l-SPD与多巴胺受体分子作用机制及KDR抑制剂发现与改造
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 GPCR晶体结构及激活模型研究进展 | 第8-19页 |
| 1.1 引言 | 第8页 |
| 1.2 GPCR结构生物学进展 | 第8-9页 |
| 1.3 GPCR序列及结构差异 | 第9-10页 |
| 1.4 GPCR激活模型 | 第10-13页 |
| 1.4.1 显著的跨膜螺旋重排 | 第11页 |
| 1.4.2 保守“微开关” | 第11-12页 |
| 1.4.3 配体依赖性“扳机” | 第12-13页 |
| 1.4.4 G蛋白结合与信号转导 | 第13页 |
| 1.5 GPCR的动态性质 | 第13-15页 |
| 1.5.1 基础活性 | 第13-14页 |
| 1.5.2 GPCR能谱 | 第14-15页 |
| 1.6 结语与展望 | 第15-16页 |
| 参考文献 | 第16-19页 |
| 第二章 l-SPD与多巴胺受体分子作用机制研究 | 第19-45页 |
| 2.1 引言 | 第19-20页 |
| 2.2 D1、D2受体的同源模建 | 第20-24页 |
| 2.2.1 同源模建方法介绍 | 第20-21页 |
| 2.2.2 方法与模型 | 第21-22页 |
| 2.2.3 结果与讨论 | 第22-24页 |
| 2.3 l-SPD多巴胺受体复合物构建 | 第24-29页 |
| 2.3.1 分子对接方法介绍 | 第24-25页 |
| 2.3.2 方法与模型 | 第25页 |
| 2.3.3 结果与讨论 | 第25-29页 |
| 2.4 l-SPD与多巴胺受体分子动力学模拟 | 第29-40页 |
| 2.4.1 分子动力学模拟方法介绍 | 第29-30页 |
| 2.4.2 NAMD程序介绍 | 第30-31页 |
| 2.4.3 方法与模型 | 第31-33页 |
| 2.4.4 结果与讨论 | 第33-40页 |
| 2.5 本章小结 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 第三章 受体酪氨酸激酶KDR抑制剂发现与改造 | 第45-71页 |
| 3.1 绪论 | 第45-49页 |
| 3.1.1 引言 | 第45页 |
| 3.1.2 生物学背景 | 第45-46页 |
| 3.1.3 抑制策略 | 第46-48页 |
| 3.1.4 新热点KDR | 第48-49页 |
| 3.2 基于优势结构和激酶类药性规则的虚拟筛选 | 第49-57页 |
| 3.2.1 激酶类药性规则 | 第49-51页 |
| 3.2.2 激酶抑制剂优势结构 | 第51-52页 |
| 3.2.3 虚拟筛选策略 | 第52-53页 |
| 3.2.4 活性与讨论 | 第53-55页 |
| 3.2.5 Src激酶抑制活性 | 第55-57页 |
| 3.3 基于拼合原理设计新结构骨架KDR抑制剂 | 第57-66页 |
| 3.3.1 KDR晶体结构 | 第57-59页 |
| 3.3.2 KDR抑制剂的结合模式 | 第59页 |
| 3.3.3 DAU-DAP杂化体设计思路 | 第59-61页 |
| 3.3.4 DAU-DAP杂化体改造策略 | 第61页 |
| 3.3.5 药理活性与讨论 | 第61-63页 |
| 3.3.6 进一步改造策略探讨 | 第63-66页 |
| 3.4 本章小结 | 第66-67页 |
| 3.5 实验部分 | 第67-69页 |
| 中间体3a的合成(通用方法A) | 第67页 |
| 中间体4a的合成(通用方法B) | 第67页 |
| 目标分子5a的合成(通用方法C) | 第67-68页 |
| 中间体3i的合成(通用方法D) | 第68页 |
| 中间体31的合成(通用方法E) | 第68-69页 |
| 中间体7a的合成(通用方法F) | 第69页 |
| 参考文献 | 第69-71页 |
| 第四章 全文总结 | 第71-73页 |
| 在读期间科研成果 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
| 重要化合物结构鉴定数据 | 第75-87页 |
| 重要化合物图谱 | 第87-108页 |
