金属特异性打分函数及分子对接软件的设计与应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-21页 |
| ·新药研发的进展 | 第10-11页 |
| ·计算机辅助药物设计的方法概述 | 第11-13页 |
| ·基于结构的药物设计方法 | 第11-12页 |
| ·基于配体的药物设计方法 | 第12-13页 |
| ·分子对接 | 第13-18页 |
| ·分子表示方式 | 第14页 |
| ·搜索方法与分子柔性 | 第14-16页 |
| ·打分函数 | 第16-18页 |
| ·基于力场的打分函数 | 第16-17页 |
| ·经验打分函数 | 第17页 |
| ·基于知识的打分函数 | 第17-18页 |
| ·金属蛋白对接 | 第18-19页 |
| ·论文整体安排 | 第19-21页 |
| 第2章 金属特异性打分函数及分子对接软件的设计 | 第21-38页 |
| ·研究背景与目的 | 第21-23页 |
| ·含锌金属蛋白简介 | 第21-22页 |
| ·现有打分函数对金属的处理 | 第22-23页 |
| ·理论与方法 | 第23-32页 |
| ·数据集的准备 | 第23-24页 |
| ·计算初始的势能 | 第24-28页 |
| ·基于NSGA-Ⅱ的多目标优化配体构象采样 | 第28-29页 |
| ·限制性约束 | 第29-30页 |
| ·迭代优化 | 第30-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-36页 |
| ·程序的验证 | 第32-33页 |
| ·优化势能的特征 | 第33-35页 |
| ·金属特异性分子对接软件的优势 | 第35-36页 |
| ·本章小结 | 第36-38页 |
| 第3章 碳酸酐酶Ⅸ抑制剂的结构改造与优化 | 第38-53页 |
| ·碳酸酐酶简介 | 第38页 |
| ·α-CAs的结构特征 | 第38-39页 |
| ·CA Ⅸ的结构和表达 | 第39-41页 |
| ·CA Ⅸ抑制剂的研究进展 | 第41-42页 |
| ·新型磺胺类抑制剂 | 第41-42页 |
| ·香豆素类抑制剂 | 第42页 |
| ·其他类型抑制剂 | 第42页 |
| ·CA Ⅸ抑制剂的设计 | 第42-51页 |
| ·化合物12a的结构改造 | 第43-44页 |
| ·化合物19的结构改造 | 第44-47页 |
| ·抑制剂的选择性 | 第47-49页 |
| ·实验方法 | 第49-51页 |
| ·分子模拟 | 第49-50页 |
| ·化合物对CA Ⅸ的抑制活性测试 | 第50-51页 |
| ·化合物对CA Ⅰ和CA Ⅱ的抑制活性测试 | 第51页 |
| ·本章小结 | 第51-53页 |
| 第4章 全文总结 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-66页 |
| 硕士期间发表论文 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
