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草鱼TLR基因鉴定及三个TLR基因免疫功能初步研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-8页
引言第12-13页
第一章 文献综述第13-21页
    1.1 鱼类TLRs进化及同源性分析第14-15页
    1.2 鱼类Toll样受体在组织和细胞上的分布第15页
    1.3 鱼类TLRs家族各成员第15-18页
        1.3.1 TLR1亚家族第15-16页
        1.3.2 TLR3亚家族第16页
        1.3.3 TLR4亚家族第16-17页
        1.3.4 TLR5亚家族第17页
        1.3.5 TLR7亚家族第17-18页
        1.3.6 鱼类特有家族第18页
    1.4 鱼类Toll样受体基因的配体以及调控第18-19页
    1.5 展望第19-21页
第二章 草鱼全基因组中的Toll样受体家族基因的鉴定与表达模式分析第21-35页
    2.1 材料第21-23页
        2.1.1 嗜水气单胞菌第21页
        2.1.2 感受态与载体第21-22页
        2.1.3 主要生化试剂与耗材第22页
        2.1.4 主要设备与仪器第22-23页
    2.2 方法第23-24页
        2.2.1 草鱼TLR生物信息学分析第23页
        2.2.2 草鱼TLR基因系统发育树构建第23页
        2.2.3 TLR11家族共线性分析第23页
        2.2.4 TLR基因转录组表达谱分析第23-24页
    2.3 结果第24-32页
        2.3.1 草鱼TLR基因生物信息第24-25页
        2.3.2 系统发育与共线性分析第25-27页
        2.3.3 TLR基因结构分析第27-29页
        2.3.4 草鱼TLR基因组织表达谱分析第29-30页
        2.3.5 嗜水气单胞菌侵染诱导组织表达谱分析第30-32页
    2.4 讨论第32-35页
第三章 草鱼tlr18基因的功能研究第35-49页
    3.1 材料第35-36页
        3.1.1 草鱼肾细胞系(C.idella kidney,CIK)第35-36页
    3.2 方法第36-40页
        3.2.1 PAMPs的刺激第36页
        3.2.2 过表达载体的构建第36-38页
        3.2.3 CIK细胞的转染第38页
        3.2.4 过表达gctlr18对嗜水气单胞菌入侵效应的测定第38页
        3.2.5 双荧光酶报告基因的测定第38-39页
        3.2.6 总RNA的提取第39页
        3.2.7 实时荧光定量(RT-PCR)第39-40页
        3.2.8 数据统计与分析第40页
    3.3 结果第40-47页
        3.3.1 gctlr18基因生物信息与系统发育树分析第40-43页
        3.3.2 PAMPs刺激gctlr18mRNA的表达谱第43-45页
        3.3.3 gctlr18过表达对下游免疫相关因子的调控第45页
        3.3.4 gctlr18基因对双荧光素酶报告系统活性的调控第45-46页
        3.3.5 gctlr18基因的抑菌效应第46-47页
    3.4 讨论第47-49页
第四章 草鱼tlr20.2基因的功能研究第49-57页
    4.1 材料第49页
    4.2 方法第49-50页
        4.2.1 过表达载体的构建第49-50页
        4.2.2 实时荧光定量(RT-PCR)第50页
    4.3 结果第50-54页
        4.3.1 gctlr20.2基因生物信息第50-52页
        4.3.2 PAMPs刺激gctlr20.2mRNA的表达谱第52页
        4.3.3 gctlr20.2过表达对下游免疫相关因子的调控第52-53页
        4.3.4 gctlr20.2基因表达抑制对下游免疫相关因子的调控第53页
        4.3.5 gctlr20.2基因对双荧光素酶报告基因的调控第53-54页
    4.4 讨论第54-57页
第五章 草鱼tlr21基因的功能研究及其miRNA的调控第57-65页
    5.1 材料第57页
        5.1.1 CIK细胞的培养,冻存与复苏第57页
        5.1.2 总RNA的提取第57页
    5.2 方法第57-59页
        5.2.1 双赢光素酶报告载体的构建第57页
        5.2.2 agomir miRNA的合成第57-58页
        5.2.3 gctlr21mRNA靶向基因的筛选第58-59页
        5.2.4 实时荧光定量(RT-PCR)第59页
    5.3 结果第59-63页
        5.3.1 gctlr21生物信息第59页
        5.3.2 PAMPs诱导gctlr21mRNA转录第59-60页
        5.3.3 gctlr21过表达和干扰对下游免疫相关基因的调控第60页
        5.3.4 gctlr21基因对双荧光素酶报告系统的调控第60-61页
        5.3.5 miRNA靶基因预测第61-62页
        5.3.6 miRNA对免疫基因的调控第62-63页
    5.4 讨论第63-65页
结论第65-66页
参考文献第66-79页
附录 硕士在读期间发表及投稿论文第79-80页
致谢第80页

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