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家蚕浓核病毒BmDNV-3基因组结构与功能的研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-16页
第一章 细小病毒的研究进展第16-28页
   ·细小病毒亚科分类第16页
   ·细小病毒的理化特征第16-17页
   ·细小病毒的基因组结构第17-18页
   ·细小病毒基因组的复制第18-20页
   ·细小病毒基因组的转录调节元件第20-22页
   ·细小病毒基因组的转录第22页
   ·结构蛋白与非结构蛋白功能第22-24页
     ·结构蛋白主要功能区第22-23页
     ·非结构蛋白的细胞毒性作用第23-24页
   ·细小病毒基因表达调控第24页
   ·细小病毒基因工程载体第24-28页
     ·自主性细小病毒载体第25-26页
     ·腺联病毒载体第26-28页
第二章 浓核病毒研究进展第28-38页
   ·浓核病毒的感染组织特异性第28-29页
   ·浓核病毒亚科的分类和基因组结构第29-32页
   ·浓核病毒基因组的转录和表达第32-34页
   ·浓核病毒编码的蛋白第34-36页
     ·浓核病毒结构蛋白第34页
     ·浓核病毒非结构蛋白第34-36页
   ·浓核病毒作为生物学的工具第36-38页
     ·浓核病毒作为表达载体第36页
     ·浓核病毒作为生物防治的工具第36-38页
第三章 家蚕浓核病毒的研究进展第38-46页
   ·家蚕浓核病毒的分类第38-39页
   ·家蚕浓核病的病理特征第39页
   ·家蚕浓核病毒基因组结构及复制第39-41页
   ·家蚕浓核病毒的基因转录第41页
   ·病毒粒子的结构蛋白第41-42页
   ·家蚕BmDNV的品种感受性研究第42-43页
   ·血清学技术在家蚕病毒研究中的应用第43-46页
第四章 研究的目的、内容和技术路线第46-50页
   ·研究背景及目的意义第46-47页
   ·研究的内容第47-48页
   ·研究的技术路线第48-50页
第五章 家蚕浓核病毒BmDNV-3全基因组序列的测定第50-60页
   ·材料与方法第50-56页
     ·病毒及大肠杆菌第50页
     ·工具酶及载体第50页
     ·主要试剂第50页
     ·其它试剂的配制第50-51页
     ·主要仪器设备第51-52页
     ·家蚕浓核病毒BmDNV-3的分离纯化第52页
     ·BmDNV-3 DNA的抽提第52-53页
     ·琼脂糖胶回收DNA片段第53页
     ·病毒DNA克隆第53页
     ·连接反应第53-54页
     ·感受态细胞制备第54页
     ·质粒DNA转化第54页
     ·SDS-碱裂解法小量抽提质粒DNA第54-55页
     ·质粒DNA的小量快速制备(供克隆酶切鉴定用)第55页
     ·BmDNV-3的克隆子双酶切鉴定第55页
     ·序列测定第55-56页
   ·结果与分析第56-59页
     ·BmDNV-3基因组克隆第56-57页
     ·BmDNV-3基因组的核苷酸序列连接装配第57页
     ·病毒VD1、VD2基因组的末端结构分析第57-59页
   ·本章小结第59-60页
第六章 家蚕浓核病毒BmDNV-3基因组生物信息学分析第60-74页
   ·材料与方法第60-61页
     ·BmDNV-3基因组的核苷酸序列第60页
     ·BmDNV-3核苷酸序列生物信息学分析第60页
     ·BmDNV-3 VD1 ORF4的DNA聚合酶分析第60-61页
   ·结果与分析第61-71页
     ·基因组的开放阅读框(ORF)第61-62页
     ·开放阅读框编码的氨基酸序列第62-64页
     ·开放阅读框氨基酸同源性比较第64-65页
     ·可能的启动子区和poly(A)位点第65-66页
     ·浓核病毒非结构蛋白保守区域第66-68页
     ·BmDNV-3与细小病毒的系统发育树第68页
     ·BmDNV-3VD1和VD2复制方式第68-69页
     ·BmDNV-3 VD1 ORF4 DNA聚合酶保守区域第69-71页
   ·本章小结第71-74页
