摘要 | 第1-8页 |
ABSTRACT | 第8-16页 |
第一章 细小病毒的研究进展 | 第16-28页 |
·细小病毒亚科分类 | 第16页 |
·细小病毒的理化特征 | 第16-17页 |
·细小病毒的基因组结构 | 第17-18页 |
·细小病毒基因组的复制 | 第18-20页 |
·细小病毒基因组的转录调节元件 | 第20-22页 |
·细小病毒基因组的转录 | 第22页 |
·结构蛋白与非结构蛋白功能 | 第22-24页 |
·结构蛋白主要功能区 | 第22-23页 |
·非结构蛋白的细胞毒性作用 | 第23-24页 |
·细小病毒基因表达调控 | 第24页 |
·细小病毒基因工程载体 | 第24-28页 |
·自主性细小病毒载体 | 第25-26页 |
·腺联病毒载体 | 第26-28页 |
第二章 浓核病毒研究进展 | 第28-38页 |
·浓核病毒的感染组织特异性 | 第28-29页 |
·浓核病毒亚科的分类和基因组结构 | 第29-32页 |
·浓核病毒基因组的转录和表达 | 第32-34页 |
·浓核病毒编码的蛋白 | 第34-36页 |
·浓核病毒结构蛋白 | 第34页 |
·浓核病毒非结构蛋白 | 第34-36页 |
·浓核病毒作为生物学的工具 | 第36-38页 |
·浓核病毒作为表达载体 | 第36页 |
·浓核病毒作为生物防治的工具 | 第36-38页 |
第三章 家蚕浓核病毒的研究进展 | 第38-46页 |
·家蚕浓核病毒的分类 | 第38-39页 |
·家蚕浓核病的病理特征 | 第39页 |
·家蚕浓核病毒基因组结构及复制 | 第39-41页 |
·家蚕浓核病毒的基因转录 | 第41页 |
·病毒粒子的结构蛋白 | 第41-42页 |
·家蚕BmDNV的品种感受性研究 | 第42-43页 |
·血清学技术在家蚕病毒研究中的应用 | 第43-46页 |
第四章 研究的目的、内容和技术路线 | 第46-50页 |
·研究背景及目的意义 | 第46-47页 |
·研究的内容 | 第47-48页 |
·研究的技术路线 | 第48-50页 |
第五章 家蚕浓核病毒BmDNV-3全基因组序列的测定 | 第50-60页 |
·材料与方法 | 第50-56页 |
·病毒及大肠杆菌 | 第50页 |
·工具酶及载体 | 第50页 |
·主要试剂 | 第50页 |
·其它试剂的配制 | 第50-51页 |
·主要仪器设备 | 第51-52页 |
·家蚕浓核病毒BmDNV-3的分离纯化 | 第52页 |
·BmDNV-3 DNA的抽提 | 第52-53页 |
·琼脂糖胶回收DNA片段 | 第53页 |
·病毒DNA克隆 | 第53页 |
·连接反应 | 第53-54页 |
·感受态细胞制备 | 第54页 |
·质粒DNA转化 | 第54页 |
·SDS-碱裂解法小量抽提质粒DNA | 第54-55页 |
·质粒DNA的小量快速制备(供克隆酶切鉴定用) | 第55页 |
·BmDNV-3的克隆子双酶切鉴定 | 第55页 |
·序列测定 | 第55-56页 |
·结果与分析 | 第56-59页 |
·BmDNV-3基因组克隆 | 第56-57页 |
·BmDNV-3基因组的核苷酸序列连接装配 | 第57页 |
·病毒VD1、VD2基因组的末端结构分析 | 第57-59页 |
·本章小结 | 第59-60页 |
第六章 家蚕浓核病毒BmDNV-3基因组生物信息学分析 | 第60-74页 |
·材料与方法 | 第60-61页 |
·BmDNV-3基因组的核苷酸序列 | 第60页 |
·BmDNV-3核苷酸序列生物信息学分析 | 第60页 |
·BmDNV-3 VD1 ORF4的DNA聚合酶分析 | 第60-61页 |
·结果与分析 | 第61-71页 |
·基因组的开放阅读框(ORF) | 第61-62页 |
·开放阅读框编码的氨基酸序列 | 第62-64页 |
·开放阅读框氨基酸同源性比较 | 第64-65页 |
·可能的启动子区和poly(A)位点 | 第65-66页 |
·浓核病毒非结构蛋白保守区域 | 第66-68页 |
·BmDNV-3与细小病毒的系统发育树 | 第68页 |
·BmDNV-3VD1和VD2复制方式 | 第68-69页 |
·BmDNV-3 VD1 ORF4 DNA聚合酶保守区域 | 第69-71页 |
·本章小结 | 第71-74页 |
第七章 BmDNV-3和BmDNV-2(Yamanashi isolate)基因组序列比较 | 第74-80页 |
