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哺乳动物锌指蛋白中KRAB功能域及其亚家族的研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
1 绪论第9-19页
   ·锌指结构与功能第9-10页
     ·DNA 结合区域第9页
     ·锌指结构与功能第9-10页
   ·KRAB 和SCAN 功能域第10-13页
     ·KRAB-A第11页
     ·KRAB B/BL/b第11-12页
     ·KRAB-C第12页
     ·SCAN 功能域第12页
     ·SSX 蛋白第12-13页
   ·KRAB 锌指蛋白亚家族及其分布特点第13-15页
     ·常见的KRAB 锌指蛋白亚家族第13页
     ·KRAB 锌指基因的染色体分布特点第13-14页
     ·锌指区域的进化演变第14-15页
   ·KRAB 锌指蛋白家族的主要作用第15-18页
     ·KRAB 锌指蛋白转录调控模型第15-16页
     ·KRAB 锌指蛋白的重要功能及机理第16-18页
   ·研究目的、意义与创新点第18-19页
     ·研究目的第18页
     ·研究意义与创新点第18-19页
2 实验所用原始数据、分析方法及初步结果第19-32页
   ·数据第19-20页
     ·基因数据库第19页
     ·数据源第19-20页
   ·功能域预测第20-24页
     ·HMMER 程序包与功能域搜索第20-21页
     ·具体步骤、参数设置与实验结果第21-24页
   ·系统发育谱分析第24-27页
     ·CLUSTAL W 与多重联配第24页
     ·MEGA 与系统发育树的构建第24-27页
     ·具体步骤、参数设置与实验结果第27页
   ·mRNA 组织表达谱分析第27-32页
     ·统计软件R 与数据标准化第27-29页
     ·Cluster 3.0 与聚类第29页
     ·具体步骤、参数设置和实验结果第29-32页
3 实验结果分析与讨论第32-41页
   ·KRAB 锌指基因的全基因组分布第32-34页
   ·锌指蛋白质中KRAB 功能域分布及多样性进化速率研究第34-37页
   ·KRAB 亚家族的功能及进化分析第37-41页
4 结语第41-42页
5 参考文献第42-50页
6 附录第50-80页
   ·ENSEMBL 人全蛋白质组序列中找到的KRAB 锌指蛋白结果第50-56页
   ·ENSEMBL 黑猩猩全蛋白质组序列中找到的KRAB 锌指蛋白结果第56-62页
   ·ENSEMBL 小鼠全蛋白质组序列中找到的KRAB 锌指蛋白结果第62-67页
   ·ENSEMBL 大鼠全蛋白质组序列中找到的KRAB 锌指蛋白结果第67-70页
   ·ENSEMBL 狗全蛋白质组序列中找到的KRAB 锌指蛋白结果第70-73页
   ·人KRAB 锌指蛋白中锌指区域序列的系统发育树第73-80页
7 致谢第80-81页
8 学术论文与科研成果目录第81-83页

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