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基于分块量子力学方法的蛋白—蛋白结合自由能计算

摘要第5-6页
Abstract第6页
第一章 绪论第8-15页
    1.1 引言第8-11页
    1.2 蛋白-蛋白相互作用特点第11页
    1.3 热点残基第11-12页
    1.4 氨基酸组成第12-13页
    1.5 O-环结构第13-15页
第二章 引言第15-17页
第三章 计算方法第17-24页
    3.1 EE-GMFCC方法第17-20页
    3.2 计算结合自由能第20-21页
    3.3 分子动力学模拟第21-24页
第四章 结果与讨论第24-37页
    4.1 单构象方法第24-25页
    4.2 能量分解分析第25-30页
    4.3 表面自洽电荷的影响第30-32页
    4.4 相关性分析第32-34页
    4.5 本章总结第34-35页
    4.6 附录:EE-GMFCC方法的补充说明与多构象结果讨论第35-37页
第五章 总结与展望第37-38页
    5.1 本文的创新点第37页
    5.2 未来和展望第37-38页
参考文献第38-52页
致谢第52页

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