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运用CRISPR/Cas系统在大肠杆菌中异源表达希瓦氏菌脂肪酸代谢相关基因及其对脂肪酸代谢的影响

中文摘要第5-6页
Abstract第6页
中英符号缩略词表第9-10页
第一章 文献综述第10-25页
    1.1 脂肪酸介绍第10页
    1.2 大肠杆菌脂肪酸代谢的概述第10-12页
        1.2.1 脂肪酸合成及分解途径第10-11页
        1.2.2 脂肪酸合成和分解的调节第11-12页
    1.3 工程化构建游离脂肪酸产量目前的状况第12-14页
    1.4 转录调节因子(FadR)概述第14-15页
    1.5 ACC的结构和功能第15页
    1.6 多不饱和脂肪酸概述第15-16页
    1.7 产PUFA海洋细菌第16页
    1.8 希瓦氏菌中与脂肪酸合成相关的基因和途径第16-18页
    1.9 CRISPR/Cas系统概述第18-19页
    1.10 CRISPR-Cas系统提供一个适应性免疫第19-20页
    1.11 CRISPR/Cas9在基因组编辑上的应用第20-21页
    1.12 CRISPR/Cas9的靶点特异性第21-22页
    1.13 双切口和嵌合的FokI-dCas9策略来达到高度特异性的基因组编辑第22-23页
    1.14 基于网页软件的特异性gRNA设计和脱靶的预测第23页
    1.15 CRISPR/Cas9载体的构建第23-24页
    1.16 CRISPR免疫的前景第24-25页
第二章 材料与方法第25-39页
    2.1 实验材料第25-28页
        2.1.1 菌株与质粒第25页
        2.1.2 试剂与仪器第25-27页
        2.1.3 本研究中所用引物第27-28页
    2.2 实验方法第28-31页
        2.2.1 培养基的配制第28-29页
        2.2.2 大肠杆菌及冷海希瓦氏菌的培养第29页
        2.2.3 基因组DNA的制备第29-30页
        2.2.4 质粒的制备第30页
        2.2.5 凝胶及PCR产物回收第30-31页
        2.2.6 电转感受态的制备第31页
    2.3 CRISPR/Cas质粒构建及转化第31-39页
        2.3.1 反向PCR扩增pTargetF-spacer第31-32页
        2.3.2 琼脂糖凝胶电泳检测第32页
        2.3.3 pTargetF-spacer片段的纯化第32-33页
        2.3.4 pTargetF-spacer缺口的修复第33页
        2.3.5 靶向区域上下游同源片段的扩增和相连第33-35页
        2.3.6 电转化及突变体的鉴定第35-38页
        2.3.7 总脂的提取及脂肪酸甲脂化第38-39页
            2.3.7.1 总酯的提取第38页
            2.3.7.2 脂肪酸甲酯化第38页
            2.3.7.3 GC-MS分析第38-39页
第三章 结果与讨论第39-47页
    3.1 基因缺失菌株的构建结果第39-40页
        3.1.1 FadD和ppc基因同源片段的扩增第39页
        3.1.2 缺失突变菌的鉴定第39-40页
    3.2 缺失体及野生型菌株生长情况第40页
    3.3 突变体菌株的脂肪酸定性及定量第40-42页
    3.4 克隆和鉴定来自冷海希瓦氏菌的基因第42页
    3.5 定量以及定性分析大肠杆菌中的脂肪酸第42-45页
    3.6 讨论第45-47页
第四章 前景与展望第47-49页
    4.1 提高输出率第47页
    4.2 调节膜饱和度第47页
    4.3 处理代谢瓶颈和调节瓶颈第47-48页
    4.4 结构、生化和基因研究第48-49页
参考文献第49-56页
致谢第56-57页
作者简介第57-58页
导师评阅表第58页

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