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远志鲨烯环氧酶基因克隆及其转录组研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
符号说明第9-14页
前言第14-16页
第一章 远志鲨烯环氧酶基因的克隆及序列分析研究第16-50页
    材料与方法第16-33页
        1 实验材料第16-17页
            1.1 植物材料第16页
            1.2 菌株和载体第16页
            1.3 酶和试剂第16页
            1.4 培养基类型第16-17页
            1.5 仪器及设备第17页
        2 实验方法第17-33页
            2.1 远志根总RNA的提取第17-19页
            2.2 cDNA第一链的合成第19-20页
            2.3 引物设计与合成第20-21页
            2.4 远志鲨烯环氧酶基因核心片段扩增第21-22页
            2.5 远志鲨烯环氧酶基因5'RACE扩增第22-26页
            2.6 远志鲨烯环氧酶基因3'RACE扩增第26-29页
            2.7 远志鲨烯环氧酶基因cDNA全长扩增第29-32页
            2.8 远志鲨烯环氧酶基因生物信息学分析第32-33页
    结果与讨论第33-48页
        1 远志总RNA的提取及质量检测第33页
        2 远志鲨烯环氧酶基因核心片段扩增与分析第33-35页
        3 远志鲨烯环氧酶基因5'RACE扩增与分析第35-36页
        4 远志鲨烯环氧酶基因3'RACE扩增与分析第36-37页
        5 远志鲨烯环氧酶基因全长序列拼接第37页
        6 远志鲨烯环氧酶基因全长序列扩增与分析第37-38页
        7 远志鲨烯环氧酶基因生物信息学分析第38-48页
            7.1 ORF分析及BLAST分析第38-41页
            7.2 蛋白基本理化性质及结构功能预测第41-45页
            7.3 ClustalX多重序列比对及系统进化树分析第45-48页
    小结第48-50页
第二章 鲨烯环氧酶基因对细叶远志皂苷含量影响研究第50-64页
    材料与方法第50-56页
        1 实验材料第50-51页
            1.1 植物材料第50页
            1.2 酶和试剂第50页
            1.3 仪器及设备第50-51页
        2 实验方法第51-56页
            2.1 细叶远志皂苷的含量测定第51-53页
            2.2 远志SE基因的表达分析第53-55页
            2.3 细叶远志皂苷含量与SE基因表达量相关分析第55-56页
    结果与讨论第56-63页
        1 方法学考察第56-58页
            1.1 线性范围考察第56页
            1.2 精密度试验第56页
            1.3 稳定性试验第56页
            1.4 重复性试验第56页
            1.5 加样回收率试验第56-58页
        2 细叶远志皂苷含量测定第58-59页
        3 远志总RNA的提取及质量检测第59页
        4 RT-qPCR熔解曲线与扩增曲线第59-61页
            4.1 熔解曲线第59-60页
            4.2 扩增曲线第60-61页
        5 远志SE基因相对表达量第61-62页
        6 细叶远志皂苷含量与SE基因表达量相关分析第62-63页
    小结第63-64页
第三章 基于转录组的远志皂苷生物合成关键酶基因挖掘研究第64-81页
    材料与方法第64-67页
        1 实验材料第64-65页
            1.1 植物材料第64页
            1.2 试剂第64页
            1.3 仪器及设备第64-65页
        2 实验方法第65-67页
            2.1 远志总RNA的提取第65页
            2.2 文库构建及Illumina测序第65-66页
            2.3 denovo组装第66页
            2.4 转录组的功能注释第66-67页
    结果与讨论第67-80页
        1 远志总RNA的提取及质量检测第67-68页
        2 从头组装第68-69页
        3 基因功能注释第69-76页
            3.1 NR库注释第71-73页
            3.2 GO注释第73-74页
            3.3 COG注释第74-75页
            3.4 KEGG注释第75-76页
        4 三萜皂苷生物合成通路相关基因第76-80页
    小结第80-81页
第四章 总结第81-83页
参考文献第83-87页
文献综述第87-102页
    综述参考文献第96-102页
致谢第102-103页
攻读学位期间发表的学术论文目录第103-104页
个人简介第104-105页
开题、中期及学位论文答辩委员组成第105页

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