秦岭川金丝猴种群遗传结构与分子系统地理研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第12-32页 |
| 1.1 研究背景 | 第12页 |
| 1.2 川金丝猴的研究概况 | 第12-18页 |
| 1.2.1 川金丝猴的分布区与保护状况 | 第12-13页 |
| 1.2.2 川金丝猴的生态学研究 | 第13-16页 |
| 1.2.3 川金丝猴的遗传学研究 | 第16-18页 |
| 1.3 群体遗传学和谱系地理学研究方法 | 第18-30页 |
| 1.3.1 遗传多样性 | 第18-20页 |
| 1.3.2 种群遗传结构 | 第20-24页 |
| 1.3.3 种群历史与瓶颈效应 | 第24-26页 |
| 1.3.4 系统发生树以及分歧时间 | 第26-27页 |
| 1.3.5 嵌套枝系统地理分析 | 第27-28页 |
| 1.3.6 分子标记及其特点 | 第28-30页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第30-32页 |
| 第二章 材料与方法 | 第32-54页 |
| 2.1 研究区域与群体 | 第32-35页 |
| 2.2 实验流程 | 第35-41页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第35-37页 |
| 2.2.2 DNA提取 | 第37-38页 |
| 2.2.3 扩增与检测 | 第38-41页 |
| 2.3 微卫星位点开发 | 第41-43页 |
| 2.3.1 位点选取 | 第42页 |
| 2.3.2 样品来源 | 第42-43页 |
| 2.3.3 实验步骤 | 第43页 |
| 2.4 微卫星数据分析 | 第43-51页 |
| 2.4.1 排除重复个体 | 第43-44页 |
| 2.4.2 遗传多样性 | 第44-46页 |
| 2.4.3 瓶颈效应检验 | 第46页 |
| 2.4.4 种群遗传结构 | 第46页 |
| 2.4.5 隔离因素分析 | 第46-51页 |
| 2.5 线粒体DNA序列分析 | 第51-54页 |
| 2.5.1 单倍型分型 | 第51-52页 |
| 2.5.2 序列组成与遗传多样性 | 第52页 |
| 2.5.3 种群遗传结构 | 第52页 |
| 2.5.4 系统进化树 | 第52-53页 |
| 2.5.5 嵌套枝系统地理分析 | 第53页 |
| 2.5.6 种群历史动态 | 第53页 |
| 2.5.7 隔离因素分析 | 第53-54页 |
| 第三章 结果 | 第54-73页 |
| 3.1 微卫星位点开发结果 | 第54-58页 |
| 3.2 微卫星数据分析 | 第58-62页 |
| 3.2.1 遗传多样性 | 第58页 |
| 3.2.2 瓶颈效应检验 | 第58页 |
| 3.2.3 群体分化水平 | 第58-61页 |
| 3.2.4 分子方差分析 | 第61页 |
| 3.2.5 种群聚类 | 第61-62页 |
| 3.2.6 隔离因素分析 | 第62页 |
| 3.3 线粒体DNA序列分析 | 第62-73页 |
| 3.3.1 碱基组成与遗传多样性 | 第62-66页 |
| 3.3.2 分子方差分析 | 第66页 |
| 3.3.3 系统进化树 | 第66页 |
| 3.3.4 嵌套枝系统地理分析 | 第66页 |
| 3.3.5 种群历史动态 | 第66-72页 |
| 3.3.6 隔离因素分析 | 第72-73页 |
| 第四章 讨论 | 第73-81页 |
| 4.1 遗传数据的可靠性 | 第73页 |
| 4.2 遗传多样性 | 第73-74页 |
| 4.3 种群历史 | 第74-75页 |
| 4.4 遗传结构和迁移模式 | 第75-77页 |
| 4.5 地理格局成因 | 第77页 |
| 4.6 进化历史 | 第77-78页 |
| 4.7 秦岭川金丝猴保护建议 | 第78-80页 |
| 4.7.1 划定管理单元 | 第78-79页 |
| 4.7.2 加强猴群管理 | 第79页 |
| 4.7.3 建立种质资源库 | 第79-80页 |
| 4.8 结论与创新点 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-97页 |
| 攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第97-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 作者简介 | 第101页 |
