中文摘要 | 第10-12页 |
ABSTRACT | 第12-14页 |
第一章 文献综述 | 第16-20页 |
1.1 串珠藻科植物简介 | 第16页 |
1.2 3个叶绿体基因简介 | 第16-17页 |
1.3 适应性进化研究方法概述 | 第17-18页 |
1.4 共进化分析概述 | 第18页 |
1.5 研究的目的和意义 | 第18-20页 |
第二章 串珠藻科植物rbcL基因的适应性进化及共进化分析 | 第20-38页 |
2.1 材料和方法 | 第20-22页 |
2.1.1 实验序列数据 | 第20-21页 |
2.1.2 基于rbcL基因的系统发育树构建 | 第21页 |
2.1.3 适应性进化分析 | 第21-22页 |
2.1.4 三维结构建模 | 第22页 |
2.1.5 共进化分析 | 第22页 |
2.2 结果与分析 | 第22-34页 |
2.2.1 系统发育分析 | 第22-24页 |
2.2.2 正选择位点鉴定 | 第24-27页 |
2.2.3 正选择位点定位 | 第27-29页 |
2.2.4 共进化位点鉴定 | 第29-34页 |
2.3 讨论 | 第34-36页 |
2.4 小结 | 第36-38页 |
第三章 串珠藻科植物psaA基因的适应性进化及共进化分析 | 第38-54页 |
3.1 材料和方法 | 第38-40页 |
3.1.1 实验序列数据 | 第38-40页 |
3.1.2 基于psaA基因的系统发育树构建 | 第40页 |
3.1.3 适应性进化分析 | 第40页 |
3.1.4 三维结构建模 | 第40页 |
3.1.5 共进化分析 | 第40页 |
3.2 结果与分析 | 第40-51页 |
3.2.1 系统发育分析 | 第40-42页 |
3.2.2 正选择位点鉴定 | 第42-46页 |
3.2.3 psaA基因参考三维结构 | 第46-47页 |
3.2.4 共进化位点鉴定 | 第47-51页 |
3.3 讨论 | 第51-53页 |
3.4 小结 | 第53-54页 |
第四章 串珠藻科植物psbA基因的适应性进化及共进化分析 | 第54-68页 |
4.1 材料和方法 | 第54-56页 |
4.1.1 实验序列数据 | 第54-55页 |
4.1.2 基于psaA基因的系统发育树构建 | 第55页 |
4.1.3 适应性进化分析 | 第55-56页 |
4.1.4 三维结构建模 | 第56页 |
4.1.5 共进化分析 | 第56页 |
4.2 实验结果与分析 | 第56-63页 |
4.2.1 系统发育分析 | 第56-59页 |
4.2.2 正选择位点鉴定 | 第59-62页 |
4.2.3 psbA基因参考三维结构 | 第62-63页 |
4.2.4 共进化位点鉴定 | 第63页 |
4.3 讨论 | 第63-66页 |
4.4 小结 | 第66-68页 |
第五章 结论 | 第68-70页 |
参考文献 | 第70-77页 |
攻读学位期间取得的研究成果 | 第77-78页 |
致谢 | 第78-79页 |
个人简况及联系方式 | 第79-80页 |