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高粱低磷低氮形态生理特征及低氮响应的microRNA研究

摘要第8-10页
第一章 文献综述第10-30页
    1 植物miRNA概述第10-13页
        1.1 植物miRNA的发现第10页
        1.2 植物miRNA的特点第10-11页
        1.3 植物miRNA的生物合成第11-12页
        1.4 植物miRNA的作用机制第12-13页
    2 植物miRNA与非生物逆境胁迫第13-17页
        2.1 植物miRNA与低氮胁迫第13-14页
        2.2 植物miRNA与低磷胁迫第14页
        2.3 植物miRNA与低硫胁迫第14-15页
        2.4 植物miRNA与微量元素胁迫第15页
        2.5 植物miRNA与干旱胁迫第15页
        2.6 植物miRNA与盐胁迫第15-16页
        2.7 植物miRNA与低温胁迫第16页
        2.8 植物miRNA与其它非生物胁迫第16-17页
    3 植物miRNA的研究方法第17-22页
        3.1 植物miRNA的鉴定第17-18页
            3.1.1 遗传学筛选第17页
            3.1.2 生物信息学分析第17页
            3.1.3 直接克隆第17-18页
            3.1.4 高通量测序第18页
        3.2 植物miRNA的表达检测第18-20页
            3.2.1 Northern杂交第18-19页
            3.2.2 实时荧光定量PCR第19-20页
        3.3 植物miRNA靶基因的预测及验证第20-22页
    4 本研究的目的及意义第22-23页
    5 本研究的技术路线第23-24页
    参考文献第24-30页
第二章 高粱幼苗在低磷胁迫下的形态和生理反应第30-42页
    1 材料与方法第30-32页
        1.1 供试材料第30页
        1.2 试验方法第30页
        1.3 指标测定第30-32页
            1.3.1 形态指标测定第30-31页
            1.3.2 生理指标测定第31-32页
        1.4 数据处理第32页
    2 结果与分析第32-39页
        2.1 低磷胁迫对高粱幼苗形态指标的影响第32-33页
        2.2 不同基因型高粱耐低磷鉴定第33-35页
        2.3 不同基因型高粱耐低磷聚类分析第35页
        2.4 低磷胁迫对高粱幼苗生理指标的影响第35-39页
            2.4.1 低磷胁迫对高粱幼苗叶绿素和可溶性蛋白含量的影响第35-36页
            2.4.2 低磷胁迫对高粱幼苗POD和SOD活性的影响第36-37页
            2.4.3 低磷胁迫对高粱幼苗丙二醛(MDA)的影响第37-38页
            2.4.4 低磷胁迫下高粱幼苗各生理指标平均变化率分析第38-39页
    3 讨论第39-41页
        3.1 高粱幼苗低磷胁迫的筛选浓度第39页
        3.2 高粱幼苗耐低磷筛选指标第39-41页
    参考文献第41-42页
第三章 低氮胁迫对高粱幼苗形态及生理的影响第42-51页
    1 材料与方法第42页
        1.1 供试材料第42页
        1.2 试验方法第42页
        1.3 指标测定及数据处理第42页
    2 结果与分析第42-48页
        2.1 不同氮浓度对高粱幼苗株高和生长速度的影响第42-43页
        2.2 不同氮浓度对高粱幼苗主根长和茎粗的影响第43-44页
        2.3 不同氮浓度对高粱幼苗成活叶数的影响第44-45页
        2.4 不同氮浓度对高粱幼苗地上和地下干重的影响第45页
        2.5 不同氮浓度对高粱幼苗总干重和根冠比的影响第45-46页
        2.6 低氮胁迫对高粱幼苗叶绿素和可溶性蛋白含量的影响第46-47页
        2.7 低氮胁迫对高粱幼苗SOD和POD活性的影响第47-48页
    3 讨论第48-50页
        3.1 高粱幼苗低氮胁迫的筛选浓度第48页
        3.2 高粱幼苗低氮胁迫的筛选方法第48-50页
    参考文献第50-51页
第四章 高粱幼苗低氮响应的miRNA及其靶基因预测第51-75页
    1 材料与方法第51-53页
        1.1 材料处理第51页
        1.2 总RNA提取及纯化第51-52页
        1.3 Solexa深度测序第52-53页
