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盐芥(Thellungiella Halophila)作为耐盐模式植物的耐盐机理研究

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-13页
前言第13-14页
第一部分:文献综述第14-44页
 第一章:盐芥作为耐盐的模式植物以及盐芥SOS1,SOS2,SOS3,p5CS的RNAi第14-22页
  1.盐芥作为耐盐的模式植物第14-15页
  2.SOS1、SOS2、SOS3及其在盐胁迫下的离子均衡第15-16页
  3.基因沉默第16-21页
   3.1 基因沉默的分子机制第16-19页
    3.1.1 基因沉默现象的发现第17页
    3.1.2 TGS和PTGS、RdRP第17-18页
    3.1.3 dsRNA和HDGS、RdDM第18页
    3.1.4 siRNA和S-PTGS、IR-PTGS第18-19页
   3.2 RNAi技术及其在功能基因组中的应用第19-21页
    3.2.1 反义和共抑制技术的应用第19页
    3.2.2 编码区RNAi和启动子区RNAi技术第19-20页
    3.2.3 RNAi的研究进展及应用第20-21页
  4.盐芥SOS1、SOS2、SOS3、p5CS的RNAi及其研究意义第21-22页
 第二章:盐诱导相关基因及其实时定量PCR的表达分析第22-40页
  1.非生物胁迫信号第23-29页
   1.1 受体和钙信号第23页
   1.2 细胞内的磷酸蛋白模式第23-27页
    1.2.1 丝氨酸/苏氨酸激酶与依赖于钙的蛋白激酶CDPK第24-25页
    1.2.2 蛋白磷酸酶第25-26页
    1.2.3 MAPK模式第26-27页
   1.3 ABA信号传导途径第27-28页
   1.4 信号传导交叉与植物中胁迫信号的分析第28-29页
  2.盐胁迫下植物转录因子的调节第29-31页
  3.植物耐盐相关的效应子基因第31-34页
   3.1 植物细胞的离子均衡和离子区隔化第31-32页
   3.2 其它的盐及干旱应答基因第32-34页
    3.2.1 渗透保护物质第33页
    3.2.2 自由基清除酶类第33页
    3.2.3 LEA蛋白和热激蛋白第33-34页
  4.实时荧光定量PCR第34-39页
   4.1 实时定量PCR技术的原理及应用第35-37页
    4.1.1 实时定量PCR技术第35-36页
     4.1.1.1 荧光阈值、C_T值第35-36页
     4.1.1.2 荧光探针和荧光染料第36页
    4.1.2 实时定量PCR的技术优势及应用第36-37页
   4.2 实时荧光定量PCR数据的分析第37-38页
    4.2.1 实时荧光定量PCR数据分析的方法第37页
    4.2.2 2~(-△△CT)方法与相对基因表达差异的分析第37-38页
   4.3 ABI Prism 7700实时荧光定量PCR仪第38-39页
  5.实时定量PCR应用于拟南芥转录因子表达水平的检测第39-40页
 第三章:盐芥盐敏感突变体的筛选第40-43页
  1.正向遗传学及其意义第40页
  2.突变体的创制方法及突变频率第40页
  3.诱变剂的诱变机理第40-41页
  4.突变体的类型第41-42页
  5.创制盐芥EMS诱变突变体的意义第42-43页
 第四章:植物分子生物学研究方法和展望第43-44页
第二部分:实验论文第44-95页
 第一章:盐芥SOS1、SOS2、SOS3和p5CS的基因沉默研究第44-60页
  1.实验设计思路和意义第44页
  2.材料和方法第44-51页
   2.1 实验材料及仪器第44-45页
   2.2 实验方法第45-51页
    2.2.1 大肠杆菌电极转化用感受态细胞的制备第45-46页
    2.2.2 大肠杆菌和农杆菌感受态细胞的电极转化第46页
    2.2.3 农杆菌电极转化用感受态细胞的制备第46页
    2.2.4 QIAprep Spin Miniprep Kit方法的质粒提取第46页
    2.2.5 QIAquick PCR Purification Kit方法纯化PCR产物第46-47页
    2.2.6 质粒载体及基因PCR产物的双酶切及连接反应第47页
    2.2.7 QIAquick Gel Extraction Kit方法从琼脂糖凝胶中回收DNA片段第47-48页
    2.2.8 测序第48页
    2.2.9 保存菌种第48页
    2.2.10 SOS1,SOS2,SOS3,p5CS基因沉默载体的构建第48-49页
    2.2.11 盐芥及转化用农杆菌的准备第49页
    2.2.12 Floral dip法转化盐芥第49页
    2.2.13 FINALE除草剂筛选抗性植株第49-50页
    2.2.14 植物基因组DNA的提取第50页
    2.2.15 RNeasy Mini Kit方法的植物总RNA提取第50-51页
