摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第13-41页 |
1.1 单分子分析技术简介 | 第13页 |
1.2 纳米通道的发展历史 | 第13-14页 |
1.3 纳米通道的检测原理 | 第14-15页 |
1.4 纳米通道的分类 | 第15-16页 |
1.5 α-HL纳米通道简介 | 第16-18页 |
1.6 生物纳米通道在DNA测序中的应用 | 第18-26页 |
1.7 α-HL纳米通道在DNA的表观遗传物质检测中的应用 | 第26-28页 |
1.7.1 α-HL纳米通道检测microRNA | 第26页 |
1.7.2 α-HL纳米通道检测G-四链体及其折叠过程 | 第26-27页 |
1.7.3 α-HL纳米通道检测DNA损伤 | 第27页 |
1.7.4 α-HL纳米通道检测DNA甲基化 | 第27-28页 |
1.8 α-HL纳米通道在蛋白质构象研究中的应用 | 第28-30页 |
1.9 本课题的研究意义 | 第30-31页 |
参考文献 | 第31-41页 |
第二章 α-HL单体蛋白的制备及其纳米通道的组装 | 第41-59页 |
2.1 前言 | 第41-42页 |
2.2 实验部分 | 第42-49页 |
2.2.1 实验菌株 | 第42页 |
2.2.2 实验试剂 | 第42-43页 |
2.2.3 实验仪器 | 第43页 |
2.2.4 溶液配制 | 第43-45页 |
2.2.5 E.coil BL-21(DE3) pLysS表达α-HL蛋白 | 第45-46页 |
2.2.6 IVTT法表达α-HL蛋白 | 第46页 |
2.2.7 α-HL单体蛋白的纯化 | 第46-47页 |
2.2.8 α-HL单体蛋白溶血活性检测 | 第47页 |
2.2.9 α-HL七聚体的制备 | 第47-48页 |
2.2.10 α-HL蛋白纳米通道活性表征 | 第48-49页 |
2.3 结果与讨论 | 第49-56页 |
2.3.1 α-HL单体蛋白的表达 | 第49-51页 |
2.3.2 α-HL单体蛋白的纯化 | 第51-53页 |
2.3.3 α-HL单体蛋白浓度测定和溶血活性分析 | 第53-54页 |
2.3.4 α-HL七聚体纳米通道的组装 | 第54-55页 |
2.3.5 α-HL纳米单通道特性 | 第55-56页 |
2.4 结论 | 第56页 |
参考文献 | 第56-59页 |
第三章 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系的建立 | 第59-85页 |
3.1 引言 | 第59-60页 |
3.2 实验部分 | 第60-64页 |
3.2.1 实验试剂 | 第60页 |
3.2.2 实验仪器 | 第60-61页 |
3.2.3 实验装置 | 第61页 |
3.2.4 检测电解池 | 第61-62页 |
3.2.5 磷脂双分子层的建立原理 | 第62-63页 |
3.2.6 天然α-HL七聚体蛋白质(WT)_7的制备 | 第63页 |
3.2.7 ssDNA样品的溶解 | 第63页 |
3.2.8 通道电流记录 | 第63页 |
3.2.9 数据处理 | 第63-64页 |
3.3 结果与讨论 | 第64-82页 |
3.3.1 TMA-Cl电解液中磷脂双分子层稳定性研究 | 第64页 |
3.3.2 TMA-Cl电解液中α-HL单通道寿命分析 | 第64-65页 |
3.3.3 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中通道的噪音分析 | 第65-66页 |
3.3.4 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中通道开放电流的变化 | 第66-67页 |
3.3.5 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA穿过纳米通道的速度研究 | 第67-71页 |
3.3.6 (α-HL)_7TMA-Cl纳米通道体系中DNA电流阻塞振幅的研究 | 第71-73页 |
3.3.7 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA捕获速率的研究 | 第73-75页 |
3.3.8 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA动力学常数和热力学常数的计算 | 第75-76页 |
3.3.9 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分相同链长的核苷酸均聚物 | 第76-79页 |
3.3.10 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分相同链长的核苷酸杂聚物 | 第79-80页 |
3.3.11 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分不同链长的poly(dT) | 第80-82页 |
3.4 结论 | 第82页 |
参考文献 | 第82-85页 |
第四章 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系的应用——快速精准检测DNA甲基化 | 第85-109页 |
4.1 引言 | 第85-86页 |
4.2 实验部分 | 第86-89页 |
4.2.1 实验试剂 | 第86-87页 |
4.2.2 DNA序列 | 第87-88页 |
4.2.3 实验仪器 | 第88页 |
4.2.4 DNA溶液的配制 | 第88页 |
4.2.5 α-溶血素七聚体蛋白质(WT)_7的制备 | 第88页 |
4.2.6 检测方法 | 第88-89页 |
4.2.7 数据处理 | 第89页 |
4.3 结果与讨论 | 第89-103页 |
4.3.1 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系检测和鉴别甲基化与未甲基化的发卡DNA | 第89-95页 |
4.3.2 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析体系中DNA的序列环境对甲基化检测的影响 | 第95-98页 |
4.3.3 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析体系检测p16基因片段的甲基化 | 第98-103页 |
4.4 结论 | 第103页 |
参考文献 | 第103-109页 |
第五章 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系的建立及应用 | 第109-125页 |
5.1 引言 | 第109-111页 |
5.1.1 环糊精药物释放体系 | 第109-110页 |
5.1.2 Trp-cage miniprotein简介 | 第110-111页 |
5.2 实验部分 | 第111-113页 |
5.2.1 实验试剂 | 第111-112页 |
5.2.2 实验仪器 | 第112页 |
5.2.3 检测方法 | 第112-113页 |
5.2.4 数据处理 | 第113页 |
5.3 结果与讨论 | 第113-121页 |
5.3.1 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系的建立 | 第113-114页 |
5.3.2 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系检测βCD | 第114-117页 |
5.3.3 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系检测βCD与AdNH_2·HCl的复合物 | 第117-118页 |
5.3.4 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系中AdNH_2·HCl分子的信号分析 | 第118-120页 |
5.3.5 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系研究Trp-cage miniprotein的构象 | 第120-121页 |
5.4 总结 | 第121页 |
参考文献 | 第121-125页 |
第六章 总结 | 第125-127页 |
致谢 | 第127-129页 |
攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第129-131页 |
作者简介 | 第131页 |