三个品质性状的遗传机制 | 第46-48页 |
| 5 讨论 | 第48-51页 |
| 5.1 研究意义探讨 | 第48-49页 |
| 5.2 水稻和玉米关联分析讨论 | 第49-51页 |
| 5.2.1 玉米穗部三个性状 | 第49页 |
| 5.2.2 水稻三个品质性状 | 第49-51页 |
| 6 参考文献 | 第51-58页 |
| 7 附录 | 第58-69页 |
| 作者简历 | 第69页 |
