摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
第一章 绪论 | 第9-13页 |
·研究的背景及意义 | 第9-10页 |
·课题研究的国内外现状 | 第10-11页 |
·本文的结构安排 | 第11-13页 |
第二章 酶蛋白质中特殊模体及相关数据库的简介 | 第13-16页 |
·酶蛋白质中β-发夹模体的简介 | 第13页 |
·酶蛋白质中βαβ模体的简介 | 第13-14页 |
·相关数据库的简介 | 第14-15页 |
·本章小结 | 第15-16页 |
第三章 酶蛋白质中特殊模体β-发夹的预测 | 第16-27页 |
·数据集建立 | 第16页 |
·材料的选取 | 第16-18页 |
·研究对象的选取 | 第16-17页 |
·固定序列模式长的选取 | 第17-18页 |
·特征参数的提取 | 第18-21页 |
·氨基酸亲疏水组分 | 第18页 |
·亲疏水组分的位点保守性分析 | 第18-20页 |
·平均化学位移值(ACS) | 第20-21页 |
·方法和评价指标 | 第21-23页 |
·矩阵打分算法(S) | 第21-22页 |
·支持向量机(SVM)算法 | 第22-23页 |
·精度评价指标 | 第23页 |
·结果与讨论 | 第23-26页 |
·矩阵打分算法(S)预测结果 | 第23-24页 |
·支持向量机(SVM)算法预测结果 | 第24-26页 |
·本章小结 | 第26-27页 |
第四章 酶蛋白质中特殊模体βαβ的预测 | 第27-37页 |
·数据集的构建 | 第27页 |
·统计分析 | 第27-31页 |
·研究对象的选取 | 第27-28页 |
·固定序列模式长的选取 | 第28-31页 |
·特征参数的提取 | 第31-33页 |
·残基间的相互作用(AC) | 第31-32页 |
·预测二级结构信息(ss) | 第32页 |
·离散增量值(ID) | 第32页 |
·矩阵打分值(s) | 第32-33页 |
·随机森林(RF)算法 | 第33-34页 |
·结果与讨论 | 第34-35页 |
·用随机森林(RF)算法对酶蛋白质中βαβ模体的预测结果 | 第34页 |
·用支持向量机(SVM)算法对酶蛋白质中βαβ模体的预测结果 | 第34-35页 |
·本章小结 | 第35-37页 |
第五章 总结与展望 | 第37-39页 |
·本文总结 | 第37-38页 |
·课题展望 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-43页 |
附录 | 第43-47页 |
附图一 第一种和第三种截取方式得到的β-发夹氨基酸亲疏水组分位点保守性分析图 | 第43-45页 |
附图二 第一种和第三种截取方式得到的βαβ模体氨基酸位点保守性分析图 | 第45-47页 |
致谢 | 第47-48页 |
在读期间取得的科研成果 | 第48-49页 |