·材料与方法 | 第74页 |
·结果与分析 | 第74-78页 |
·BmDNV-3与BmDNV-2(Yamanashi isolate)开放阅读框比较 | 第74-75页 |
·BmDNV-3与BmDNV-2(Yamanashi isolate)同源性比较 | 第75-76页 |
·BmDNV-3与BmDNV-2(yamanashi isolate)末端反向重复序列 | 第76-78页 |
·本章小结 | 第78-80页 |
第八章 家蚕浓核病毒BmDNV-3基因组转录的研究 | 第80-92页 |
·材料与方法 | 第80-85页 |
·总RNA抽提 | 第80-81页 |
·Northern blot | 第81-83页 |
·5′-RACE和3′-RACE | 第83-85页 |
·结果与分析 | 第85-90页 |
·总RNA质量检测 | 第85-86页 |
·Northern blot分析 | 第86-87页 |
·BmDNV-3 VD1的5′-RACE和3′-RACE | 第87-89页 |
·BmDNV-3 VD1的基因组织结构 | 第89-90页 |
·本章小结 | 第90-92页 |
第九章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1与VD2的相关研究 | 第92-100页 |
·材料和方法 | 第92-95页 |
·主要实验仪器设备 | 第92页 |
·主要实验试剂 | 第92页 |
·病毒DNA分离 | 第92-93页 |
·病毒浮力密度的测定 | 第93页 |
·荧光定量PCR | 第93-94页 |
·病毒衣壳蛋白SDS-PAGE电泳 | 第94-95页 |
·结果与分析 | 第95-98页 |
·荧光定量PCR标准曲线 | 第95-96页 |
·荧光定量PCR溶解曲线 | 第96页 |
·VD1、VD2浮力密度和起始拷贝数 | 第96-97页 |
·BmDNV-3病毒衣壳蛋白SDS-PAGE电泳 | 第97-98页 |
·本章小结 | 第98-100页 |
第十章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1 ORF4 3′端部分在大肠杆菌中表达 | 第100-104页 |
·材料与方法 | 第100-102页 |
·材料 | 第100页 |
·常用缓冲液 | 第100页 |
·主要仪器 | 第100-101页 |
·pUC119-VD1 ORF4 3′端部分片段克隆 | 第101页 |
·pET28a(+)-VD1 ORF4 3′端部分片段表达载体的构建 | 第101页 |
·VD1 ORF4 3′端部分在大肠杆菌中的表达 | 第101-102页 |
·SDS-PAGE分析鉴定表达产物 | 第102页 |
·结果和分析 | 第102-103页 |
·pET28a(+)-VD1 ORF4 3′端部分片段表达载体的构建 | 第102页 |
·重组质粒PCR鉴定结果 | 第102-103页 |
·SDS-PAGE分析鉴定表达产物 | 第103页 |
·本章小结 | 第103-104页 |
第十一章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1 ORF4 3′端部分在杆状病毒中表达 | 第104-110页 |
·材料和方法 | 第105-106页 |
·质粒、菌种与细胞 | 第105页 |
·酶及主要试剂 | 第105页 |
·质粒pFASTBAC HTB-VD1 ORF4基因的部分片段构建与鉴定 | 第105页 |
·转座重组杆状病毒Bacmid/VD1 ORF4基因的部分片段质粒 | 第105-106页 |
·Bacmid/VD1 ORF4基因的部分片段的PCR检测鉴定 | 第106页 |
·重组Bacmid转染昆虫细胞 | 第106页 |
·结果与分析 | 第106-108页 |
·重组质粒pFASTBAC HTB-VD1 ORF4 3′端部分片段的构建 | 第106-107页 |
·重组质粒酶切鉴定结果 | 第107页 |
·PCR鉴定Bacmid/VD1 ORF4基因部分片段转座重组 | 第107-108页 |
·本章小结 | 第108-110页 |
参考文献 | 第110-118页 |
结论与创新点 | 第118-120页 |
展望 | 第120-121页 |
致谢 | 第121-122页 |
博士期间发表论文、GenBank登录号和参加课题 | 第122页 |