植物选择性多聚腺苷化分析与可视化平台搭建
摘要 | 第4-6页 |
abstract | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第12-18页 |
1.1 本文的研究背景 | 第12-14页 |
1.2 研究现状及意义 | 第14-16页 |
1.3 本文的章节安排 | 第16-18页 |
第二章 分析与可视化平台的总体设计 | 第18-28页 |
2.1 平台架构设计 | 第18-20页 |
2.2 平台模块设计 | 第20-22页 |
2.3 平台数据处理方法 | 第22-28页 |
2.3.1 序列和基因组注释文件处理 | 第22-23页 |
2.3.2 poly(A)位点的提取 | 第23-24页 |
2.3.3 选择性多聚腺苷化处理 | 第24-28页 |
第三章 分析与可视化平台的开发技术 | 第28-36页 |
3.1 平台的MVC设计模式 | 第28-29页 |
3.2 基于html5的canvas绘图 | 第29-30页 |
3.3 jQuery和Ajax | 第30-32页 |
3.4 会话控制Session | 第32-33页 |
3.5 基因组浏览器Jbrowse | 第33-36页 |
第四章 分析与可视化平台的实现 | 第36-58页 |
4.1 平台的组织形式 | 第36-42页 |
4.1.1 平台的功能简介 | 第36-38页 |
4.1.2 平台的数据构成 | 第38-42页 |
4.2 平台的模块实现 | 第42-58页 |
4.2.1 平台的开发环境 | 第42-43页 |
4.2.2 数据输入模块实现 | 第43-47页 |
4.2.3 数据输出模块实现 | 第47-48页 |
4.2.4 数据处理模块实现 | 第48-51页 |
4.2.5 数据查询模块实现 | 第51-54页 |
4.2.6 数据可视化模块实现 | 第54-55页 |
4.2.7 数据分离及状态保存模块实现 | 第55-58页 |
第五章 Poly(A)位点的检索、分析与可视化 | 第58-72页 |
5.1 数据查询测试 | 第58-60页 |
5.2 用户数据上传处理测试 | 第60-63页 |
5.3 数据分析测试 | 第63-65页 |
5.4 数据可视化测试 | 第65-72页 |
第六章 总结与展望 | 第72-74页 |
参考文献 | 第74-78页 |
攻读硕士期间发表论文 | 第78-80页 |
致谢 | 第80-81页 |