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基于生物信息学方法从牛和绵羊表达序列标签中筛选SSR标记的初步研究

中文摘要第1-7页
英文摘要第7-11页
第一章 文献综述第11-43页
   ·分子标记研究概述第11-16页
     ·分子标记的类型及特点第11-12页
     ·几种常用的分子遗传标记的原理及特点第12-16页
   ·微卫星概述第16-28页
     ·微卫星分子标记的发展简史第16-17页
     ·微卫星DNA 的概念和特点第17-20页
     ·微卫星 DNA 的多态性及其机理第20-21页
     ·微卫星 DNA 的功能第21-24页
     ·微卫星 DNA 在畜禽遗传育种中的作用第24-27页
     ·常用的获得微卫星序列的方法第27-28页
   ·EST 概况第28-35页
     ·国际上 EST 的应用主要表现在以下几个方面第30-34页
     ·常用的 EST 二次数据库第34-35页
   ·EST-SSR第35-37页
   ·生物信息学研究概述第37-42页
     ·生物信息学发展历程第37-38页
     ·生物信息学的特点第38页
     ·研究领域第38-39页
     ·生物信息学与动物遗传育种第39-41页
     ·存在的问题第41页
     ·展望第41-42页
   ·本研究的目的和意义第42-43页
第二章 从绵羊和牛 ESTs 数据库中筛选微卫星标记的生物信息学分析第43-93页
   ·前言第43-44页
   ·材料与方法第44-45页
     ·材料与设备第44页
     ·牛和绵羊UniGene序列来源第44页
     ·牛和绵羊EST-SSRs的发掘第44-45页
     ·含有SSR序列的注释第45页
   ·结果与分析第45-52页
     ·从 EST 数据库中筛选 SSR 的频率第45-46页
     ·牛、绵羊数据库中SSR分布情况第46-47页
     ·牛、绵羊微卫星的碱基组成第47-52页
     ·绵羊和牛 EST-SSR 注释第52页
   ·讨论第52-54页
     ·微卫星的频率和分布情况第52页
     ·微卫星基序的组成情况第52-53页
     ·EST-SSR 功能分析结果第53-54页
   ·小结第54-93页
第三章 绵羊微卫星标记的验证和获得第93-112页
   ·前言第93页
   ·材料与方法第93-103页
     ·实验材料第93-97页
     ·实验方法第97-101页
     ·微卫星引物的设计第101-102页
     ·微卫星多态性引物的筛选步骤第102页
     ·数据统计与分析第102-103页
   ·结果与分析第103-109页
     ·基因组DNA的提取结果第103页
     ·引物设计和初步筛选结果第103-104页
     ·多态性微卫星引物的筛选结果第104-107页
     ·七个绵羊品种的等位基因分析第107-108页
     ·七个绵羊品种杂合度分析第108-109页
   ·讨论第109-111页
     ·引物设计中微卫星序列的选取第109页
     ·PCR产物的纯度第109页
     ·聚丙烯酰胺凝胶浓度第109-110页
     ·关于基因型判断问题第110页
     ·微卫星标记 PCR 产物检测中银染条件的优化第110-111页
   ·小结第111-112页
第四章 结论第112-113页
参考文献第113-129页
致谢第129-130页
作者简介第130页

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