摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-7页 |
第一章 前言 | 第7-19页 |
·细菌转座子的分类与转座机理 | 第7-13页 |
·细菌转座子的分类 | 第7-8页 |
·细菌转座子Tn5 | 第8页 |
·Tn5的转座机理 | 第8-9页 |
·转座酶的结构 | 第9-10页 |
·DDE模体 | 第10-11页 |
·转座频率调控 | 第11-13页 |
·转座子热点及其研究现状 | 第13-14页 |
·转座热点 | 第13页 |
·转座子Tn5转座热点研究进展 | 第13-14页 |
·Tn5gusA5 | 第14-15页 |
·野油菜黄单胞菌分子遗传学研究概况 | 第15-16页 |
·野油菜黄单胞菌概述 | 第15-16页 |
·Xcc 8004基因组注释概况 | 第16页 |
·Xcc Tn5gusA5插入突变体库的构建 | 第16-17页 |
·本研究工作的目的、内容及意义 | 第17-19页 |
·目的与内容 | 第17-18页 |
·意义 | 第18-19页 |
第二章 材料与方法 | 第19-29页 |
·材料 | 第19-22页 |
·本实验所用菌株和质粒 | 第19-20页 |
·培养基及生长条件 | 第20-21页 |
·抗菌素及其贮存,使用浓度 | 第21页 |
·溶液与缓冲液 | 第21-22页 |
·方法 | 第22-29页 |
·构建Xcc Tn5gusA5插入突变体库 | 第22-26页 |
·PCR反应 | 第26页 |
·质粒的提取 | 第26-27页 |
·限制性酶切和DNA连接 | 第27页 |
·感受态细胞的制备和转化 | 第27-28页 |
·总DNA的提取 | 第28页 |
·计算机资源 | 第28-29页 |
第三章 结果与分析 | 第29-59页 |
·Xcc Tn5gusA5插入突变体库 | 第29-30页 |
·利用pLAFR1::Tn5gusA5诱变获得Tn5gusA5插入Xcc 8004突变体的策略 | 第29页 |
·Xcc 8004突变体库基本概况 | 第29-30页 |
·Tn5gusA转座特异性分析 | 第30-53页 |
·Tn5gusA5插入密度同GC含量的关系 | 第30-42页 |
·Tn5gusA5靶序列碱基特异性分析 | 第42-49页 |
·Tn5gusA5插入密度同转录的关系 | 第49-51页 |
·在同一位点有多个插入的情况分析 | 第51-52页 |
·Tn5gusA5插入方向分析 | 第52-53页 |
·Tn5gusA5的IE和0E同Xcc 8004基因组DNA序列的比较 | 第53页 |
·生物学方法验证Tn5gusA5倾向于插入相对低GC含量区 | 第53-59页 |
·质粒pL77的构建 | 第53-54页 |
·出发菌株的获得 | 第54页 |
·筛选DH5α/pL77::Tn5gusA5 | 第54-59页 |
第四章 讨论 | 第59-62页 |
·关于Xcc突变体库的构建 | 第59页 |
·关于Tn5gusA5转座的规律 | 第59-60页 |
·Tn5gusA5对靶位点的选择同靶DNA GC含量之间的关系 | 第59页 |
·Tn5gusA5靶位点的选择同靶DNA转录的关系 | 第59-60页 |
·Tn5gusA5的靶序列特异性 | 第60页 |
·关于生物学验证 | 第60-61页 |
·总结 | 第61-62页 |
参考文献 | 第62-66页 |
附录1: 程序 | 第66-84页 |
附录2: 质粒pL77序列及Tn5gusA5插入方向位置和各位点的各碱基出现的频数 | 第84-87页 |
致谢 | 第87页 |