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基于效应子介导免疫体系的马铃薯晚疫病菌无毒基因挖掘及功能分析

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
缩略词表第12-13页
第一章 前言第13-30页
    1.1 马铃薯第13-14页
    1.2 马铃薯晚疫病第14-16页
        1.2.1 致病疫霉第14页
        1.2.2 致病疫霉侵染生活史第14-16页
        1.2.3 致病疫霉起源第16页
    1.3 植物与病原菌互作理论基础第16-20页
        1.3.1 基因对基因假说第16页
        1.3.2 警戒假说第16-17页
        1.3.3 诱饵假说和Zig-Zag理论第17-20页
    1.4 马铃薯抗晚疫病分子模式研究第20-26页
        1.4.1 胞外效应子激发免疫第21-22页
        1.4.2 Rpi-基因介导的RxLR型胞质效应子激发免疫第22-26页
        1.4.3 CRN类胞质效应子激发免疫第26页
    1.5 效应子组学第26-29页
    1.6 本研究的目的及内容第29-30页
第二章 材料与方法第30-45页
    2.1 实验材料第30-31页
        2.1.1 植物材料第30页
        2.1.2 载体及菌株第30页
        2.1.3 晚疫病病原菌第30-31页
        2.1.4 实验试剂第31页
    2.2 实验方法第31-45页
        2.2.1 P.infestans的效应子基因克隆及重组质粒构建第31-34页
        2.2.2 P.infestans的效应子分析第34-36页
            2.2.2.1 效应子筛选第34页
            2.2.2.2 PVX-agroinfection 分析第34-35页
            2.2.2.3 基于农押茜介导的基因瞬时表达分析(^Agroinfiltration assay)第35页
            2.2.2.4 病毒介导的基因沉默分析第35-36页
        2.2.3 晚疫病病原菌接种鉴定第36页
        2.2.4 细胞死亡点统计及电导率测定第36-37页
        2.2.5 植物叶片总RNA提取及反转录第37-39页
        2.2.6 基因表达分析第39-40页
        2.2.7 基因亚细胞定位第40页
        2.2.8 Western blotting第40-41页
        2.2.9 酵母双杂交第41-43页
        2.2.10 双分子荧光互补第43-45页
第三章 结果与分析第45-76页
    3.1 候选无毒基因的筛选第45-49页
        3.1.1 候选无毒效应子及其对应Rpi基因的马铃薯材料第45-49页
    3.2 AVR2家族基因的功能分析第49-53页
        3.2.1 四个Rpi-R2同源基因克隆第49-50页
        3.2.2 Rpi-hjt1.1和Rpi-R2-like可以识别效应子Pi23008第50页
        3.2.3 AVR2家族基因高度多态性第50-51页
        3.2.4 Rpi-R2同源蛋白识别Ⅱ、Ⅲ类AVR2家族成员第51-52页
        3.2.5 细胞核输出信号结构域参与Rpi-R2同源蛋白对AVR2家族的识别第52-53页
    3.3 PI23008和PI13940的结构、功能及识别机制分析第53-66页
        3.3.1 Pi23008和Pi13940可以被Rpi-hjt1.1识别第54-55页
        3.3.2 马铃薯HJT349-3对不同晚疫病菌生理小种的抗性鉴定第55-56页
        3.3.3 Pi23008同源序列多态性及功能分析第56-57页
        3.3.4 Pi23008~(P95L,A98V)突变体逃避Rpi-hjt1.1识别第57-58页
        3.3.5 Pi13940~(K109M)突变体逃避Rpi-hjt1.1识别第58-59页
        3.3.6 Pi23008~(P95L,A98V)及Pi13940~(K109M)突变体逃避Rpi-hjt1.1识别机制第59-61页
        3.3.7 沉默StBSL1不影响Pi23008的识别,而干扰Pi13940的识别第61-63页
        3.3.8 Pi22724干扰Rpi-hjt1.1介导的HR表型第63-65页
        3.3.9 Pi22724促进P.infestans在本氏烟中生长第65-66页
    3.4 PI22798激发本氏烟草和普通烟草细胞死亡分子机理第66-76页
        3.4.1 Pi22798表达模式及其毒性功能第67-68页
        3.4.2 同源Pi22798蛋白序列高度保守且功能类似第68-70页
        3.4.3 40-165aa功能域能够激发细胞死亡第70-71页
        3.4.4 Pi22798定位于细胞核第71页
        3.4.5 Pi22798激发细胞死亡需要核定位信号域第71-73页
        3.4.6 Pi22798激发细胞死亡依赖于SGT1,而不是HSP90第73-74页
        3.4.7 AVR3b抑制Pi22798激发细胞死亡第74-76页
第四章 讨论第76-86页
    4.1 无毒基因的分析途径第76-77页
    4.2 挖掘抗病基因可行策略第77-78页
    4.3 PVX-agroinfection和agroinfiltration分析方法的局限性第78-79页
    4.4 AVR2家族与Rpi-R2同源蛋白间的识别机制第79-81页
    4.5 Pi22724抑制Rpi-hjt1.1识别Pi23008可能机制第81-82页
    4.6 效应子Pi22798诱导细胞死亡机制第82-84页
    4.7 研究展望第84-86页
参考文献第86-103页
附录第103-122页
    附录一 供试马铃薯材料第103-104页
    附录二 本研究中RxLR效应子及功能基因引物第104-108页
    附录三 重要功能基因及效应子序列信息第108-116页
    附录四 培养基及试剂配方第116-121页
    附录五 攻读博士学位期间发表论文第121-122页
致谢第122-123页

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