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基于GWAS的lncRNA遗传变异与HBV感染结局的关联研究

中文摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
1 引言第10-16页
课题研究思路第16-17页
2 材料与方法第17-28页
    2.1 研究对象第17页
    2.2 资料的收集第17-18页
        2.2.1 流行病学调查第17-18页
        2.2.2 定义第18页
        2.2.3 现场调查的质量控制第18页
    2.3 检验效能的估计第18页
    2.4 标本采集和DNA的提取第18-21页
        2.4.1 血液样本的采集与处理第18-19页
        2.4.2 DNA提取的主要仪器和试剂第19页
        2.4.3 基因组DNA的提取方法第19-20页
        2.4.4 DNA浓度和纯度的测定第20-21页
    2.5 候选SNP的挑选第21-25页
    2.7 基因分型第25-26页
        2.7.1 Sequenom MassArray分型检测第25页
        2.7.2 MassArray分型检测原理第25页
        2.7.3 分型数据读取第25-26页
        2.7.4 实验的质量控制第26页
    2.8 统计分析第26-28页
        2.8.1 基本资料分析第26页
        2.8.2 环境因素与HBV感染结局的关联分析第26-27页
        2.8.3 单位点与HBV感染结局的关联分析第27页
        2.8.4 基因-环境交互作用分析第27页
        2.8.5 单倍型与HBV感染结局的分析第27页
        2.8.6 lncRNA遗传变异对肝癌进程的影响第27-28页
3 结果第28-50页
    3.1 研究对象的一般情况第28-29页
    3.2 环境因素与HBV感染结局的关联分析第29-31页
    3.3 SNP基因型分布情况第31页
    3.4 lncRNA遗传变异与HBV感染结局的关联分析第31-35页
        3.4.1 lnc-ACACA-1 遗传变异与HBV感染结局的关联分析第31-34页
        3.4.2 lnc-RP11-150O12.3.1-1 遗传变异与HBV感染结局的关联分析第34-35页
    3.5 单位点与环境因素两两交互作用对HBV感染结局的影响第35-45页
        3.5.1 lnc-ACACA-1 遗传变异与环境因素两两交互作用对HBV感染结局的影响第35页
        3.5.2 lnc-RP11-150O12.3.1-1 与环境因素两两交互作用对HBV感染结局的影响第35-45页
    3.6 基因-环境多维交互作用的MDR分析第45-47页
    3.7 lncRNA单倍型与HBV感染结局的关联研究第47页
    3.8 lncRNA遗传变异与肝癌患者的特征关联研究第47-50页
4 讨论第50-56页
    4.1 环境因素与HBV感染结局的关联第50页
    4.2 与HBV感染结局有关联的遗传研究第50-51页
    4.3 Lnc-ACACA-1 遗传变异与HBV感染结局的关联第51-54页
    4.4 lnc-RP11-150O12.3.1-1 遗传变异与HBV感染结局的关联第54-56页
    4.5 本研究的创新点和局限性第56页
结论第56-57页
参考文献第57-62页
综述第62-71页
    参考文献第68-71页
攻读学位期间发表的论文第71-72页
致谢第72页

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