    2.2.16 SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因的表达模式分析第51页
  3.实验结果及分析第51-58页
   3.1 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因用于构建RNAi的基因序列第51-52页
   3.2 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因沉默载体构建的结果第52-56页
    3.2.1 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS构建RNAi的基因片断获得第52页
    3.2.2 pGSA1252载体部分序列示RNAi的构建及检测的设计第52-53页
    3.2.3 农杆菌中盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因沉默构建的鉴定第53-55页
    3.2.4 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS的RNAi构建示意图第55页
    3.2.5 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS沉默构建的质粒测序第55-56页
   3.3 SOS1,SOS2,SOS3和p5CS在盐芥中基因沉默的结果第56-58页
    3.3.1 除草剂FINALE筛选盐芥Basta抗性苗第56页
    3.3.2 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因沉默抗性苗的分子鉴定第56-58页
   3.4 盐芥SOS1,SOS2,SOS3和p5CS基因在盐胁迫和对照条件下的表达分析第58页
  4.讨论第58-59页
   4.1 转录后基因沉默第58页
   4.2 盐芥作为新的耐盐模式植物及高效的Bar基因筛选方法第58页
   4.3 后续工作第58-59页
  5.附图:pGSA1252第59-60页
 第二章:盐芥和拟南芥中盐诱导相关基因的表达分析第60-90页
  1.实验设计思路和意义第60页
  2.材料和方法第60-63页
   2.1 实验材料及仪器第60-61页
   2.2 实验方法第61-63页
    2.2.1 盐芥植物材料的种植及处理第61页
    2.2.2 RNeasy Mini Kit方法的植物总RNA提取第61-62页
    2.2.3 RNA的定量第62页
    2.2.4 RNA的反转录及cDNA模板的稀释第62页
    2.2.5 实时定量PCR引物的设计第62页
    2.2.6 实时定量PCR第62-63页
  3.实验结果及分析第63-86页
   3.1 盐芥和拟南芥的RNA提取和定量第63页
   3.2 盐芥和拟南芥的实时定量PCR的cDNA模板制备第63页
   3.3 盐芥和拟南芥中盐诱导相关基因的实时定量PCR表达分析第63-86页
    3.3.1 盐胁迫下植物中磷酸蛋白的表达分析第64-67页
    3.3.2 盐胁迫下植物转录因子的表达分析第67-75页
    3.3.3 ABA合成相关基因的盐诱导表达分析第75-76页
    3.3.4 盐胁迫下植物离子区隔化相关基因的表达分析第76-79页
    3.3.5 盐胁迫下植物渗透保护物质合成相关基因的表达分析第79-81页
    3.3.6 盐胁迫下植物自由基清除相关基因的表达分析第81-82页
    3.3.7 热激蛋白和LEA蛋白的盐诱导表达分析第82-84页
    3.3.8 其它盐应答基因的盐诱导表达分析第84-86页
  4.讨论第86-90页
   4.1 实时定量PCR技术第86页
   4.2 盐芥和拟南芥中盐诱导相关基因表达分析的意义及存在的问题第86-87页
   4.3 盐芥和拟南芥中盐诱导相关基因的盐诱导表达分析的结果第87-89页
   4.4 后续工作第89-90页
 第三章:盐芥盐敏感突变体的筛选第90-95页
  1.实验设计思路和意义第90页
  2.材料第90-94页
   2.1 实验材料及仪器第90页
   2.2 实验方法和结果第90-94页
    2.2.1 盐芥种子的EMS诱变第90-91页
    2.2.2 盐芥种子的无菌种植第91页
    2.2.3 盐芥盐敏感突变体的筛选第91-94页
     2.2.3.1 盐芥盐敏感突变体筛选的最适盐浓度的确定第91页
     2.2.3.2 盐芥盐敏感突变体的筛选第91-94页
     2.2.3.3 推测的盐芥盐敏感突变体的进一步鉴定第94页
  3.讨论:盐芥EMS诱变筛选盐敏感突变体的意义第94-95页
参考文献第95-107页
博士期间发表的论文第107-108页
致谢第108页

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