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猪miR-378序列多态性的遗传效应分析

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
符号说明第9-13页
1 文献综述第13-27页
    1.1 microRNA (miRNA)的研究进展第13-22页
        1.1.1 miRNA的发现与命名第13-14页
        1.1.2 miRNA的生物加工过程第14-17页
        1.1.3 miRNA的作用机制第17-18页
        1.1.4 miRNA靶基因的识别和鉴定方法第18-20页
        1.1.5 家猪miRNA研究进展第20-22页
    1.2 miRNA基因遗传变异与表型变异第22-24页
        1.2.1 miRNA基因的保守性及遗传变异第22-23页
        1.2.2 miRNA基因遗传变异与人类疾病及动物表型变异第23-24页
        1.2.3 miRNA基因遗传变异与进化第24页
    1.3 miR-378研究进展第24-27页
        1.3.1 miR-378的发现和命名第24-25页
        1.3.2 miR-378的组织表达分布与功能第25-26页
        1.3.3 猪miR-378的研究现状第26-27页
    1.4 研究内容与目的意义第27页
2 材料和方法第27-49页
    2.1 试验材料第27-31页
        2.1.1 试验动物第27-28页
        2.1.2 样品采集第28页
        2.1.3 实验菌株、质粒和细胞系的来源第28页
        2.1.4 主要仪器设备第28-29页
        2.1.5 主要试剂及配制第29-31页
    2.2 试验方法第31-49页
        2.2.1 基因组DNA的提取第31-32页
        2.2.2 基因多态性分析第32-33页
        2.2.3 Pre-miR-378-2二级结构及其自由能预测第33页
        2.2.4 Pri-miRNA表达载体的构建第33-39页
        2.2.5 双荧光素酶报告载体的构建第39-40页
        2.2.6 细胞培养第40-41页
        2.2.7 细胞转染第41-43页
        2.2.8 3T3-L1前脂肪细胞分化第43页
        2.2.9 细胞总RNA的抽提第43-44页
        2.2.10 qRT-PCR第44-46页
        2.2.11 miR-378W/M靶基因预测第46页
        2.2.12 miR-378W/M靶基因功能富集分析第46-47页
        2.2.13 双荧光素酶报告实验第47-48页
        2.2.14 RNA-pull down试验第48-49页
        2.2.15 油红O染色定量第49页
    2.3 数据处理方法第49页
        2.3.1 qRT-PCR数据处理第49页
        2.3.2 双荧光素酶报告实验数据处理第49页
3 试验结果与分析第49-71页
    3.1 ssc-miR-378-2序列分析结果第49-52页
        3.1.1 猪基因组DNA提取结果第49-50页
        3.1.2 miR-378-2序列PCR扩增结果第50页
        3.1.3 ssc-miR-378-2基因突变检测结果第50-51页
        3.1.4 miR-378物种间保守性分析结果第51-52页
    3.2 Pre-miR-378-2W/M的二级结构和自由能分析结果第52-53页
        3.2.1 Pre-miR-378-2W/M二级结构的预测结果第52页
        3.2.2 Pre-miR-378-2W/M自由能的预测结果第52-53页
    3.3 miR-378-2突变对其表达量差异分析结果第53-57页
        3.3.1 Pri-miR-378-2W/M过表达载体构建结果第53-55页
        3.3.2 miR-378-2W/M过表达载体的表达量分析结果第55-57页
    3.4 miR-378W/M靶基因预测及功能富集分析结果第57-64页
        3.4.1 miR-378W/M靶基因预测分析结果第57-59页
        3.4.2 miR-378W/M靶基因功能富集分析结果第59-64页
    3.5 靶基因验证第64-68页
        3.5.1 双荧光素酶报告试验验证结果第64-68页
        3.5.2 RNA-pull down试验验证结果第68页
    3.6 miR-378突变对3T3-L1前脂肪细胞分化的影响第68-71页
        3.6.1 3T3-L1前脂肪细胞的转染效率第68-69页
        3.6.2 油红O检测脂肪细胞中脂质沉积结果第69-70页
        3.6.3 miR-378突变对脂肪细胞分化和分解相关基因表达的影响第70-71页
4 讨论第71-74页
    4.1 miR-378-2序列突变的品种特异性第71-72页
    4.2 miR-378-2序列突变对其二级结构和表达量的影响第72页
    4.3 miR-378种子序列+5A>G突变对靶基因识别和功能富集通路的影响第72-73页
    4.4 miR-378种子序列+5A>G突变对脂肪细胞分化和脂质沉积的影响第73-74页
5 结论第74-75页
参考文献第75-84页
致谢第84-85页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第85页

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