| 中文摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-26页 |
| 1 深海微生物的研究进展 | 第9-16页 |
| ·深海沉积环境及其特点 | 第9-10页 |
| ·深海微生物在海洋生物地球化学循环中的作用 | 第10-12页 |
| ·深海沉积物中的细菌和古菌类群 | 第12-14页 |
| ·深海微生物的研究现状 | 第14-16页 |
| 2 深海微生物的研究方法 | 第16-23页 |
| ·原位研究 | 第16-17页 |
| ·分离培养法 | 第17页 |
| ·荧光显微镜直接计数法 | 第17-18页 |
| ·流式细胞术 | 第18页 |
| ·脂类分子标志物研究 | 第18-19页 |
| ·与PCR技术有关的深海微生物的分子生物学研究方法 | 第19-23页 |
| ·限制性片段长度多态性分析(RFLP) | 第20页 |
| ·末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第20页 |
| ·扩增片段长度多态性(AFLP) | 第20-21页 |
| ·变性梯度凝胶电泳(DGGE)和温度梯度凝胶电泳(TGGE) | 第21页 |
| ·单链构象多态性(SSCP) | 第21页 |
| ·克隆基因文库分析法 | 第21-22页 |
| ·实时定量PCR | 第22页 |
| ·随机扩增DNA多态性分析(RAPD) | 第22页 |
| ·荧光原位杂交(FISH) | 第22-23页 |
| ·PCR引物和PCR技术的偏差 | 第23页 |
| 3 热带西太平洋菲律宾海盆地质和水文概况 | 第23-24页 |
| 4 本研究的目的和拟解决的科学问题 | 第24-26页 |
| 第二章 材料与方法 | 第26-36页 |
| 1 实验材料及仪器设备 | 第26-28页 |
| ·样品采集 | 第26页 |
| ·环境因子的测定 | 第26-27页 |
| ·主要仪器 | 第27页 |
| ·培养基 | 第27-28页 |
| 2 实验方法 | 第28-36页 |
| ·基因文库建立 | 第28-32页 |
| ·宏基因组DNA提取 | 第28页 |
| ·细菌和古菌16S rRNA基因PCR扩增 | 第28-29页 |
| ·PCR产物的乙醇沉淀 | 第29-30页 |
| ·PCR产物的纯化 | 第30页 |
| ·纯化后PCR产物的连接 | 第30-31页 |
| ·重组载体的转化 | 第31-32页 |
| ·基因克隆文库及序列测定 | 第32-33页 |
| ·插入片段的PCR扩增 | 第32页 |
| ·扩增基因的限制性酶切分析 | 第32-33页 |
| ·基因序列测定 | 第33页 |
| ·基因序列的统计学及系统进化分析 | 第33-36页 |
| ·统计学分析 | 第33-34页 |
| ·多样性指数分析 | 第34-35页 |
| ·基因序列的系统进化分析 | 第35页 |
| ·基因序列的提交 | 第35-36页 |
| 第三章 热带西太平洋深海沉积物微生物多样性研究 | 第36-57页 |
| 1 实验结果 | 第36-50页 |
| ·样品地质地球化学特征 | 第36-37页 |
| ·细菌多样性和系统进化分析 | 第37-44页 |
| ·细菌基因克隆文库的统计学分析 | 第37页 |
| ·覆盖率和多样性指数分析 | 第37-39页 |
| ·聚类分析 | 第39-40页 |
| ·细菌基因序列及系统进化分析 | 第40-44页 |
| ·古菌多样性和系统进化分析 | 第44-50页 |
| ·古菌基因克隆文库的统计学分析 | 第44页 |
| ·覆盖率和多样性指数分析 | 第44-45页 |
| ·聚类分析 | 第45-46页 |
| ·基因序列及系统进化分析 | 第46-50页 |
| 2 讨论 | 第50-57页 |
| ·热带西太平洋与秘鲁边缘海沉积环境微生物类群的比较 | 第50-51页 |
| ·细菌类群与环境的相关性 | 第51-53页 |
| ·古菌类群与环境的相关性 | 第53-57页 |
| 总结 | 第57-58页 |
| 参考文献 | 第58-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 个人简历 | 第71页 |
| 在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第71-72页 |
| 附录 | 第72-74页 |
