| 中文摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 综述 | 第11-16页 |
| ·蛋白与配体相互作用 | 第11-12页 |
| ·计算机模拟蛋白质分子的折叠 | 第12-14页 |
| ·α-凝血酶和CDK2抑制剂的研究 | 第14-16页 |
| 第二章 模拟生物体系过程的相关理论基础 | 第16-29页 |
| ·分子动力学模拟 | 第16-23页 |
| ·分子动力学的发展史和应用领域 | 第16页 |
| ·分子力场 | 第16-18页 |
| ·积分算法 | 第18-20页 |
| ·溶剂模型 | 第20-23页 |
| ·加速分子动力学简介 | 第23-26页 |
| ·MFCC结合泊松-玻尔兹曼模型产生PPC | 第26-29页 |
| 第三章 极化力场和加速分子动力学在生物体系中的应用 | 第29-55页 |
| ·电子极化效应对人类α -凝血酶的影响 | 第29-37页 |
| ·研究背景 | 第29-30页 |
| ·方法介绍 | 第30-31页 |
| ·结果分析与讨论 | 第31-36页 |
| ·结论 | 第36-37页 |
| ·在隐式溶剂模型中使用加速分子动力学模拟全原子蛋白直接折叠 | 第37-48页 |
| ·研究背景 | 第37页 |
| ·方法介绍 | 第37-39页 |
| ·结果分析与讨论 | 第39-47页 |
| ·结论 | 第47-48页 |
| ·药物设计中关于CDK2抑制剂的探索 | 第48-55页 |
| ·研究背景 | 第48-49页 |
| ·方法介绍 | 第49-50页 |
| ·结果分析与讨论 | 第50-54页 |
| ·结论 | 第54-55页 |
| 第四章 总结与展望 | 第55-57页 |
| 参考文献 | 第57-60页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |