| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-15页 |
| 1.1 红鳍东方鲀简介 | 第10-11页 |
| 1.1.1 红鳍东方鲀的分类与地理分布 | 第10页 |
| 1.1.2 红鳍东方鲀的生物学特征 | 第10-11页 |
| 1.2 RNA-SEQ技术及在鱼类中的研究进展 | 第11-12页 |
| 1.3 盐度影响鱼类的渗透压调节机制研究进展 | 第12-14页 |
| 1.3.1 盐度对鱼类组织结构的影响研究进展 | 第12-13页 |
| 1.3.2 盐度对鱼类基因表达水平的影响研究进展 | 第13-14页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第14-15页 |
| 第二章 红鳍东方鲀鳃的RNA-SEQ测序与结果分析 | 第15-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第15-16页 |
| 2.1.1 实验材料与实验设计 | 第15页 |
| 2.1.2 主要药品与试剂配制 | 第15-16页 |
| 2.1.3 主要仪器设备 | 第16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-20页 |
| 2.2.1 红鳍东方鲀幼鱼鳃的总RNA提取 | 第16-17页 |
| 2.2.2 RNA-Seq测序 | 第17-18页 |
| 2.2.2.1 总RNA样品检测 | 第17页 |
| 2.2.2.2 文库构建 | 第17-18页 |
| 2.2.2.3 cDNA文库上机测序 | 第18页 |
| 2.2.3 数据分析 | 第18-19页 |
| 2.2.4 测序基因的荧光定量PCR验证 | 第19-20页 |
| 2.2.4.1 反转录反应 | 第19页 |
| 2.2.4.2 测序基因的荧光定量PCR验证 | 第19-20页 |
| 2.3 实验结果 | 第20-26页 |
| 2.3.1 总RNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.3.2 RNA-Seq测序结果 | 第21-26页 |
| 2.3.2.1 测序数据统计与参考序列对比分析 | 第21-22页 |
| 2.3.2.2 基因的表达量分析 | 第22页 |
| 2.3.2.3 差异基因表达分析 | 第22-24页 |
| 2.3.2.4 差异基因GO富集 | 第24页 |
| 2.3.2.5 差异基因KEGG富集 | 第24-26页 |
| 2.4 RNA-SEQ测序基因验证 | 第26-27页 |
| 2.5 讨论 | 第27-30页 |
| 2.5.1 测序数据统计与参考序列对比分析 | 第27-28页 |
| 2.5.2 基因表达水平分析 | 第28页 |
| 2.5.3 差异表达基因分析 | 第28页 |
| 2.5.4 基因注释 | 第28-29页 |
| 2.5.5 测序结果的验证 | 第29-30页 |
| 第三章 急性低盐胁迫对红鳍东方鲀幼鱼基因表达的影响 | 第30-44页 |
| 3.1 材料与方法 | 第30-31页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第30页 |
| 3.1.2 实验设计 | 第30页 |
| 3.1.3 主要药品与试剂配制 | 第30-31页 |
| 3.1.4 主要仪器设备 | 第31页 |
| 3.2 实验方法 | 第31-32页 |
| 3.2.1 红鳍东方鲀幼鱼鳃的总RNA提取 | 第31页 |
| 3.2.2 反转录反应 | 第31页 |
| 3.2.3 相对荧光定量PCR检测低盐胁迫下基因的表达量 | 第31-32页 |
| 3.2.4 数据处理 | 第32页 |
| 3.3 实验结果 | 第32-41页 |
| 3.3.1 总RNA的提取 | 第32-33页 |
| 3.3.2 引物筛选 | 第33-34页 |
| 3.3.3 Hsp70、IgM、SLC39A6、CYP1A1、GPI基因在红鳍东方鲀幼鱼鳃和肾中的表达 | 第34页 |
| 3.3.4 低盐胁迫对红鳍东方鲀幼鱼中Hsp70基因表达量的影响 | 第34-36页 |
| 3.3.5 低盐胁迫后红鳍东方鲀幼鱼中IgM基因的表达 | 第36-37页 |
| 3.3.6 低盐胁迫后红鳍东方鲀幼鱼中CYP1A1基因的表达 | 第37-38页 |
| 3.3.7 低盐胁迫后红鳍东方鲀幼鱼中SLC39A6基因的表达 | 第38-40页 |
| 3.3.8 低盐胁迫后红鳍东方鲀幼鱼中GPI基因的表达 | 第40-41页 |
| 3.4 讨论 | 第41-44页 |
| 第四章 低盐处理对红鳍东方鲀幼鱼组织结构的影响 | 第44-51页 |
| 4.1 材料与方法 | 第44-45页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第44页 |
| 4.1.2 实验设计 | 第44-45页 |
| 4.1.3 主要药品和试剂配制 | 第45页 |
| 4.1.4 样品采集与制备 | 第45页 |
| 4.1.5 组织形态学观察与测量 | 第45页 |
| 4.1.6 数据处理 | 第45页 |
| 4.2 实验结果 | 第45-49页 |
| 4.2.1 红鳍东方鲀幼鱼鳃的显微结构 | 第45-46页 |
| 4.2.2 红鳍东方鲀幼鱼肾的显微结构 | 第46-47页 |
| 4.2.3 红鳍东方鲀幼鱼肠的显微结构 | 第47-49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-51页 |
| 总结 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-58页 |
| 攻读硕士期间发表的论文目录 | 第58-61页 |
| 致谢 | 第61-62页 |
| 附表 差异基因列表 | 第62-67页 |
