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β地中海贫血的新突变鉴定和高通量突变检测方法研究

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-17页
第一部分:一种新的β~0地贫基因的鉴定第17-73页
 第1章 引言第17-23页
 第2章 实验材料第23-27页
  2.1 仪器及生物学分析软件第23页
  2.2 试剂第23-26页
  2.3 标本第26-27页
 第3章 实验方法第27-46页
  3.1 鉴定β地贫新突变的研究策略第27页
  3.2 β地贫血液学表型分析第27-28页
  3.3 中国人β地贫24种突变的检测第28-31页
   3.3.1 外周血基因组DNA的制备第28-29页
   3.3.2 PCR扩增β-珠蛋白基因第29-30页
   3.3.3 反向点杂交(RDB)实验第30-31页
  3.4 β地贫新突变的发现和基因分型第31-33页
   3.4.1 DNA序列测定第31-32页
   3.4.2 RDB法用于新突变基因分型第32-33页
  3.5 mRNA水平的功能研究第33-44页
   3.5.1 总RNA的提取和质量鉴定第33-35页
   3.5.2 β-珠蛋白基因mRNA水平分析第35-44页
  3.6 β-珠蛋白基因簇单倍型分析第44-46页
 第4章 实验结果第46-59页
  4.1 先证者及其家庭成员血液学表型数据第46-47页
  4.2 β地贫新突变基因型鉴定第47-50页
   4.2.1 中国人β地贫24种突变分析结果第47-48页
   4.2.2 DNA序列测定结果第48-49页
   4.2.3 RDB法基因分型新突变第49-50页
  4.3 β地贫新突变mRNA水平分析结果第50-56页
   4.3.1 总RNA的质量鉴定第50页
   4.3.2 引物的质量鉴定第50-51页
   4.3.3 实时荧光定量RT-PCR反应的特异性评价第51-53页
   4.3.4 构建相对定量标准曲线第53-54页
   4.3.5 实验数据的标准化和mRNA相对定量结果第54-56页
  4.4 β地贫基因RFLP单倍型的确定第56-59页
 第5章 分析与讨论第59-66页
  5.1 β地贫表型与基因型分析第59-60页
  5.2 CDs15/16(+G)移码突变产生机理分析第60-61页
  5.3 CDs15/16(+G)移码突变的功能分析第61-65页
   5.3.1 实时荧光定量RT-PCR实验分析第62-64页
   5.3.2 β-珠蛋白mRNA水平降低的可能机制第64-65页
  5.4 β-珠蛋白基因簇单倍型分析第65-66页
 第6章 参考文献第66-73页
第二部分 基于荧光偏振的高通量β地贫突变检测方法研究第73-101页
 第1章 引言第73-78页
 第2章 实验材料第78-80页
  2.1 仪器及生物学分析软件第78页
  2.2 试剂第78-79页
  2.3 样品第79-80页
 第3章 实验方法第80-90页
  3.1 方法学研究的技术路线第80页
  3.2 DNA样品的选择及制备第80-82页
  3.3 引物设计第82-83页
  3.4 PCR扩增β-珠蛋白基因的效率和特异性评价第83-84页
  3.5 SBE-FP法平行检测中国人β地贫8种突变第84-87页
   3.5.1 PCR扩增目的基因第84-85页
   3.5.2 残余引物和dNTP的降解第85页
   3.5.3 单碱基延伸(SBE)反应和荧光偏振(FP)检测第85-87页
  3.6 动力学实验优化SBE-FP反应条件第87-88页
  3.7 用SBE-FP法对阳性控制样品进行基因分型第88页
  3.8 盲法实验评价SEB-FP法的特异性第88-90页
 第4章 实验结果第90-97页
  4.1 PCR产物特异性评价第90-91页
  4.2 实验条件的优化结果第91-94页
  4.3 阳性控制样品基因分型结果第94-96页
  4.4 特异性评价实验第96-97页
 第5章 分析与讨论第97-99页
 第6章 参考文献第99-101页
附录:英文缩写词中英文对照表第101-103页
攻读博士学位期间(01.9—05.6)成果第103-105页
致谢第105-106页
第一军医大学 学位论文原创性声明第106页
学位论文版权使用授权书第106页

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