基于ChIP-Seq数据分析前列腺癌中雄激素受体相关基因
| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 引言 | 第8-11页 |
| ·课题的研究背景及意义 | 第8-9页 |
| ·课题的研究现状 | 第9页 |
| ·本文的研究 | 第9-10页 |
| ·论文的组织 | 第10-11页 |
| 第2章 ChIP-Seq技术的介绍 | 第11-14页 |
| ·ChIP-Seq 概述 | 第11页 |
| ·ChIP-Seq 与 ChIP-chip | 第11-12页 |
| ·ChIP-Seq 流程 | 第12页 |
| ·ChIP-Seq 相关软件介绍 | 第12-14页 |
| 第3章 AR相关的 ChIP-Seq数据搜集 | 第14-16页 |
| 第4章 AR结合位点的鉴定及基因组注释 | 第16-24页 |
| ·AR 结合位点的鉴定 | 第16-17页 |
| ·AR 结合区域的大小统计分析 | 第17-18页 |
| ·AR 结合位点与转录起始位点的距离分布 | 第18-20页 |
| ·AR 结合位点的基因组注释 | 第20-22页 |
| ·查找新的 AR 结合 motif | 第22-24页 |
| 第5章 AR调控的基因功能富集分析 | 第24-29页 |
| ·查找 AR 起始转录调控基因 | 第24-25页 |
| ·AR 调控基因的 GO 富集分析 | 第25-26页 |
| ·AR 调控基因的 KEGG 通路富集分析 | 第26-27页 |
| ·AR 调控基因的 GeneGo 通路富集分析 | 第27-29页 |
| 第6章 AR相关富集通路的验证 | 第29-32页 |
| ·文献报道验证 | 第29-30页 |
| ·前列腺癌相关的基因表达数据验证 | 第30页 |
| ·前列腺癌相关的 microRNA 表达数据验证 | 第30-32页 |
| 第7章 讨论与展望 | 第32-34页 |
| 参考文献 | 第34-39页 |
| 附录一 | 第39-41页 |
| 附录二 | 第41-42页 |
| 附录三 | 第42-44页 |
| 附录四 | 第44-46页 |
| 附录五 | 第46-47页 |
| 致谢 | 第47-48页 |
