| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 符号与缩略语说明 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 1 土壤微生物简介 | 第12页 |
| 2 生物大分子 | 第12-16页 |
| 2.1 DNA | 第13-15页 |
| 2.2 RNA | 第15页 |
| 2.3 蛋白质 | 第15-16页 |
| 3 土壤微生物总RNA提取方法概述 | 第16-20页 |
| 3.1 Trizol试剂快速提取法 | 第16-17页 |
| 3.2 CTAB试剂法 | 第17-18页 |
| 3.3 SDS-phenol法 | 第18页 |
| 3.4 酶裂解法 | 第18-19页 |
| 3.5 常用的土壤RNA提取试剂盒 | 第19-20页 |
| 4 本论文研究目的、内容及意义 | 第20-22页 |
| 4.1 研究目的及意义 | 第20页 |
| 4.2 研究内容 | 第20-21页 |
| 4.3 研究的技术路线 | 第21-22页 |
| 第二章 实验材料、仪器和方法 | 第22-30页 |
| 1 实验材料 | 第22-24页 |
| 1.1 研究区域概况 | 第22页 |
| 1.2 样品采集与保存 | 第22页 |
| 1.3 菌种及培养基 | 第22页 |
| 1.4 试剂盒及试剂 | 第22-24页 |
| 2 实验仪器及试剂配制 | 第24-26页 |
| 2.1 实验仪器 | 第24-25页 |
| 2.2 常用试剂配置 | 第25-26页 |
| 3 常用实验方法 | 第26-30页 |
| 3.1 琼脂糖凝胶电泳 | 第26页 |
| 3.2 核酸型紫外分光光度计测定RNA的纯度和浓度 | 第26-27页 |
| 3.3 目的片段的胶回收 | 第27-28页 |
| 3.4 土壤RNA提取过程中常见问题 | 第28-30页 |
| 第三章 土壤微生物总RNA提取条件优化及质量鉴定 | 第30-50页 |
| 1 Trizol法总RNA提取研究 | 第30-33页 |
| 1.1 Trizol法提取壤土中微生物总RNA | 第30-31页 |
| 1.2 Trizol法提取大肠杆菌总RNA | 第31页 |
| 1.3 Trizol法提取拟南芥叶片总RNA | 第31页 |
| 1.4 结果与分析 | 第31-33页 |
| 2 CTAB-SDS法土壤微生物总RNA提取研究 | 第33-36页 |
| 2.1 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1) pH为8.0提取土壤微生物总RNA | 第34页 |
| 2.2 酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)pH为4.5提取土壤微生物总RNA | 第34页 |
| 2.3 CTAB-SDS法提取总RNA时间优化 | 第34页 |
| 2.4 结果与分析 | 第34-36页 |
| 3 Omega试剂盒法三种土壤微生物总RNA提取研究 | 第36-38页 |
| 3.1 E.Z.N.A RNA Soil Kit提取土壤微生物总RNA | 第36-37页 |
| 3.2 结果与分析 | 第37-38页 |
| 4 CTAB-SDS优化法三种土壤微生物总RNA提取研究 | 第38-41页 |
| 4.1 CTAB-SDS优化法提取三种土壤微生物总RNA | 第38-39页 |
| 4.2 结果与分析 | 第39-41页 |
| 5 RT-PCR验证RNA完整性 | 第41-45页 |
| 5.1 CTAB-SDS优化法提取土壤微生物总RNA | 第41页 |
| 5.2 去除RNA中的DNA污染 | 第41页 |
| 5.3 cDNA一条链的合成 | 第41-42页 |
| 5.4 细菌16S基因扩增 | 第42-43页 |
| 5.5 cbbM基因扩增 | 第43-44页 |
| 5.6 结果与分析 | 第44-45页 |
| 6 数据分析 | 第45-47页 |
| 7 讨论 | 第47-48页 |
| 8 本章小结 | 第48-50页 |
| 第四章 在DNA和cDNA水平上对比研究三种典型土壤的细菌多样性 | 第50-64页 |
| 1 材料与方法 | 第50-53页 |
| 1.1 试验地概况及土壤采集 | 第50页 |
| 1.2 实验设计 | 第50-51页 |
| 1.3 土壤总DNA的提取 | 第51-52页 |
| 1.4 土壤总RNA的提取 | 第52页 |
| 1.5 cDNA合成 | 第52页 |
| 1.6 土壤细菌cbbM基因Illumina MiSeq测序分析 | 第52-53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-62页 |
| 2.1 三种土壤细菌群落多样性分析 | 第53-55页 |
| 2.2 三种土壤细菌群落组成的系统发育分析 | 第55-62页 |
| 3 讨论 | 第62页 |
| 4 本章小结 | 第62-64页 |
| 全文总结 | 第64-66页 |
| 创新之处 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
