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翻译后修饰及显性负突变对PKM2结构与功能调控的分子机制研究

缩略词表第5-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-10页
第一章 绪论第11-32页
    1.1 蛋白质翻译后修饰第11-12页
    1.2 肿瘤细胞代谢第12-14页
    1.3 PKM2对肿瘤代谢的调控第14-27页
        1.3.1 丙酮酸激酶的催化特性及亚型分析第15-16页
        1.3.2 PKM2基因的转录调控第16-17页
        1.3.3 PKM2蛋白的结构特征第17-19页
        1.3.4 PKM2与肿瘤的相关性第19页
        1.3.5 PKM2与“温伯格效应”第19-25页
            1.3.5.1 PKM2活性的调控机制第20-24页
                1.3.5.1.1 小分子以及氨基酸对PKM2活性与功能的调控第21-22页
                1.3.5.1.2 显性负突变对PKM2活性与功能的调控第22-23页
                1.3.5.1.3 翻译后修饰对PKM2活性与功能的调控第23-24页
            1.3.5.2 PKM2调控肿瘤代谢第24-25页
        1.3.6 PKM2的蛋白激酶功能第25-27页
    1.4 丙酮酸激酶的变构调控第27-30页
        1.4.1 墨西哥利什曼原虫丙酮酸激酶的变构调控第27-28页
        1.4.2 人源丙酮酸激酶PKM2的变构调控第28-30页
    1.5 本课题的创新点及研究意义第30-32页
第二章 材料与方法第32-46页
    2.1 实验仪器与试剂第32-38页
        2.1.1 实验仪器第32-33页
        2.1.2 实验试剂第33-37页
        2.1.3 实验材料第37-38页
    2.2 分子克隆实验方法第38-40页
        2.2.1 克隆构建第38-39页
        2.2.2 点突变设计第39-40页
        2.2.3 小管表达测试第40页
    2.3 蛋白表达纯化第40-41页
        2.3.1 蛋白表达第40页
        2.3.2 蛋白纯化第40-41页
            2.3.2.1 细胞破碎第40页
            2.3.2.2 亲和层析及柱上酶切第40-41页
            2.3.2.3 凝胶过滤层析第41页
    2.4 晶体生长与优化第41-42页
        2.4.1 晶体初筛第41页
        2.4.2 晶体优化第41-42页
        2.4.3 晶体的处理第42页
    2.5 数据收集与结构解析第42-43页
        2.5.1 衍射数据收集与处理第42-43页
        2.5.2 结构解析第43页
    2.6 丙酮酸激酶体外酶活实验第43-44页
    2.7 凝胶过滤层析实验第44页
    2.8 热稳定性检测TSA实验第44-46页
第三章 PKM2突变体蛋白的体外理化性质分析及结构生物学研究第46-67页
    3.1 PKM2突变体构建第46页
    3.2 PKM2本体及突变体蛋白的体外酶活、理化性质分析第46-53页
        3.2.1 PKM2本体及突变体蛋白的体外酶活检测第46-49页
        3.2.2 PKM2本体及突变体蛋白的聚合状态检测第49-51页
        3.2.3 PKM2本体蛋白及突变体蛋白热稳定性分析第51-53页
    3.3 PKM2突变体蛋白的纯化与结晶第53-57页
        3.3.1 PKM2突变体蛋白的纯化第53-56页
        3.3.2 突变体蛋白晶体的筛选与优化第56-57页
    3.4 突变体晶体的衍射数据收集与结构解析第57-66页
        3.4.1 突变体Y105E晶体的衍射数据收集与结构解析第57-59页
        3.4.2 突变体K305Q晶体的衍射数据收集与结构解析第59-61页
        3.4.3 突变体R399E晶体的衍射数据收集与结构解析第61-63页
        3.4.4 突变体K422R晶体的衍射数据收集与结构解析第63-65页
        3.4.5 作图第65-66页
    3.5 本章小结第66-67页
第四章 PKM2突变体结构分析第67-87页
    4.1 PKM2突变体的晶体结构第67-68页
    4.2 PKM2的R-state与T-state之间的构象转换第68-76页
    4.3 突变体Y105E抑制FBP诱导的R-state四聚体的形成第76-79页
    4.4 突变体K305Q破坏PKM2四聚体形成并影响其酶活第79-80页
    4.5 突变体K422R的稳定的T-state构象第80-83页
    4.6 突变体R399E的R-state四聚体形成受阻第83-84页
    4.7 翻译后修饰及显性负突变调控PKM2构象的工作模型第84-86页
    4.8 本章小结第86-87页
第五章 结果与讨论第87-90页
第六章 结论与展望第90-92页
    6.1 结论第90页
    6.2 展望第90-92页
参考文献第92-102页
附录:解析的结构列表第102-103页
博士期间发表论文及基金资助第103-106页
致谢第106-107页

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