            1.3.1 Solexa深度测序的实验流程第52页
            1.3.2 Solexa深度测序的信息分析流程第52-53页
            1.3.3 新miRNAs的鉴定第53页
            1.3.4 miRNAs靶基因预测第53页
    2 结果与分析第53-70页
        2.1 总RNA提取结果第53-54页
        2.2 小RNA序列信息分析第54-56页
        2.3 高粱已知miRNA分析第56-68页
            2.3.1 已知miRNA的基本情况第56-57页
            2.3.2 已知miRNA的差异表达第57-58页
            2.3.3 差异表达miRNA的特异性第58-59页
            2.3.4 已知miRNA的靶基因预测第59-68页
        2.4 高粱新预测的miRNA分析第68-70页
            2.4.1 新miRNA的预测第68页
            2.4.2 新miRNA的差异表达第68-69页
            2.4.3 新miRNA的靶基因预测第69-70页
    3 讨论第70-74页
        3.1 植物miRNA鉴定方法比较第70页
        3.2 低氮胁迫下高粱小分子RNA的特点第70-71页
        3.3 高粱低氮胁迫下差异miRNA的表达特点第71-72页
        3.4 高粱低氮胁迫下差异miRNA的靶基因特点第72-74页
    参考文献第74-75页
第五章 高粱低氮胁迫候选miRNA及其靶基因的验证第75-93页
    1 材料与方法第75-79页
        1.1 试验材料第75页
        1.2 试验方法第75-79页
            1.2.1 高粱幼苗培养及取样第75页
            1.2.2 总RNA提取及反转录第75页
            1.2.3 小RNA的提取第75-76页
            1.2.4 小RNA的Poly(A)加尾反应及反转录第76页
            1.2.5 miRNA荧光定量PCR引物设计第76-77页
            1.2.6 miRNA荧光定量PCR第77页
            1.2.7 miRNA靶基因荧光定量PCR引物设计第77-78页
            1.2.8 内参基因的引物设计第78-79页
            1.2.9 miRNA靶基因及内参基因荧光定量PCR第79页
            1.2.10 内参基因表达稳定性分析第79页
            1.2.11 定量PCR数据分析方法第79页
    2 结果与分析第79-88页
        2.1 候选miRNA在高粱根系中的定量表达第79-81页
            2.1.1 高粱根系中候选miRNA定量PCR引物特异性第79-80页
            2.1.2 高粱根系中候选miRNA的定量PCR分析第80-81页
        2.2 候选miRNA在高粱叶片中的定量表达第81-83页
            2.2.1 高粱叶片中候选miRNA定量PCR引物特异性第81-82页
            2.2.2 高粱叶片中候选miRNA的定量PCR分析第82-83页
        2.3 候选靶基因在高粱根系和叶片中的定量表达第83-88页
            2.3.1 内参基因的筛选第83-85页
                2.3.1.1 内参基因定量PCR产物电泳检测第83-84页
                2.3.1.2 内参基因定量PCR引物特异性第84页
                2.3.1.3 内参基因表达的稳定性第84-85页
            2.3.2 候选靶基因的定量PCR引物特异性第85-86页
            2.3.3 候选靶基因的表达量第86-88页
                2.3.3.1 高粱根系中候选靶基因的表达量分析第86-87页
                2.3.3.2 高粱叶片中候选靶基因的表达量分析第87-88页
    3 讨论第88-91页
        3.1 内参基因的筛选第88-89页
        3.2 miRNA表达检测方法的比较第89页
        3.3 miRNA对其靶基因的调控第89-90页
        3.4 候选miRNA的表达验证第90-91页
    参考文献第91-93页
全文结论第93-94页
在读期间发表的论文第94-96页
Abstract第96-98页
致谢第100页

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