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基于全基因组测序的食管鳞癌基因组结构突变及靶基因功能验证研究

中文摘要第6-10页
英文摘要第10-14页
第一部分 基于全基因组测序的食管鳞癌基因组结构变异研究第18-65页
    1 前言第18-19页
    2 材料与方法第19-35页
        2.1 材料第19-21页
        2.2 方法第21-35页
    3 结果第35-52页
        3.1 病例信息第35页
        3.2 31例ESCC基因组中的体细胞SVs类型、机制及分布特征第35-36页
        3.3 SVs导致CDKN2A/B缺失和NOTCH1基因序列破坏第36-38页
        3.4 染色体局部重排是ESCC基因组重排的主要类型第38-50页
        3.5 ESCC与EAC中复杂SVs及靶基因比较第50页
        3.6 ESCC基因组拷贝数变异特征第50-52页
    4 讨论第52-64页
        4.1 ESCC中SVs的类型、分布特点及形成机制第54-55页
        4.2 SVs直接造成ESCC中抑癌基因的功能丧失第55-56页
        4.3 复杂SVs在ESCC中发生的意义第56-62页
        4.4 ESCC与EAC中复杂SVs事件比较第62页
        4.5 CN-LOH和WGD在ESCC中的意义第62-64页
    5 结论第64-65页
第二部分CDCA7基因在食管鳞癌中的作用及机制研究第65-80页
    1 前言第65-66页
    2 材料与方法第66-72页
        2.1 材料第66-67页
        2.2 方法第67-72页
    3 结果第72-77页
        3.1 ESCC中CDCA7基因所在的染色体区域 2q31局灶扩增第72页
        3.2 CDCA7在ESCC肿瘤组织中的表达高于对照正常粘膜组织第72-74页
        3.3 在ESCC细胞中敲低CDCA7基因显著抑制细胞生长、促进细胞凋亡第74-75页
        3.4 RNA-seq和WB 结果提示,敲低CDCA7可能通过MAPK通路抑制ESCC细胞生长第75-76页
        3.5 RNA-seq提示敲低CDCA7基因促进细胞凋亡的机制第76-77页
    4 讨论第77-79页
    5 结论第79-80页
附表第80-90页
附图第90-91页
参考文献第91-101页
综述 基于二代测序的食管鳞癌基因组学研究进展第101-119页
    参考文献第112-119页
致谢第119-121页
在学期间承担/参与的科研课题与研究成果第121-124页
个人简历第124页

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