摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
缩略词表 | 第6-9页 |
1 文献综述 | 第9-19页 |
1.1 亲缘鉴定的发展历程 | 第9-11页 |
1.1.1 表型识别 | 第9页 |
1.1.2 系谱记录 | 第9页 |
1.1.3 滴血验亲 | 第9-10页 |
1.1.4 血型鉴定 | 第10页 |
1.1.5 染色体形态学鉴定 | 第10页 |
1.1.6 DNA亲缘鉴定 | 第10-11页 |
1.2 微卫星(STR)标记及其在亲缘鉴定的应用 | 第11-16页 |
1.2.1 微卫星(STR)概述 | 第11-13页 |
1.2.2 微卫星(STR)的分型技术 | 第13-15页 |
1.2.4 微卫星(STR)在动物亲缘鉴定中的应用 | 第15-16页 |
1.3 单核苷酸多态性(SNP)及其在亲缘鉴定中的应用 | 第16-18页 |
1.3.1 单核苷酸多态性(SNP)概述 | 第16-17页 |
1.3.2 单核苷酸多态性(SNP)的分型方法 | 第17页 |
1.3.3 单核苷酸多态性(SNP)在动物亲缘鉴定中的应用 | 第17-18页 |
1.4 亲缘鉴定方法及原理 | 第18-19页 |
1.4.1 基于排除法的亲子鉴定 | 第18页 |
1.4.2 基于似然法的亲子鉴定 | 第18-19页 |
1.5 研究内容与目的意义 | 第19页 |
2 材料与方法 | 第19-31页 |
2.1 实验材料 | 第19-23页 |
2.1.1 实验动物及样品采集 | 第19-21页 |
2.1.2 试验主要仪器设备 | 第21-22页 |
2.1.3 试验主要试剂 | 第22页 |
2.1.4 常用试剂配备 | 第22-23页 |
2.2 试验方法 | 第23-27页 |
2.2.1 血液DNA的提取 | 第23页 |
2.2.2 DNA浓度、纯度及质量检测 | 第23-24页 |
2.2.3 微卫星基因组分型 | 第24-26页 |
2.2.4 SNP基因组分型 | 第26-27页 |
2.3 数据分析方法 | 第27-31页 |
2.3.1 基因频率和基因型频率的计算 | 第28页 |
2.3.2 基因座期待杂合度(HE)和有效等位基因数(Ne)的测算 | 第28-29页 |
2.3.3 多态信息含量的计算 | 第29页 |
2.3.4 微卫星与SNP数据预处理 | 第29-30页 |
2.3.5 亲缘鉴定的分析参数估计 | 第30-31页 |
3 结果与分析 | 第31-41页 |
3.1 猪基因组DNA提取结果 | 第31页 |
3.2 微卫星基因组分型 | 第31-33页 |
3.2.1 微卫星PCR扩增结果 | 第31页 |
3.2.2 微卫星遗传多样性 | 第31-33页 |
3.3 SNP分型结果 | 第33-34页 |
3.4 微卫星间的有效性比较 | 第34-36页 |
3.5 微卫星与SNP的有效性比较 | 第36-37页 |
3.6 亲缘鉴定SNP位点数目的探讨 | 第37-41页 |
4 讨论 | 第41-42页 |
4.1 影响微卫星鉴定准确性的因素 | 第41-42页 |
4.1.1 PCR扩增 | 第41页 |
4.1.2 无效等位基因 | 第41页 |
4.1.3 非同源相似 | 第41页 |
4.1.4 双重位点 | 第41-42页 |
4.2 影响SNP鉴定准确性的因素 | 第42页 |
4.3 统计分析因素 | 第42页 |
5 结论 | 第42-43页 |
参考文献 | 第43-49页 |
致谢 | 第49-50页 |
附表 | 第50-62页 |
攻读学位期间发表的论文 | 第62页 |