| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 第1章 文献综述 | 第9-21页 |
| 1.1 土壤微生物多样性 | 第9-12页 |
| 1.1.1 土壤微生物物种多样性 | 第9-10页 |
| 1.1.2 微生物遗传多样性 | 第10页 |
| 1.1.3 功能多样性 | 第10-11页 |
| 1.1.4 土壤微生物生态类型的多样性 | 第11-12页 |
| 1.2 土壤微生物多样性的研究方法 | 第12-15页 |
| 1.2.1 平板培养法 | 第12页 |
| 1.2.2 Biology微平板法 | 第12-13页 |
| 1.2.3 磷脂脂肪酸法（PLFA） | 第13页 |
| 1.2.4 末端限制性长度多态性技术 | 第13-14页 |
| 1.2.5 变性梯度凝胶电泳 | 第14页 |
| 1.2.6 高通量测序技术 | 第14-15页 |
| 1.3 石油污染土壤的影响 | 第15-16页 |
| 1.3.1 石油污染物对土壤理化性质的影响 | 第15页 |
| 1.3.2 石油污染物对土壤微生物群落的影响 | 第15页 |
| 1.3.3 石油污染物对陆生植物的影响 | 第15-16页 |
| 1.4 微生物修复石油污染土壤的方法 | 第16-17页 |
| 1.4.1 生物刺激法 | 第16页 |
| 1.4.2 生物强化法 | 第16页 |
| 1.4.3 固定化微生物技术 | 第16-17页 |
| 1.4.4 植物-微生物联用技术 | 第17页 |
| 1.5 微生物次级代谢产物 | 第17-19页 |
| 1.5.1 抑菌活性 | 第17-18页 |
| 1.5.2 抗肿瘤活性 | 第18-19页 |
| 1.5.3 免疫抑制 | 第19页 |
| 1.6 本文的研究意义和研究内容 | 第19-21页 |
| 1.6.1 研究意义 | 第19-20页 |
| 1.6.2 研究内容 | 第20-21页 |
| 第2章 材料与方法 | 第21-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.1.1 实验设备 | 第21-22页 |
| 2.1.2 实验试剂 | 第22页 |
| 2.1.3 培养基 | 第22页 |
| 2.2 大港油田地理条件和土壤采集 | 第22-23页 |
| 2.2.1 大港油田自然地理条件 | 第22-23页 |
| 2.2.2 样品采集和土壤处理 | 第23页 |
| 2.3 土壤理化性质测定 | 第23-24页 |
| 2.3.1 土壤含油量测定 | 第23页 |
| 2.3.2 土壤含水量测定 | 第23页 |
| 2.3.3 土壤pH测定 | 第23-24页 |
| 2.3.4 土壤电导率的测定 | 第24页 |
| 2.3.5 土壤中有机质含量的测定 | 第24页 |
| 2.3.6 土壤中全氮的测定 | 第24页 |
| 2.3.7 土壤中总磷含量的测定 | 第24页 |
| 2.3.8 土壤中总钾的测定 | 第24页 |
| 2.4 扩增子测序流程 | 第24-27页 |
| 2.4.1 土壤微生物基因组DNA提取 | 第24-25页 |
| 2.4.2 PCR扩增 | 第25页 |
| 2.4.3 PCR产物纯化 | 第25-26页 |
| 2.4.4 文库构建和上机测序 | 第26页 |
| 2.4.5 生物信息分析流程 | 第26页 |
| 2.4.6 宏基因组KEGG数据库标准注释过程 | 第26-27页 |
| 2.5 细菌次级代谢产物研究 | 第27-29页 |
| 2.5.1 土壤样品菌悬液制备 | 第27页 |
| 2.5.2 菌悬液中细菌分离 | 第27页 |
| 2.5.3 种子液制备 | 第27页 |
| 2.5.4 发酵液制备 | 第27页 |
| 2.5.5 HPLC液相检测和制备 | 第27-28页 |
| 2.5.6 抗菌活性测定（牛津杯法） | 第28-29页 |
| 第3章 大港油田不同生境细菌 16S r RNA基因多样性的研究 | 第29-53页 |
| 3.1 土壤石油含量(TPH)测定结果 | 第29-31页 |
| 3.2 大港油田土壤物种注释结果 | 第31-35页 |
| 3.2.1 物种注释结果统计 | 第31-32页 |
| 3.2.2 特定物种分类树 | 第32-35页 |
| 3.3 大港油田土壤各分类水平下细菌群落相对丰度柱状图 | 第35-40页 |
| 3.3.1 门分类水平细菌群落组成 | 第35-37页 |
| 3.3.2 纲分类水平细菌群落组成 | 第37-38页 |
| 3.3.3 属分类水平细菌群落组成 | 第38-40页 |
| 3.4 Heatmap热图分析 | 第40-42页 |
| 3.5 样品复杂度分析（Alpha Diversity） | 第42-47页 |
| 3.5.1 Alpha多样性指数 | 第42-43页 |
| 3.5.2 物种多样性曲线 | 第43-45页 |
| 3.5.3 物种累积箱型图 | 第45-46页 |
| 3.5.4 Venn图 | 第46-47页 |
| 3.6 多样品比较分析（Beta Diversity） | 第47-51页 |
| 3.6.1 NMDS | 第47-48页 |
| 3.6.2 Anosim | 第48-49页 |
| 3.6.3 LEf Se分析 | 第49-51页 |
| 3.7 讨论 | 第51-53页 |
| 第4章 大港油田土壤理化性质对菌群分布的影响 | 第53-67页 |
| 4.1 环境因子与土壤中细菌群落分布的相关分析 | 第53-59页 |
| 4.1.1 26样品表土壤理化性质测定结果及分析 | 第53-54页 |
| 4.1.2 土壤各个环境因子间相关性分析 | 第54-55页 |
| 4.1.3 Spearman相关性分析 | 第55-57页 |
| 4.1.4 Spearman相关性分析热图 | 第57-58页 |
| 4.1.5 Mental test分析 | 第58-59页 |
| 4.2 RDA分析 | 第59-61页 |
| 4.3 PCo A分析 | 第61-63页 |
| 4.4 VPA分析 | 第63-64页 |
| 4.5 讨论 | 第64-67页 |
| 第5章 大港油田滨海土壤来源细菌次级代谢产物的研究 | 第67-81页 |
| 5.1 宏基因组KEGG数据库标准注释 | 第67-69页 |
| 5.1.1 土壤细菌代谢通路热图（第三等级） | 第67-68页 |
| 5.1.2 土壤细菌代谢通路（第三等级）柱形图 | 第68-69页 |
| 5.2 大港油田土壤中可培养细菌的分离以及抗生素产生菌的筛选 | 第69-71页 |
| 5.3 LWYZ003菌株多相分类鉴定 | 第71-73页 |
| 5.3.1 分子生物学鉴定 | 第71-72页 |
| 5.3.2 微生物表型鉴定与生理生化鉴定： | 第72-73页 |
| 5.4 解淀粉芽孢杆菌LWYZ003次级代谢产物中抗生素的分离鉴定 | 第73-78页 |
| 5.4.1 抗菌活性物质的分离纯化 | 第73-74页 |
| 5.4.2 物质结构鉴定： | 第74-76页 |
| 5.4.3 次级代谢产物抑菌活性： | 第76-78页 |
| 5.5 讨论 | 第78-81页 |
| 第6章 结论与展望 | 第81-83页 |
| 6.1 结论 | 第81-82页 |
| 6.2 展望 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-89页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第89-91页 |
| 致谢 | 第91页 |
