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必特螺旋霉素生物合成调控的研究

中文摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 前言第10-16页
    1.1 必特螺旋霉素概述第10-11页
    1.2 Lrp蛋白的研究进展第11-16页
        1.2.1 lrp基因的发现及鉴定第12页
        1.2.2 Lrp对菌体生长、生理功能的调控第12-16页
第2章 实验材料与方法第16-44页
    2.1 实验材料第16-30页
        2.1.1 生物信息学分析工具第16页
        2.1.2 基因第16-17页
        2.1.3 质粒第17-18页
        2.1.4 菌株第18-19页
        2.1.5 引物第19-21页
        2.1.6 抗生素第21页
        2.1.7 工具酶与试剂第21-23页
        2.1.8 培养基配方第23-26页
        2.1.9 常用试剂配方第26-28页
        2.1.10 实验仪器第28-30页
    2.2 实验方法第30-44页
        2.2.1 PCR扩增第30-31页
        2.2.2 质粒提取第31页
        2.2.3 DNA片段切胶纯化第31-32页
        2.2.4 琼脂糖凝胶电泳第32页
        2.2.5 DNA与质粒连接和转化第32-33页
        2.2.6 转化子鉴定第33页
        2.2.7 链霉菌原生质体制备、再生与DNA转化至链霉菌原生质体第33-34页
        2.2.8 菌体破碎与蛋白纯化第34页
        2.2.9 酶切反应第34-35页
        2.2.10 发酵液上清萃取第35页
        2.2.11 构建E. coli BL21(DE3)/pET28a-acyB2; pET28a-lrp; pET28a-bldD蛋白表达菌株第35页
        2.2.12 在E. coli BL21(DE3)中表达AcyB2、Lrp、BldD蛋白第35-36页
        2.2.13 构建E. coli BL21(DE3) /pKJE7/pET28a-acyB2菌株并表达AcyB2蛋白第36页
        2.2.14 构建E. coli JM109/pQE9-bldD、pQE9-lrp蛋白表达菌株第36页
        2.2.15 在E. coli JM1 09中表达Lrp、BldD蛋白第36-37页
        2.2.16 Srm22蛋白表达第37页
        2.2.17 EMSA实验第37-38页
        2.2.18 构建含CRISPR/Cas系统的lrp改造片段重组质粒第38-39页
        2.2.19 构建△lrp-SP变株第39-40页
        2.2.20 △lrp-SP变株与S.spiramyceticus 1941原株发酵产物检测第40页
        2.2.21 制备△lrp-SP变株与S.spiramyceticus 1941原生质体并转化pWHM3-ist-ist质粒第40页
        2.2.22 △lrp-BT变株与S.spiramyceticus 1941-BT变株必特螺旋霉素检测第40页
        2.2.23 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941原株氨基酸含量检测第40-41页
        2.2.24 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941原株转录组检测第41页
        2.2.25 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941原株QPCR检测第41-42页
        2.2.26 △orf21发酵产物检测第42-43页
        2.2.27 鉴定△orf21发酵萃取产物第43页
        2.2.28 半制备△orf21发酵产物第43页
        2.2.29 ~(13)C NMR与~1H NMR第43-44页
第3章 实验结果第44-68页
    3.1 BT生物合成基因簇与lrp、bldD基因的生物信息学分析第44-46页
    3.2 构建Lrp、BldD、AcyB2与Srm22表达载体第46-47页
    3.3 Lrp、BldD、AcyB2与Srm22蛋白表达第47-50页
        3.3.1 AcyB2蛋白表达第48页
        3.3.2 Lrp蛋白表达第48-49页
        3.3.3 BldD蛋白表达第49-50页
        3.3.4 Srm22蛋白表达第50页
    3.4 获得推测的Lrp、BldD与Srm22结合靶序列第50-51页
    3.5 EMSA实验第51-55页
    3.6 构建△lrp-SP变株及验证第55-56页
    3.7 △lrp-SP变株与 spiramyceticus 1941发酵产物检测第56-58页
    3.8 制备△lrp-SP变株原生质体并导入ist基因第58页
    3.9 △lrp-BT变株与S. spiramyceticus 1941-BT变株发酵产物的检测第58-60页
    3.10 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941中氨基酸的含量检测第60-63页
    3.11 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941原株转录组检测第63-64页
    3.12 △lrp-SP变株与S. spiramyceticus 1941原株QPCR检测第64-65页
    3.13 参与BT福洛氨糖生物合成基因功能的鉴定第65-68页
        3.13.1 构建orf21基因阻断株第65页
        3.13.2 △orf21突变株发酵产物的鉴定第65-67页
        3.13.3 △orf21突变株中螺旋霉素类似物的纯化和化学结构鉴定第67-68页
第4章 讨论第68-71页
第五章 总结第71-72页
论文创新点第72-73页
参考文献第73-76页
英文缩写说明第76-78页
氨基酸缩写说明第78-79页
附录1第79-80页
论文发表第80-81页
学术会议第81-82页
致谢第82页

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