| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-43页 |
| ·介观化学体系中的随机理论和方法 | 第11-16页 |
| ·化学主方程 | 第12-13页 |
| ·随机模拟方法 | 第13-14页 |
| ·化学朗之万方程(Chemical Langevin Equation) | 第14-16页 |
| ·介观延迟化学体系的随机理论和方法 | 第16-20页 |
| ·延迟体系的随机模拟方法 | 第16-17页 |
| ·延迟体系的随机微分方程 | 第17-20页 |
| ·前向流采样方法(Forward Flux Sampling) | 第20-27页 |
| ·前向流采样方法简介 | 第21-24页 |
| ·前向流采样方法的应用：计算稳态分布 | 第24-27页 |
| ·随机范式理论 | 第27-41页 |
| ·Hopf 分岔理论简介 | 第28-29页 |
| ·普适随机范式方程 | 第29-33页 |
| ·随机范式理论的应用 | 第33-41页 |
| 本章结语 | 第41-43页 |
| 第二章 介观化学体系中非高斯效应的研究 | 第43-65页 |
| ·非高斯噪声概述 | 第43-48页 |
| ·常见的非高斯噪声 | 第44-46页 |
| ·q 型非高斯噪声的研究进展简介 | 第46-48页 |
| ·非高斯噪声诱导振荡：现象描述 | 第48-52页 |
| ·布鲁塞尔振子的随机范式分析 | 第52-58页 |
| ·非高斯效应的机理 | 第58-64页 |
| 本章结语 | 第64-65页 |
| 第三章 介观化学体系中非马尔科夫效应的研究 | 第65-101页 |
| ·介观化学体系中的非马尔科夫效应概述 | 第65-69页 |
| ·生理时钟体系中非马尔科夫效应与内涨落协同作用的研究 | 第69-90页 |
| ·生理时钟概述 | 第70-79页 |
| ·生理时钟体系的研究方法 | 第79-84页 |
| ·非马尔科夫效应与内涨落的协同作用：数值模拟与理论分析结果 | 第84-90页 |
| ·基因开关体系中的非马尔科夫效应研究 | 第90-100页 |
| ·基因开关简介 | 第91-92页 |
| ·确定性模型 | 第92-93页 |
| ·非马尔科夫效应对基因开关稳定性的作用研究 | 第93-95页 |
| ·非马尔科夫效应对基因开关转变路径动力学的作用研究 | 第95-100页 |
| 本章结语 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-109页 |
| 硕博连读期间发表论文 | 第109-110页 |
| 致谢 | 第110-111页 |
