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微卫星与SNP标记技术在猪亲子鉴定中的有效性研究

摘要第4-5页
ABSTRACT第5页
缩略词表第6-9页
1 文献综述第9-19页
    1.1 亲缘鉴定的发展历程第9-11页
        1.1.1 表型识别第9页
        1.1.2 系谱记录第9页
        1.1.3 滴血验亲第9-10页
        1.1.4 血型鉴定第10页
        1.1.5 染色体形态学鉴定第10页
        1.1.6 DNA亲缘鉴定第10-11页
    1.2 微卫星(STR)标记及其在亲缘鉴定的应用第11-16页
        1.2.1 微卫星(STR)概述第11-13页
        1.2.2 微卫星(STR)的分型技术第13-15页
        1.2.4 微卫星(STR)在动物亲缘鉴定中的应用第15-16页
    1.3 单核苷酸多态性(SNP)及其在亲缘鉴定中的应用第16-18页
        1.3.1 单核苷酸多态性(SNP)概述第16-17页
        1.3.2 单核苷酸多态性(SNP)的分型方法第17页
        1.3.3 单核苷酸多态性(SNP)在动物亲缘鉴定中的应用第17-18页
    1.4 亲缘鉴定方法及原理第18-19页
        1.4.1 基于排除法的亲子鉴定第18页
        1.4.2 基于似然法的亲子鉴定第18-19页
    1.5 研究内容与目的意义第19页
2 材料与方法第19-31页
    2.1 实验材料第19-23页
        2.1.1 实验动物及样品采集第19-21页
        2.1.2 试验主要仪器设备第21-22页
        2.1.3 试验主要试剂第22页
        2.1.4 常用试剂配备第22-23页
    2.2 试验方法第23-27页
        2.2.1 血液DNA的提取第23页
        2.2.2 DNA浓度、纯度及质量检测第23-24页
        2.2.3 微卫星基因组分型第24-26页
        2.2.4 SNP基因组分型第26-27页
    2.3 数据分析方法第27-31页
        2.3.1 基因频率和基因型频率的计算第28页
        2.3.2 基因座期待杂合度(HE)和有效等位基因数(Ne)的测算第28-29页
        2.3.3 多态信息含量的计算第29页
        2.3.4 微卫星与SNP数据预处理第29-30页
        2.3.5 亲缘鉴定的分析参数估计第30-31页
3 结果与分析第31-41页
    3.1 猪基因组DNA提取结果第31页
    3.2 微卫星基因组分型第31-33页
        3.2.1 微卫星PCR扩增结果第31页
        3.2.2 微卫星遗传多样性第31-33页
    3.3 SNP分型结果第33-34页
    3.4 微卫星间的有效性比较第34-36页
    3.5 微卫星与SNP的有效性比较第36-37页
    3.6 亲缘鉴定SNP位点数目的探讨第37-41页
4 讨论第41-42页
    4.1 影响微卫星鉴定准确性的因素第41-42页
        4.1.1 PCR扩增第41页
        4.1.2 无效等位基因第41页
        4.1.3 非同源相似第41页
        4.1.4 双重位点第41-42页
    4.2 影响SNP鉴定准确性的因素第42页
    4.3 统计分析因素第42页
5 结论第42-43页
参考文献第43-49页
致谢第49-50页
附表第50-62页
攻读学位期间发表的论文第62页

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