第七章 BmDNV-3和BmDNV-2(Yamanashi isolate)基因组序列比较第74-80页
   ·材料与方法第74页
   ·结果与分析第74-78页
     ·BmDNV-3与BmDNV-2(Yamanashi isolate)开放阅读框比较第74-75页
     ·BmDNV-3与BmDNV-2(Yamanashi isolate)同源性比较第75-76页
     ·BmDNV-3与BmDNV-2(yamanashi isolate)末端反向重复序列第76-78页
   ·本章小结第78-80页
第八章 家蚕浓核病毒BmDNV-3基因组转录的研究第80-92页
   ·材料与方法第80-85页
     ·总RNA抽提第80-81页
     ·Northern blot第81-83页
     ·5′-RACE和3′-RACE第83-85页
   ·结果与分析第85-90页
     ·总RNA质量检测第85-86页
     ·Northern blot分析第86-87页
     ·BmDNV-3 VD1的5′-RACE和3′-RACE第87-89页
     ·BmDNV-3 VD1的基因组织结构第89-90页
   ·本章小结第90-92页
第九章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1与VD2的相关研究第92-100页
   ·材料和方法第92-95页
     ·主要实验仪器设备第92页
     ·主要实验试剂第92页
     ·病毒DNA分离第92-93页
     ·病毒浮力密度的测定第93页
     ·荧光定量PCR第93-94页
     ·病毒衣壳蛋白SDS-PAGE电泳第94-95页
   ·结果与分析第95-98页
     ·荧光定量PCR标准曲线第95-96页
     ·荧光定量PCR溶解曲线第96页
     ·VD1、VD2浮力密度和起始拷贝数第96-97页
     ·BmDNV-3病毒衣壳蛋白SDS-PAGE电泳第97-98页
   ·本章小结第98-100页
第十章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1 ORF4 3′端部分在大肠杆菌中表达第100-104页
   ·材料与方法第100-102页
     ·材料第100页
     ·常用缓冲液第100页
     ·主要仪器第100-101页
     ·pUC119-VD1 ORF4 3′端部分片段克隆第101页
     ·pET28a(+)-VD1 ORF4 3′端部分片段表达载体的构建第101页
     ·VD1 ORF4 3′端部分在大肠杆菌中的表达第101-102页
     ·SDS-PAGE分析鉴定表达产物第102页
   ·结果和分析第102-103页
     ·pET28a(+)-VD1 ORF4 3′端部分片段表达载体的构建第102页
     ·重组质粒PCR鉴定结果第102-103页
     ·SDS-PAGE分析鉴定表达产物第103页
   ·本章小结第103-104页
第十一章 家蚕浓核病毒BmDNV-3 VD1 ORF4 3′端部分在杆状病毒中表达第104-110页
   ·材料和方法第105-106页
     ·质粒、菌种与细胞第105页
     ·酶及主要试剂第105页
     ·质粒pFASTBAC HTB-VD1 ORF4基因的部分片段构建与鉴定第105页
     ·转座重组杆状病毒Bacmid/VD1 ORF4基因的部分片段质粒第105-106页
     ·Bacmid/VD1 ORF4基因的部分片段的PCR检测鉴定第106页
     ·重组Bacmid转染昆虫细胞第106页
   ·结果与分析第106-108页
     ·重组质粒pFASTBAC HTB-VD1 ORF4 3′端部分片段的构建第106-107页
     ·重组质粒酶切鉴定结果第107页
     ·PCR鉴定Bacmid/VD1 ORF4基因部分片段转座重组第107-108页
   ·本章小结第108-110页
参考文献第110-118页
结论与创新点第118-120页
展望第120-121页
致谢第121-122页
博士期间发表论文、GenBank登录号和参加课题第122页

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