| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-15页 |
| ·分子生物学概论 | 第9页 |
| ·DNA、RNA蛋白质简介 | 第9-12页 |
| ·研究三维结构的必要性 | 第12-13页 |
| ·本文的主要工作内容及组织结构 | 第13-15页 |
| 第二章 蛋白质空间结构相似性比较方法综述 | 第15-27页 |
| ·引言 | 第15-21页 |
| ·Lempel-Ziv算法 | 第15-17页 |
| ·动态规划算法 | 第17-19页 |
| ·Nandy图表示法 | 第19-21页 |
| ·三维空间中的Z曲线法 | 第21-22页 |
| ·基于LZ复杂性距离的蛋白质空间结构比较方法 | 第22-23页 |
| ·简单LZ复杂性距离 | 第22页 |
| ·条件LZ复杂性距离 | 第22-23页 |
| ·LZ复杂性距离 | 第23页 |
| ·基于蛋白质骨架直接配准的空间结构比较方法 | 第23-25页 |
| ·基于TOPS图的蛋白质三维空间结构相似性比较方法 | 第25-26页 |
| 本章小结 关于当前空间结构相似度研究存在的几个问题 | 第26-27页 |
| 第三章 蛋白质结构字母表及其二级结构的特征序列 | 第27-33页 |
| ·八字母结构字母表 | 第27-28页 |
| ·蛋白质二级结构特征序列 | 第28-33页 |
| 第四章 基于模糊矩阵理论的蛋白质二级结构相似性比较 | 第33-39页 |
| ·模糊相似矩阵算法原理 | 第33-34页 |
| ·频率矩阵 | 第33页 |
| ·对频率矩阵的处理 | 第33-34页 |
| ·构造模糊相似矩阵 | 第34页 |
| ·模糊分类 | 第34-36页 |
| ·模糊等价关系 | 第34-35页 |
| ·基于模糊等价矩阵进行分类 | 第35-36页 |
| ·实验与分析 | 第36-38页 |
| 本章小结 | 第38-39页 |
| 第五章 基于二级结构特征序列的3D表示及应用 | 第39-46页 |
| ·本方法的流程图 | 第39页 |
| ·蛋白质二级结构特征序列的3D表示 | 第39-41页 |
| ·应用举例 | 第41-43页 |
| ·基于分布图的直观比较 | 第41-43页 |
| ·相似度的计算 | 第43页 |
| 本章小结 | 第43-46页 |
| 结论 | 第46-48页 |
| 一、本文工作总结 | 第46页 |
| 二、工作展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 附录A 算法中处理数据的部分C++程序 | 第50-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
