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一株牦牛源产细菌素植物乳杆菌的分离鉴定及其基因组和胞外蛋白组研究

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 文献综述第15-19页
    1 细菌素的分类第16-17页
    2 细菌素的合成与分泌第17页
    3 细菌素的应用研究第17-19页
        3.1 细菌素与食品防腐第17-18页
        3.2 细菌素在医药方面的应用第18-19页
    4 小结第19页
第二章 一株牦牛源产细菌素的植物乳杆菌分离及鉴定第19-31页
    1 材料与方法第20-23页
        1.1 菌株与试剂第20页
        1.2 仪器设备第20页
        1.3 乳酸菌的分离纯化第20-21页
        1.4 筛选产细菌素乳酸菌的及鉴定第21-22页
            1.4.1 无细胞发酵上清液的制备第21页
            1.4.2 筛选第21页
            1.4.3 有机酸和过氧化氢排除试验第21页
            1.4.4 蛋白酶消化试验第21页
            1.4.5 产细菌素菌株的鉴定第21-22页
        1.5 对牦牛常见腹泻病原菌抑制的测定第22页
        1.6 生长曲线的测定第22页
            1.6.1 乳酸菌不同生长时间培养液OD值测定第22页
            1.6.2 乳酸菌不同生长时间的活菌计数第22页
        1.7 抗生素敏感试验第22页
        1.8 耐酸和耐胆盐试验第22-23页
        1.9 SWUN5815对Caco-2 细胞的黏附第23页
            1.9.1 SWUN5815菌液准备第23页
            1.9.2 荧光标记SWUN5815第23页
            1.9.3 Caco-2 细胞的培养第23页
            1.9.4 黏附试验第23页
    2 结果与分析第23-29页
        2.1 乳酸菌的分离第23-24页
        2.2 产细菌素乳酸菌的筛选第24页
        2.3 产细菌素菌株的鉴定第24-25页
        2.4 SWUN5815对牦牛源病原菌的抑制结果第25-26页
        2.5 SWUN5815的生长趋势第26-27页
            2.5.1 SWUN5815培养时间与OD600值的关系曲线第26-27页
            2.5.2 SWUN5815对数期OD600值与活菌数的关系第27页
        2.6 SWUN5815抗生素敏感试验结果第27-28页
        2.7 SWUN5815耐酸和耐胆盐能力第28页
        2.8 SWUN5815对Caco-2 细胞的黏附效果第28-29页
    3 讨论第29-31页
第三章 植物乳杆菌SWUN5815株对小鼠生长性能和肠黏膜免疫的作用第31-35页
    1 材料第31-32页
        1.1 菌株第31页
        1.2 主要试剂第31页
        1.3 实验动物第31页
        1.4 主要仪器第31-32页
    2 方法第32页
        2.1 SWUN5815 对小鼠体增重的影响第32页
            2.1.1 实验动物的分组与处理第32页
            2.1.2 小鼠日增重的测定第32页
        2.2 肠黏膜SIgA测定第32页
    3 结果第32-33页
        3.1 SWUN5815对小鼠体增重的影响第32-33页
        3.2 SWUN5815对小鼠小肠黏膜SIgA的影响第33页
    4 讨论第33-35页
第四章 植物乳杆菌SWUN5815株在体内拮抗沙门菌的作用研究第35-46页
    1 材料与方法第35-38页
        1.1 实验菌株和动物第35-36页
        1.2 主要试剂与仪器第36页
        1.3 菌液的制备第36页
        1.4 实验动物的处理及样本采集第36页
        1.5 检测SWUN5815对感染沙门菌小鼠所致组织病理学变化的影响第36页
        1.6 检测SWUN5815对感染沙门菌小鼠细胞因子的影响第36-38页
            1.6.1 组织RNA的提取第36-37页
            1.6.2 cDNA的制备第37页
            1.6.3 荧光定量PCR的反应体系条件和引物第37-38页
            1.6.4 数据处理第38页
    2 结果与分析第38-44页
        2.1 SWUN5815对感染沙门菌小鼠所致组织病理学变化的影响第38-43页
            2.1.1 48 h各组织病理学变化第38-40页
            2.1.2 96 h各组织病理学变化第40-43页
        2.2 SWUN5815对感染沙门菌小鼠细胞因子的影响第43-44页
    3 讨论第44-46页
第五章 SWUN5815全基因测序与胞外蛋白分析第46-63页
    1 材料与方法第46-47页
        1.1 菌株第46页
        1.2 试剂与设备第46页
        1.3 提取SWUN5815 DNA第46页
        1.4 胞外蛋白的提取第46-47页
    2 结果第47-60页
        2.1 SWUN5815基因组组装效果评价第47页
        2.2 组装结果第47-48页
        2.3 SWUN5815基因组概况第48-50页
            2.3.1 基因组组分分析第48-49页
            2.3.2 编码基因第49页
            2.3.3 重复序列第49-50页
            2.3.4 非编码RNA第50页
            2.3.5 基因岛第50页
        2.4 基因功能分析第50-57页
            2.4.1 GO数据库注释第51页
            2.4.2 KEGG数据库注释第51-52页
            2.4.3 COG数据库注释第52-53页
            2.4.4 NR数据库注释第53-55页
            2.4.5 SWUN5815与其它植物乳杆菌共线性分析第55-56页
            2.4.6 遗传进化分析第56-57页
        2.5 蛋白鉴定结果第57-58页
            2.5.1 概述第57-58页
        2.6 蛋白功能注释第58-60页
            2.6.1 GO注释第58页
            2.6.2 COG注释第58-59页
            2.6.3 Pathway注释第59-60页
    3 讨论第60-63页
        3.1 基因组概况与遗传进化分析第60页
        3.2 细菌素相关基因第60-61页
        3.3 抗力性基因第61页
        3.4 免疫基因第61页
        3.5 胞外蛋白第61-63页
第六章 结论与创新点第63-64页
参考文献第64-74页
附录第74-75页
致谢第75页

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