| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 顺式天然反义转录本组学研究进展 | 第9-13页 |
| 1.1.1 引言 | 第9-10页 |
| 1.1.2 Cis-NATs 结构的电子发现 | 第10-11页 |
| 1.1.3 Cis-NATs 的功能基因组学研究 | 第11-13页 |
| 第2章 基于 Ensembl 基因诠释系统筛查 cis-NATs | 第13-22页 |
| 2.1 引言 | 第13页 |
| 2.2 材料和方法 | 第13-15页 |
| 2.2.1 Cis-NATs 的鉴定 | 第13-14页 |
| 2.2.2 SA 对的分类 | 第14-15页 |
| 2.2.3 同源分析 | 第15页 |
| 2.3 结果 | 第15-20页 |
| 2.3.1 候选 Cis-NATs 数据集 | 第15-17页 |
| 2.3.2 不同重叠模式 SA 对 | 第17-19页 |
| 2.3.3 SA 基因的功能分类 | 第19-20页 |
| 2.4 讨论 | 第20-22页 |
| 2.4.1 数据覆盖度和数据类型 | 第20页 |
| 2.4.2 传统的 cDNA 数据的局限性 | 第20-21页 |
| 2.4.3 多物种的比较分析 | 第21-22页 |
| 第3章 新 Cis-NATs 的 SsRNA-seq 筛查及功能诠释初探 | 第22-40页 |
| 3.1 引言 | 第22页 |
| 3.2 材料和方法 | 第22-30页 |
| 3.2.1 新 cis-NATs 的发现 | 第22页 |
| 3.2.1.1 序列读段(reads)在基因组上的注释 | 第22页 |
| 3.2.1.2 转录谱分析 | 第22页 |
| 3.2.2 新 cis-NATs 相关区域的蛋白质预测 | 第22-23页 |
| 3.2.3 功能性 cis-NATs 的验证及功能分析 | 第23-30页 |
| 3.3 结果 | 第30-38页 |
| 3.3.1 候选 cis-NATs 数据集 | 第32-34页 |
| 3.3.2 新 cis-NATs 的鉴定 | 第34-35页 |
| 3.3.3 新 cis-NATs 的功能初探 | 第35-38页 |
| 3.4 讨论 | 第38-40页 |
| 3.4.1 次代测序在已有诠释信息的基础上提供了新的 cis-NATs | 第38页 |
| 3.4.2 线粒体中的新 cis-NATs 具有重要的功能 | 第38-39页 |
| 3.4.3 线粒体中的新 cis-NATs 可能编码新的蛋白 | 第39-40页 |
| 第4章 结论 | 第40-41页 |
| 4.1 结论 | 第40-41页 |
| 致谢 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 附录 | 第45-52页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第52-53页 |
| 综述 | 第53-63页 |
| 参考文献 | 第61-63页 |
