| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 缩略词 | 第13-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-18页 |
| 1.1 盐场微生物研究概况 | 第15-16页 |
| 1.2 多梯度太阳能盐池介绍 | 第16页 |
| 1.3 盐度与微生物群落结构的关系 | 第16-17页 |
| 1.4 立项依据 | 第17-18页 |
| 第二章 文登盐场嗜盐菌菌种资源采集及多样性分析 | 第18-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第18-19页 |
| 2.1.1 样品 | 第18-19页 |
| 2.1.2 培养基与溶液 | 第19页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第19页 |
| 2.1.4 主要实验仪器 | 第19页 |
| 2.2 实验方法 | 第19-22页 |
| 2.2.1 样品处理 | 第19-20页 |
| 2.2.2 样品稀释涂布与培养 | 第20页 |
| 2.2.3 菌落的统计与分离纯化 | 第20页 |
| 2.2.4 基于16S rRNA基因的菌株鉴定 | 第20-22页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第22-32页 |
| 2.3.1 本实验样品概况 | 第22页 |
| 2.3.2 理化因子测序结果 | 第22页 |
| 2.3.3 菌落计数与表型特征挑选 | 第22-23页 |
| 2.3.4 16S rDNA序列Blast比对结果 | 第23-32页 |
| 第三章 基于16S rDNA高通量测序分析的文登盐场细菌和古生菌多样性分析 | 第32-58页 |
| 3.1 ILLUMINA PE250高通量测序 | 第32-33页 |
| 3.1.1 Illumina PE250测序实验流程 | 第32页 |
| 3.1.2 基因组DNA抽提 | 第32-33页 |
| 3.1.3 PCR扩增 | 第33页 |
| 3.1.4 序列分析 | 第33页 |
| 3.2 生物信息分析流程 | 第33-40页 |
| 3.2.1 OTU聚类和物种注释 | 第34页 |
| 3.2.2 样本多样性分析 | 第34-39页 |
| 3.2.3 稀释性曲线 | 第39-40页 |
| 3.3 物种组成分析 | 第40-46页 |
| 3.3.1 群落结构组分图 | 第40-43页 |
| 3.3.2 群落Heatmap图 | 第43-46页 |
| 3.4 组间(样本间)比较分析(B多样性分析) | 第46-53页 |
| 3.4.1 维恩图 | 第46-48页 |
| 3.4.2 PCoA分析 | 第48-51页 |
| 3.4.3 多样本相似度树状图 | 第51-52页 |
| 3.4.4 CCA模型分析 | 第52-53页 |
| 3.5 本章小结 | 第53-58页 |
| 第四章 4个新物种的多相分类学研究 | 第58-77页 |
| 4.1 实验材料 | 第58-60页 |
| 4.1.1 实验菌株 | 第58-59页 |
| 4.1.2 培养基 | 第59页 |
| 4.1.3 主要实验试剂 | 第59页 |
| 4.1.4 主要实验仪器 | 第59-60页 |
| 4.2 实验方法 | 第60-63页 |
| 4.2.1 菌株表型特征与保藏 | 第60页 |
| 4.2.2 菌株生理生化特性的测定 | 第60-61页 |
| 4.2.3 菌株遗传学特征的分析鉴定 | 第61-62页 |
| 4.2.4 菌株化学特征的分析鉴定 | 第62-63页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第63-76页 |
| 4.3.1 沉积物海杆菌(Marinicella sediminis) F2~T的多相分类鉴定 | 第63-67页 |
| 4.3.2 嗜盐盐杆菌(Salibaculum Halophilum) WDS1C4~T和灰黄盐杆菌(Salibaculum grseoflavus) WDS4C29~T的多相分类鉴定 | 第67-72页 |
| 4.3.3 浅红慢生盐场菌(Bradysalinae rhodinum) WFHF3C12~T的多相分类鉴定 | 第72-76页 |
| 4.4 本章小结 | 第76-77页 |
| 全文总结与展望 | 第77-78页 |
| 参考文献 | 第78-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 资助情况 | 第87-88页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第88-89页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第89页 |
