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基于叶绿体基因多样性的中国水稻起源进化研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
第一章 引言第12-24页
   ·水稻的起源与进化研究第12-15页
     ·稻属分类研究概况第12-13页
     ·亚洲栽培稻的起源研究第13-14页
     ·亚洲栽培稻的籼粳分化研究第14-15页
   ·水稻遗传多样性研究进展第15-19页
     ·遗传多样性的概念及研究意义第15-16页
     ·遗传多样性的研究方法及其应用第16-18页
     ·遗传多样性在水稻起源进化研究中的应用第18-19页
   ·水稻基因多样性研究进展第19-22页
     ·基因多样性的概念与定义第19页
     ·基因多样性的研究方法与应用第19页
     ·水稻核基因多样性研究进展第19-20页
     ·水稻叶绿体基因多样性研究进展第20-22页
     ·线粒体基因多样性研究进展第22页
   ·本研究的立题意义、目的及技术路线第22-24页
     ·立题意义及目的第22-23页
     ·本研究的技术路线第23-24页
第二章 材料与方法第24-34页
   ·实验材料第24-27页
     ·栽培稻材料第24-25页
     ·野生稻材料第25-27页
     ·分析序列的选择第27页
   ·试验方法第27-32页
     ·叶绿体DNA 的提取第27-28页
     ·基因序列的扩增、检测第28-30页
     ·切胶回收测序第30-32页
     ·水稻籼粳类型鉴定第32页
   ·数据统计与分析第32-34页
     ·基因序列阅读、拼接与比对第32-33页
     ·基因多样性分析第33页
     ·Network 网络图构建第33页
     ·系统发育树构建第33-34页
第三章 结果与分析第34-46页
   ·基因序列多态性分析第34-37页
     ·全序列SNPs 及Indels第34-35页
     ·序列多样性分析第35-37页
   ·基因序列单倍型分析第37-42页
     ·栽培稻单倍型分析第37-38页
     ·全部材料的单倍型分析第38-42页
   ·基因序列单倍型聚类分析第42-45页
   ·单倍型与地理分布第45-46页
第四章 讨论第46-49页
   ·叶绿体基因多样性探讨第46页
   ·叶绿体基因组Indels 在籼粳鉴别中的应用第46-47页
   ·我国栽培稻的起源及演化分析第47页
   ·我国稻种资源保护的重要性第47-49页
第五章 全文结论第49-50页
   ·我国野生稻叶绿体基因多样性丰富第49页
   ·栽培稻籼粳亚种分化过程第49页
   ·我国栽培稻为华南起源第49-50页
参考文献第50-57页
致谢第57-58页
作者简历第58页

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