| 致谢 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略表 | 第10-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-42页 |
| 1.1 胚胎干细胞简介 | 第15-19页 |
| 1.1.1 胚胎干细胞的发现 | 第15-16页 |
| 1.1.2 胚胎干细胞的特性 | 第16-17页 |
| 1.1.3 胚胎干细胞的应用前景 | 第17-18页 |
| 1.1.4 胚胎干细胞应用的限制 | 第18-19页 |
| 1.2 iPS细胞简介 | 第19-24页 |
| 1.2.1 iPS细胞的首次建立 | 第19-20页 |
| 1.2.2 iPS细胞与胚胎干细胞 | 第20-21页 |
| 1.2.3 iPS细胞技术的研究现状和应用前景 | 第21-24页 |
| 1.3 多能性细胞中的调控网络 | 第24-38页 |
| 1.3.1 多能性细胞内的转录因子调控网络 | 第24-28页 |
| 1.3.2 多能性细胞中的主要信号通路 | 第28-32页 |
| 1.3.3 多能性细胞中表观遗传调控 | 第32-38页 |
| 1.4 Sox2蛋白的翻译后修饰研究现状 | 第38-42页 |
| 1.4.1 Sox2的磷酸化修饰 | 第39-40页 |
| 1.4.2 Sox2的甲基化修饰 | 第40页 |
| 1.4.3 Sox2的泛素化修饰 | 第40-41页 |
| 1.4.4 Sox2的糖基化修饰 | 第41-42页 |
| 第二章 实验材料和实验方法 | 第42-84页 |
| 2.1 实验材料 | 第42-53页 |
| 2.1.1 常用缓冲液和培养基配方 | 第42-46页 |
| 2.1.2 实验所用抗体 | 第46-47页 |
| 2.1.3 实验所用主要试剂及试剂盒 | 第47-49页 |
| 2.1.4 实验所用细胞 | 第49页 |
| 2.1.5 实验所用菌株 | 第49页 |
| 2.1.6 实验所用引物 | 第49-53页 |
| 2.1.7 实验所用质粒 | 第53页 |
| 2.2 实验方法 | 第53-84页 |
| 2.2.1 构建载体 | 第53-56页 |
| 2.2.2 感受态的制备 | 第56-57页 |
| 2.2.3 质粒大量提取实验 | 第57-59页 |
| 2.2.4 原核蛋白纯化 | 第59-60页 |
| 2.2.5 哺乳动物细胞培养（以293T细胞为例） | 第60-61页 |
| 2.2.6 真核蛋白纯化 | 第61-62页 |
| 2.2.7 RNA提取以及实时定量PCR | 第62-64页 |
| 2.2.8 蛋白印迹实验（Western Blot) | 第64-65页 |
| 2.2.9 免疫荧光实验 | 第65页 |
| 2.2.10 荧光素酶报告基因分析实验 | 第65-66页 |
| 2.2.11 细胞核质分离实验 | 第66-67页 |
| 2.2.12 OG2-MEF细胞制备 | 第67-68页 |
| 2.2.13 iPS细胞形成实验 | 第68-69页 |
| 2.2.14 AP染色实验 | 第69页 |
| 2.2.15 拟胚体形成分化实验 | 第69-70页 |
| 2.2.16 RA诱导分化实验 | 第70-71页 |
| 2.2.17 蛋白泛素化实验 | 第71-72页 |
| 2.2.18 蛋白稳定性测试 | 第72-73页 |
| 2.2.19 体外磷酸化实验 | 第73页 |
| 2.2.20 免疫共沉淀实验 | 第73-74页 |
| 2.2.21 染色质免疫共沉淀 | 第74-77页 |
| 2.2.22 RNA 文库建立（New England Biolabs 试剂盒） | 第77-82页 |
| 2.2.23 畸胎瘤形成实验 | 第82页 |
| 2.2.24 石蜡切片制作及苏木精-伊红染色实验 | 第82-84页 |
| 第三章 实验结果和分析 | 第84-121页 |
| 3.1 Sox2重要修饰位点筛选 | 第84-93页 |
| 3.1.1 Sox2在重编程过程中重要位点筛选 | 第84-88页 |
| 3.1.2 Y279位点磷酸化调控Sox2功能 | 第88-93页 |
| 3.2 Sox2蛋白可以被Pyk2磷酸化 | 第93-100页 |
| 3.2.1 Sox2蛋白可以被Pyk2体外磷酸化 | 第93-95页 |
| 3.2.2 Sox2被Pyk2在Y279位磷酸化 | 第95-98页 |
| 3.2.3 Sox2与Pyk2有相互作用 | 第98-100页 |
| 3.3 在mESCs中,Pyk2调控Sox2功能 | 第100-106页 |
| 3.3.1 敲低Pyk2促进小鼠胚胎干细胞分化 | 第100-102页 |
| 3.3.2 RA诱导干细胞分化时,敲低Pyk2抑制细胞向外胚层分化 | 第102-103页 |
| 3.3.3 敲低Pyk2降低Sox2转录活性 | 第103-104页 |
| 3.3.4 过表达Pyk2影响小鼠畸胎瘤形成 | 第104-106页 |
| 3.4 Pyk2介导的Y279位磷酸化影响Sox2功能的机制 | 第106-119页 |
| 3.4.1 Sox2 Y279位磷酸化影响Sox2的转录活性 | 第106-109页 |
| 3.4.2 Sox2 Y279位磷酸化不改变Sox2蛋白在细胞中的亚定位 | 第109-110页 |
| 3.4.3 Sox2 Y279位磷酸化不影响Sox2蛋白的稳定性 | 第110-113页 |
| 3.4.4 Sox2 Y279位磷酸化不是Sox2与Oct4/Nanog相互作用的必要条件 | 第113-115页 |
| 3.4.5 Sox2 Y279位磷酸化影响Sox2与Tet2的相互作用 | 第115-119页 |
| 3.5 总结 | 第119-121页 |
| 第四章 讨论 | 第121-125页 |
| 4.1 酪氨酸磷酸化修饰调控转录因子Sox2的转录活性 | 第121-122页 |
| 4.2 Pyk2蛋白在多能性细胞中的功能 | 第122-123页 |
| 4.3 Sox2与Tet的关系 | 第123-125页 |
| 参考文献 | 第125-136页 |
| 附录A | 第136-141页 |
| 附录B | 第141-150页 |
| 作者简历 | 第150页 |
