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细菌转座子Tn5gusA5在野油菜黄单胞菌8004中转座规律分析及生物学验证

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-7页
第一章 前言第7-19页
   ·细菌转座子的分类与转座机理第7-13页
     ·细菌转座子的分类第7-8页
     ·细菌转座子Tn5第8页
     ·Tn5的转座机理第8-9页
     ·转座酶的结构第9-10页
     ·DDE模体第10-11页
     ·转座频率调控第11-13页
   ·转座子热点及其研究现状第13-14页
     ·转座热点第13页
     ·转座子Tn5转座热点研究进展第13-14页
   ·Tn5gusA5第14-15页
   ·野油菜黄单胞菌分子遗传学研究概况第15-16页
     ·野油菜黄单胞菌概述第15-16页
     ·Xcc 8004基因组注释概况第16页
   ·Xcc Tn5gusA5插入突变体库的构建第16-17页
   ·本研究工作的目的、内容及意义第17-19页
     ·目的与内容第17-18页
     ·意义第18-19页
第二章 材料与方法第19-29页
   ·材料第19-22页
     ·本实验所用菌株和质粒第19-20页
     ·培养基及生长条件第20-21页
     ·抗菌素及其贮存,使用浓度第21页
     ·溶液与缓冲液第21-22页
   ·方法第22-29页
     ·构建Xcc Tn5gusA5插入突变体库第22-26页
     ·PCR反应第26页
     ·质粒的提取第26-27页
     ·限制性酶切和DNA连接第27页
     ·感受态细胞的制备和转化第27-28页
     ·总DNA的提取第28页
     ·计算机资源第28-29页
第三章 结果与分析第29-59页
   ·Xcc Tn5gusA5插入突变体库第29-30页
     ·利用pLAFR1::Tn5gusA5诱变获得Tn5gusA5插入Xcc 8004突变体的策略第29页
     ·Xcc 8004突变体库基本概况第29-30页
   ·Tn5gusA转座特异性分析第30-53页
     ·Tn5gusA5插入密度同GC含量的关系第30-42页
     ·Tn5gusA5靶序列碱基特异性分析第42-49页
     ·Tn5gusA5插入密度同转录的关系第49-51页
     ·在同一位点有多个插入的情况分析第51-52页
     ·Tn5gusA5插入方向分析第52-53页
     ·Tn5gusA5的IE和0E同Xcc 8004基因组DNA序列的比较第53页
   ·生物学方法验证Tn5gusA5倾向于插入相对低GC含量区第53-59页
     ·质粒pL77的构建第53-54页
     ·出发菌株的获得第54页
     ·筛选DH5α/pL77::Tn5gusA5第54-59页
第四章 讨论第59-62页
   ·关于Xcc突变体库的构建第59页
   ·关于Tn5gusA5转座的规律第59-60页
     ·Tn5gusA5对靶位点的选择同靶DNA GC含量之间的关系第59页
     ·Tn5gusA5靶位点的选择同靶DNA转录的关系第59-60页
     ·Tn5gusA5的靶序列特异性第60页
   ·关于生物学验证第60-61页
   ·总结第61-62页
参考文献第62-66页
附录1: 程序第66-84页
附录2: 质粒pL77序列及Tn5gusA5插入方向位置和各位点的各碱基出现的频数第84-87页
致谢第87页

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