| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 绪论 | 第14-33页 |
| 1.1 湖泊概况 | 第14-16页 |
| 1.1.1 阳澄湖的自然地理 | 第16页 |
| 1.1.2 太湖的自然地理 | 第16页 |
| 1.2 蟹 | 第16-19页 |
| 1.2.1 蟹的历史发展 | 第16-17页 |
| 1.2.2 蟹的生长发育 | 第17-18页 |
| 1.2.3 阳澄湖大闸蟹 | 第18-19页 |
| 1.2.4 太湖螃蟹 | 第19页 |
| 1.3 宏基因组学 | 第19-21页 |
| 1.3.1 宏基因组学 | 第19-20页 |
| 1.3.2 宏基因组技术的应用 | 第20-21页 |
| 1.4 微生物多样性的研究方法 | 第21-30页 |
| 1.4.1 传统分离培养方法 | 第21页 |
| 1.4.2 PCR技术 | 第21-27页 |
| 1.4.2.1 PCR的基本原理 | 第21-24页 |
| 1.4.2.2 PCR反应体系与条件优化 | 第24-27页 |
| 1.4.3 基于 16SrRNA基因的现代分子生物学技术 | 第27-30页 |
| 1.5 选题意义和研究内容 | 第30-33页 |
| 1.5.1 选题意义 | 第30页 |
| 1.5.2 研究内容 | 第30-31页 |
| 1.5.3 技术路线 | 第31-33页 |
| 第二章 不同样品基因组DNA PCR条件优化研究 | 第33-40页 |
| 2.1 引言 | 第33页 |
| 2.2 实验仪器和实验试剂 | 第33页 |
| 2.2.1 实验仪器 | 第33页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第33页 |
| 2.3 实验方法 | 第33-36页 |
| 2.3.1 样品采集 | 第33-34页 |
| 2.3.2 底泥总DNA提取 | 第34页 |
| 2.3.3 水样中总DNA提取 | 第34-35页 |
| 2.3.4 PCR反应体系的优化 | 第35页 |
| 2.3.5 退火温度的优化 | 第35页 |
| 2.3.6 循环次数的优化 | 第35-36页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第36-39页 |
| 2.4.1 不同体系的PCR结果 | 第36-37页 |
| 2.4.2 最佳退火温度优化结果 | 第37-38页 |
| 2.4.3 最佳循环数优化结果 | 第38页 |
| 2.4.4 讨论 | 第38-39页 |
| 2.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第三章 适用于螃蟹肠道基因组DNA提取方法研究 | 第40-46页 |
| 3.1 引言 | 第40-41页 |
| 3.2 实验仪器和实验试剂 | 第41页 |
| 3.2.1 实验仪器 | 第41页 |
| 3.2.2 实验试剂 | 第41页 |
| 3.3 实验方法 | 第41-42页 |
| 3.3.1 样品采集 | 第41页 |
| 3.3.2 Dzup基因组DNA快速抽提试剂盒提取 | 第41页 |
| 3.3.3 动物基因组DNA快速抽提试剂盒提取 | 第41-42页 |
| 3.3.4 细菌 16SrDNA PCR扩增 | 第42页 |
| 3.3.5 统计学分析 | 第42页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第42-45页 |
| 3.4.1 基因组DNA完整性检测 | 第42-43页 |
| 3.4.2 Dzup基因组DNA快速抽提与动物基因组DNA快速抽提试剂盒各自提取的基因组DNA比较 | 第43-44页 |
| 3.4.3 Dzup基因组DNA快速抽提与动物基因组DNA快速抽提试剂盒提取的基因组DNA的PCR扩增产物电泳检测 | 第44页 |
| 3.4.4 讨论 | 第44-45页 |
| 3.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 第四章 不同季节阳澄湖与太湖微生物多样性与群落结构比较研究 | 第46-59页 |
| 4.1 引言 | 第46页 |
| 4.2 实验仪器和实验试剂 | 第46页 |
| 4.2.1 实验仪器 | 第46页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第46页 |
| 4.3 实验方法 | 第46-47页 |
| 4.3.1 不同季节样品采集 | 第46页 |
| 4.3.2 底泥总DNA提取 | 第46-47页 |
| 4.3.3 水样中总DNA提取 | 第47页 |
| 4.3.4 16S rDNA的PCR扩增 | 第47页 |
| 4.3.5 16S rDNA PCR产物的纯化与限制性酶切 | 第47页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第47-58页 |
| 4.4.1 PCR产物扩增结果 | 第47-49页 |
| 4.4.2 酶切图谱分析 | 第49-56页 |
| 4.4.3 阳澄湖与太湖细菌多样性比较分析 | 第56-57页 |
| 4.4.4 讨论 | 第57-58页 |
| 4.5 本章小结 | 第58-59页 |
| 第五章 螃蟹肠道与其生长环境中微生物相关性比较研究 | 第59-65页 |
| 5.1 引言 | 第59页 |
| 5.2 实验仪器和实验试剂 | 第59-60页 |
| 5.2.1 实验仪器 | 第59页 |
| 5.2.2 实验试剂 | 第59-60页 |
| 5.3 实验方法 | 第60页 |
| 5.3.1 样品采集 | 第60页 |
| 5.3.2 螃蟹肠道基因组DNA提取 | 第60页 |
| 5.3.3 16SrDNA PCR扩增 | 第60页 |
| 5.3.4 16S rDNA PCR扩增产物的纯化与限制性酶切 | 第60页 |
| 5.3.5 统计学分析 | 第60页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第60-64页 |
| 5.4.1 不同螃蟹基因组DNA酶切图谱 | 第60-61页 |
| 5.4.2 秋季阳澄湖和太湖底泥水样基因组DNA酶切图谱 | 第61-62页 |
| 5.4.3 不同螃蟹肠道中菌群种类 | 第62页 |
| 5.4.4 秋季阳澄湖和太湖底泥水样中菌群种类和变化 | 第62-63页 |
| 5.4.5 螃蟹肠道与秋季底泥水样中菌群相关性分析 | 第63页 |
| 5.4.6 讨论 | 第63-64页 |
| 5.5 本章小结 | 第64-65页 |
| 第六章 结论 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 作者简历 | 第76页 |
