| 摘要 | 第1-11页 |
| ABSTRACT | 第11-14页 |
| 上篇 文献综述 | 第14-53页 |
| 第一章 植物根际拮抗芽孢杆菌的防病促生机理概述 | 第15-27页 |
| 1 根际拮抗、促生芽孢杆菌的研发概况 | 第15-17页 |
| ·国内生防促生芽孢杆菌的研发概况 | 第16页 |
| ·国外生防促生芽孢杆菌的研发概况 | 第16-17页 |
| 2 拮抗芽孢杆菌的生防作用机制 | 第17-21页 |
| ·营养和空间位点的竞争 | 第17-18页 |
| ·芽孢杆菌拮抗物质的产生 | 第18-20页 |
| ·芽孢杆菌对植物产生诱导抗性 | 第20-21页 |
| 3 根际拮抗芽孢杆菌的促生机理 | 第21页 |
| 4 目前实践应用中存在的问题及其对策 | 第21-23页 |
| ·生防促生菌在实践应用中存在的问题 | 第21-22页 |
| ·解决生防菌在植物病害防治中存在问题的对策 | 第22-23页 |
| 参考文献 | 第23-27页 |
| 第二章 非核糖体肽类抗生素的合成及生防作用 | 第27-39页 |
| 1 非核糖体肽化合物及其结构 | 第27-29页 |
| 2 非核糖体肽类化合物合成酶作用机理 | 第29-32页 |
| 3 非核糖体肽合成酶系(NRPSs/PKSs)的生物信息学研究 | 第32-33页 |
| 4 非核糖体肽类化合物的生理功能和应用 | 第33页 |
| 5 非核糖体肽类化合物在生物防治中的作用 | 第33-35页 |
| 6 展望 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-39页 |
| 第三章 细菌滚环式复制类型质粒的研究概况 | 第39-53页 |
| 1 滚环式复制质粒的宿主多样性 | 第40-43页 |
| 2 质粒序列结构 | 第43-44页 |
| 3 滚环式复制质粒的复制机理 | 第44-47页 |
| ·前导链的复制 | 第44-45页 |
| ·后随链的复制 | 第45-47页 |
| 4 质粒携带的基因功能研究 | 第47-48页 |
| 5 芽孢杆菌内生滚环式复制质粒的应用 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-53页 |
| 下篇 研究内容 | 第53-133页 |
| 第一章 基于多相分类方法的生防芽孢杆菌鉴定和菌株产生抗生素质谱检测 | 第55-71页 |
| 摘要 | 第55-56页 |
| 1 材料和方法 | 第56-59页 |
| ·菌株和培养基 | 第56页 |
| ·酶和引物合成 | 第56-57页 |
| ·基于DNA序列的分子鉴定 | 第57-58页 |
| ·基于BOX-PCR指纹图谱的鉴定 | 第58页 |
| ·脂肪酸甲酯鉴定 | 第58-59页 |
| ·菌体发酵和抗菌物质粗提物的制备 | 第59页 |
| ·质谱(MALDI-TOF-MS)检测 | 第59页 |
| 2 结果和讨论 | 第59-66页 |
| ·16S rDNA鉴定 | 第59-60页 |
| ·gyrB鉴定 | 第60-62页 |
| ·BOX-PCR图谱 | 第62页 |
| ·FAME分析 | 第62-63页 |
| ·多相分类鉴定结果 | 第63页 |
| ·生防菌产生非核糖体肽类物质质谱分析 | 第63-66页 |
| 3 本章小结 | 第66-67页 |
| ABSTRACT | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 第二章 基于Bacillus amyloliquefaciens B3基因组测序的新型非核糖体合成酶基因和生防促生相关基因分析 | 第71-95页 |
| 摘要 | 第71-72页 |
| 1 材料和方法 | 第72-79页 |
| ·菌株和培养基 | 第72页 |
| ·酶和引物合成 | 第72-73页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3差减文库的构建 | 第73-76页 |
| ·Southern Dot Blot初步筛选差异DNA片段 | 第76-78页 |
| ·反向PCR和半随机引物PCR | 第78页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3基因组完全测序 | 第78-79页 |
| ·基因组生物信息学比对和NRPS分析 | 第79页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3产生抗菌物质质谱检测 | 第79页 |
| 2 结果与讨论 | 第79-90页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3差减杂交 | 第79-83页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3测序分析 | 第83-84页 |
| ·新型NRPS分析及预测 | 第84-86页 |
| ·解淀粉芽孢杆菌B3中与植物促生防病相关基因初步分析 | 第86-90页 |
| 3 本章小结 | 第90-91页 |
| ABSTRACT | 第91-92页 |
| 参考文献 | 第92-95页 |
| 第三章 Bacillus amyloliquefaciens B3内生质粒PBSG3特性研究及应用 | 第95-115页 |
| 摘要 | 第95-96页 |
| 1 材料与方法 | 第96-101页 |
| ·菌株和质粒 | 第96-98页 |
| ·酶和引物合成 | 第98页 |
| ·培养基和分子操作 | 第98-99页 |
| ·质粒pBSG3的完全测序及序列分析 | 第99页 |
| ·单链DNA(ssDNA)的检测 | 第99页 |
| ·芽孢杆菌-大肠杆菌穿梭载体的构建 | 第99页 |
| ·质粒在芽孢杆菌中的稳定性测试 | 第99-100页 |
| ·木糖诱导下的rapQ,phrQ, rapQ-phrQ表达整合载体的构建 | 第100页 |
| ·芽孢杆菌孢子形成效率的检测 | 第100-101页 |
| 2 结果和讨论 | 第101-110页 |
| ·质粒pBSG3整体特征 | 第101-102页 |
| ·质粒pBSG3属于RCR质粒 | 第102-106页 |
| ·基于pBSG3开发的穿梭载体的稳定性分析 | 第106-107页 |
| ·RapQ-PhrQ系统参与孢子形成过程 | 第107-109页 |
| ·利用pTRDS穿梭载体在芽孢杆菌OKB105中表达Haprin蛋白 | 第109-110页 |
| 3 本章小结 | 第110-111页 |
| ABSTRACT | 第111-112页 |
| 参考文献 | 第112-115页 |
| 第四章 高效生防促生基因工程菌FZBHarpin的研发及其效果初评 | 第115-133页 |
| 摘要 | 第115-116页 |
| 1 材料和方法 | 第116-122页 |
| ·培养基 | 第116页 |
| ·生物材料 | 第116-118页 |
| ·载体的构建和解淀粉芽孢杆菌FZB42化学转化 | 第118-119页 |
| ·芽孢杆菌发酵 | 第119页 |
| ·反转录PCR检测技术 | 第119-121页 |
| ·生防菌促生、防病表型测定方法 | 第121-122页 |
| 2 结果和讨论 | 第122-128页 |
| ·Harpin蛋白整合表达载体的构建 | 第122-124页 |
| ·双突变体FZBAN和FZBHarpin工程菌的构建及其转化子验证 | 第124-125页 |
| ·基于RNA水平的hpa1基因的转录检测 | 第125-126页 |
| ·FZB42、FZBAN突变体和FZBHarpin生防促生效果 | 第126-128页 |
| 3 本章小结 | 第128-130页 |
| ABSTRACT | 第130-131页 |
| 参考文献 | 第131-133页 |
| 附录 | 第133-147页 |
| 缩略语 | 第147-149页 |
| 致谢 | 第149-151页 |
| 攻读博士学位期间发表的论文 | 第151页 |
