摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
引言 | 第12-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-21页 |
1.1 鱼类TLRs进化及同源性分析 | 第14-15页 |
1.2 鱼类Toll样受体在组织和细胞上的分布 | 第15页 |
1.3 鱼类TLRs家族各成员 | 第15-18页 |
1.3.1 TLR1亚家族 | 第15-16页 |
1.3.2 TLR3亚家族 | 第16页 |
1.3.3 TLR4亚家族 | 第16-17页 |
1.3.4 TLR5亚家族 | 第17页 |
1.3.5 TLR7亚家族 | 第17-18页 |
1.3.6 鱼类特有家族 | 第18页 |
1.4 鱼类Toll样受体基因的配体以及调控 | 第18-19页 |
1.5 展望 | 第19-21页 |
第二章 草鱼全基因组中的Toll样受体家族基因的鉴定与表达模式分析 | 第21-35页 |
2.1 材料 | 第21-23页 |
2.1.1 嗜水气单胞菌 | 第21页 |
2.1.2 感受态与载体 | 第21-22页 |
2.1.3 主要生化试剂与耗材 | 第22页 |
2.1.4 主要设备与仪器 | 第22-23页 |
2.2 方法 | 第23-24页 |
2.2.1 草鱼TLR生物信息学分析 | 第23页 |
2.2.2 草鱼TLR基因系统发育树构建 | 第23页 |
2.2.3 TLR11家族共线性分析 | 第23页 |
2.2.4 TLR基因转录组表达谱分析 | 第23-24页 |
2.3 结果 | 第24-32页 |
2.3.1 草鱼TLR基因生物信息 | 第24-25页 |
2.3.2 系统发育与共线性分析 | 第25-27页 |
2.3.3 TLR基因结构分析 | 第27-29页 |
2.3.4 草鱼TLR基因组织表达谱分析 | 第29-30页 |
2.3.5 嗜水气单胞菌侵染诱导组织表达谱分析 | 第30-32页 |
2.4 讨论 | 第32-35页 |
第三章 草鱼tlr18基因的功能研究 | 第35-49页 |
3.1 材料 | 第35-36页 |
3.1.1 草鱼肾细胞系(C.idella kidney,CIK) | 第35-36页 |
3.2 方法 | 第36-40页 |
3.2.1 PAMPs的刺激 | 第36页 |
3.2.2 过表达载体的构建 | 第36-38页 |
3.2.3 CIK细胞的转染 | 第38页 |
3.2.4 过表达gctlr18对嗜水气单胞菌入侵效应的测定 | 第38页 |
3.2.5 双荧光酶报告基因的测定 | 第38-39页 |
3.2.6 总RNA的提取 | 第39页 |
3.2.7 实时荧光定量(RT-PCR) | 第39-40页 |
3.2.8 数据统计与分析 | 第40页 |
3.3 结果 | 第40-47页 |
3.3.1 gctlr18基因生物信息与系统发育树分析 | 第40-43页 |
3.3.2 PAMPs刺激gctlr18mRNA的表达谱 | 第43-45页 |
3.3.3 gctlr18过表达对下游免疫相关因子的调控 | 第45页 |
3.3.4 gctlr18基因对双荧光素酶报告系统活性的调控 | 第45-46页 |
3.3.5 gctlr18基因的抑菌效应 | 第46-47页 |
3.4 讨论 | 第47-49页 |
第四章 草鱼tlr20.2基因的功能研究 | 第49-57页 |
4.1 材料 | 第49页 |
4.2 方法 | 第49-50页 |
4.2.1 过表达载体的构建 | 第49-50页 |
4.2.2 实时荧光定量(RT-PCR) | 第50页 |
4.3 结果 | 第50-54页 |
4.3.1 gctlr20.2基因生物信息 | 第50-52页 |
4.3.2 PAMPs刺激gctlr20.2mRNA的表达谱 | 第52页 |
4.3.3 gctlr20.2过表达对下游免疫相关因子的调控 | 第52-53页 |
4.3.4 gctlr20.2基因表达抑制对下游免疫相关因子的调控 | 第53页 |
4.3.5 gctlr20.2基因对双荧光素酶报告基因的调控 | 第53-54页 |
4.4 讨论 | 第54-57页 |
第五章 草鱼tlr21基因的功能研究及其miRNA的调控 | 第57-65页 |
5.1 材料 | 第57页 |
5.1.1 CIK细胞的培养,冻存与复苏 | 第57页 |
5.1.2 总RNA的提取 | 第57页 |
5.2 方法 | 第57-59页 |
5.2.1 双赢光素酶报告载体的构建 | 第57页 |
5.2.2 agomir miRNA的合成 | 第57-58页 |
5.2.3 gctlr21mRNA靶向基因的筛选 | 第58-59页 |
5.2.4 实时荧光定量(RT-PCR) | 第59页 |
5.3 结果 | 第59-63页 |
5.3.1 gctlr21生物信息 | 第59页 |
5.3.2 PAMPs诱导gctlr21mRNA转录 | 第59-60页 |
5.3.3 gctlr21过表达和干扰对下游免疫相关基因的调控 | 第60页 |
5.3.4 gctlr21基因对双荧光素酶报告系统的调控 | 第60-61页 |
5.3.5 miRNA靶基因预测 | 第61-62页 |
5.3.6 miRNA对免疫基因的调控 | 第62-63页 |
5.4 讨论 | 第63-65页 |
结论 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-79页 |
附录 硕士在读期间发表及投稿论文 | 第79-80页 |
致谢 | 第80页 |