| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| LIST OF ABBREVIATIONS | 第15-22页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第22-41页 |
| 1.1 BACKGROUND | 第22-27页 |
| 1.1.1 Distribution and Impact of Bacterial Blight disease of rice | 第23-24页 |
| 1.1.2 Discovery and Classification of Bacterial Blight disease | 第24页 |
| 1.1.3 Morphology and Physiology of Xanthomonas oryzae pv.oryzae | 第24-25页 |
| 1.1.4 Races of Xanthomonas oryzae pv.oryzae (Xoo) | 第25页 |
| 1.1.5 Mode of Infection | 第25-26页 |
| 1.1.6 Mode of Symptom and Sign of Bacterial Blight disesase | 第26-27页 |
| 1.2 DISEASE MANAGEMENT | 第27-32页 |
| 1.2.1 Biological Control | 第27-28页 |
| 1.2.2 Chemical Control | 第28页 |
| 1.2.3 Genetic Resistance against Bacterial Blight disease | 第28-32页 |
| 1.3 TYPES OF RESISTANCE | 第32-34页 |
| 1.3.1 Durability of Resistance | 第32页 |
| 1.3.2 Role of Conventional Breeding and Maker Assisted Selection | 第32-34页 |
| 1.3.3 Transgenic Approach | 第34页 |
| 1.4 SIGNIFICANCE OF STABILITY ANALYSIS | 第34-35页 |
| 1.5 LODGING RESISTANCE | 第35-39页 |
| 1.5.1 Types of Lodging | 第36-37页 |
| 1.5.2 Yield Loss | 第37页 |
| 1.5.3 Lodging Assessment | 第37-38页 |
| 1.5.4 Improvement of Lodging Resistant | 第38-39页 |
| 1.6 SCOPE AND OUTLINE OF THE THESIS | 第39-41页 |
| CHAPTER 2 IDENTIFICATION OF RICE PYRAMIDING LINES IN RILs OFCIHERANG WITH IRBB60 AND F88 WITH IRBB60 CROSSES | 第41-79页 |
| 2.1 SUMMARY | 第41页 |
| 2.2 INTRODUCTION | 第41-44页 |
| 2.3 PLANT MATERIALS | 第44-46页 |
| 2.4 METHODS | 第46-52页 |
| 2.4.1 Inoculum Preparation | 第46页 |
| 2.4.2 BB Races Inoculation and Assessment | 第46-47页 |
| 2.4.3 Preparation of CTAB and TAE buffer | 第47-48页 |
| 2.4.4 DNA Isolation | 第48-49页 |
| 2.4.5 DNA Quantification | 第49页 |
| 2.4.6 Molecular markers used for detecting BB resistance genes in RILs | 第49-51页 |
| 2.4.7 Gene linked primer for the Xa4 gene analysis | 第51页 |
| 2.4.8 PCR analysis for the xa5 gene | 第51-52页 |
| 2.4.9 Gene based and STS primers for the xa13 and Xa21 genes | 第52页 |
| 2.5 GENOTYPING | 第52-56页 |
| 2.5.1 SSR marker | 第52-53页 |
| 2.5.2 Polymerase Chain Reaction (PCR) | 第53-54页 |
| 2.5.3 Temperature profile | 第54页 |
| 2.5.4 Polyacrylamide Gel Electrophoresis for SSR product analysis | 第54-55页 |
| 2.5.5 Polymorphism study | 第55页 |
| 2.5.6 Genotyping scoring | 第55-56页 |
| 2.6 DATA COLLECTION | 第56页 |
| 2.7 STATISTICAL ANALYSIS | 第56页 |
| 2.8 RESULT | 第56-75页 |
| 2.8.1 Reaction of RILs to BB races | 第56-59页 |
| 2.8.2 Molecular markers analysis to identify pyramiding lines | 第59-67页 |
| 2.8.3 Parental survey | 第67-72页 |
| 2.8.4 Contribution of genome proportion derived from parents to pyramid lines | 第72-75页 |
| 2.9 DISCUSSION | 第75-77页 |
| 2.10 CONCLUSION | 第77-79页 |
| CHAPTER 3 DETERMINATION OF ENVIRONMENTAL INFLUENCES ONPYRAMID RICE LINES | 第79-94页 |
| 3.1 SUMMARY | 第79页 |
| 3.2 INTRODUCTION | 第79-81页 |
| 3.3 MATERIALS AND METHODS | 第81-84页 |
| 3.3.1 Experimental sites | 第81页 |
| 3.3.2 Plant materials | 第81-84页 |
| 3.3.3 Data collection | 第84页 |
| 3.3.4 Statistical analysis | 第84页 |
| 3.4 RESULTS AND DISCUSSION | 第84-93页 |
| 3.5 CONCLUSION | 第93-94页 |
| CHAPTER 4 IDENTIFICATION OF LODGING RESISTANCE QTLs IN RICE RILS | 第94-127页 |
| 4.1 SUMMARY | 第94-95页 |
| 4.2 INTRODUCTION | 第95-97页 |
| 4.3 MATERIALS AND METHODS | 第97-100页 |
| 4.3.1 Plant materials | 第97页 |
| 4.3.2 Phenotyping | 第97-99页 |
| 4.3.3 Genotyping | 第99-100页 |
| 4.3.4 Data analysis | 第100页 |
| 4.4 RESULTS | 第100-123页 |
| 4.4.1 Differences in parental lines and their RIL population | 第100-103页 |
| 4.4.2 Correlation analysis among lodging resistant traits | 第103-104页 |
| 4.4.3 QTLs affecting lodging traits | 第104-123页 |
| 4.5 DISCUSSION | 第123-125页 |
| 4.6 CONCLUSION | 第125-127页 |
| REFERENCES | 第127-155页 |
| APPENDICES | 第155-191页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第191-192页 |
| RESUME | 第192页 |
