从蛋白质序列预测蛋白质的柔性区域
摘要 | 第3-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
符号说明 | 第9-10页 |
第一章 绪论 | 第10-14页 |
1.1 研究背景 | 第10页 |
1.2 研究意义 | 第10-11页 |
1.3 蛋白质柔性区域预测的发展 | 第11-13页 |
1.4 本文的结构组织及主要研究内容 | 第13-14页 |
第二章 数据集与研究方法 | 第14-18页 |
2.1 数据集 | 第14页 |
2.2 研究方法 | 第14-18页 |
2.2.1 序列表示即k间隔氨基酸对 | 第14-15页 |
2.2.2 10 折交叉检验 | 第15-18页 |
2.2.3 特征选择方法FSID | 第15-16页 |
2.2.4 逻辑回归 | 第16-17页 |
2.2.5 性能评价指标 | 第17页 |
2.2.6 机器学习曲线 | 第17-18页 |
第三章 基于序列结构的蛋白质柔性区域的预测 | 第18-25页 |
3.1 引言 | 第18页 |
3.2 FSID_FRP模型的介绍 | 第18-22页 |
3.2.1 基于多样性增量的特征选择 | 第19-21页 |
3.2.2 多样性增量与信息增益的比较 | 第21页 |
3.2.3 预测模型的评估 | 第21-22页 |
3.3 结果与讨论 | 第22-23页 |
3.4 机器学习曲线 | 第23-24页 |
3.5 小结 | 第24-25页 |
第四章 FSID_FRP模型的验证 | 第25-29页 |
4.1 引言 | 第25页 |
4.2 B-因子值与柔性的关系 | 第25-26页 |
4.3 基于B-因子值对数据的整理 | 第26-27页 |
4.4 模型的应用 | 第27-28页 |
4.5 小结 | 第28-29页 |
第五章 总结和研究展望 | 第29-31页 |
5.1 总结 | 第29-30页 |
5.2 研究展望 | 第30-31页 |
第六章 参考文献 | 第31-36页 |
附录 | 第36-39页 |
致谢 | 第39-40页 |
在读期间发表的学术论文与取得的其他研究成果 | 第40页 |