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纳米通道单分子分析新体系的研究及应用

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第13-41页
    1.1 单分子分析技术简介第13页
    1.2 纳米通道的发展历史第13-14页
    1.3 纳米通道的检测原理第14-15页
    1.4 纳米通道的分类第15-16页
    1.5 α-HL纳米通道简介第16-18页
    1.6 生物纳米通道在DNA测序中的应用第18-26页
    1.7 α-HL纳米通道在DNA的表观遗传物质检测中的应用第26-28页
        1.7.1 α-HL纳米通道检测microRNA第26页
        1.7.2 α-HL纳米通道检测G-四链体及其折叠过程第26-27页
        1.7.3 α-HL纳米通道检测DNA损伤第27页
        1.7.4 α-HL纳米通道检测DNA甲基化第27-28页
    1.8 α-HL纳米通道在蛋白质构象研究中的应用第28-30页
    1.9 本课题的研究意义第30-31页
    参考文献第31-41页
第二章 α-HL单体蛋白的制备及其纳米通道的组装第41-59页
    2.1 前言第41-42页
    2.2 实验部分第42-49页
        2.2.1 实验菌株第42页
        2.2.2 实验试剂第42-43页
        2.2.3 实验仪器第43页
        2.2.4 溶液配制第43-45页
        2.2.5 E.coil BL-21(DE3) pLysS表达α-HL蛋白第45-46页
        2.2.6 IVTT法表达α-HL蛋白第46页
        2.2.7 α-HL单体蛋白的纯化第46-47页
        2.2.8 α-HL单体蛋白溶血活性检测第47页
        2.2.9 α-HL七聚体的制备第47-48页
        2.2.10 α-HL蛋白纳米通道活性表征第48-49页
    2.3 结果与讨论第49-56页
        2.3.1 α-HL单体蛋白的表达第49-51页
        2.3.2 α-HL单体蛋白的纯化第51-53页
        2.3.3 α-HL单体蛋白浓度测定和溶血活性分析第53-54页
        2.3.4 α-HL七聚体纳米通道的组装第54-55页
        2.3.5 α-HL纳米单通道特性第55-56页
    2.4 结论第56页
    参考文献第56-59页
第三章 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系的建立第59-85页
    3.1 引言第59-60页
    3.2 实验部分第60-64页
        3.2.1 实验试剂第60页
        3.2.2 实验仪器第60-61页
        3.2.3 实验装置第61页
        3.2.4 检测电解池第61-62页
        3.2.5 磷脂双分子层的建立原理第62-63页
        3.2.6 天然α-HL七聚体蛋白质(WT)_7的制备第63页
        3.2.7 ssDNA样品的溶解第63页
        3.2.8 通道电流记录第63页
        3.2.9 数据处理第63-64页
    3.3 结果与讨论第64-82页
        3.3.1 TMA-Cl电解液中磷脂双分子层稳定性研究第64页
        3.3.2 TMA-Cl电解液中α-HL单通道寿命分析第64-65页
        3.3.3 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中通道的噪音分析第65-66页
        3.3.4 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中通道开放电流的变化第66-67页
        3.3.5 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA穿过纳米通道的速度研究第67-71页
        3.3.6 (α-HL)_7TMA-Cl纳米通道体系中DNA电流阻塞振幅的研究第71-73页
        3.3.7 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA捕获速率的研究第73-75页
        3.3.8 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中DNA动力学常数和热力学常数的计算第75-76页
        3.3.9 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分相同链长的核苷酸均聚物第76-79页
        3.3.10 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分相同链长的核苷酸杂聚物第79-80页
        3.3.11 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道体系中区分不同链长的poly(dT)第80-82页
    3.4 结论第82页
    参考文献第82-85页
第四章 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系的应用——快速精准检测DNA甲基化第85-109页
    4.1 引言第85-86页
    4.2 实验部分第86-89页
        4.2.1 实验试剂第86-87页
        4.2.2 DNA序列第87-88页
        4.2.3 实验仪器第88页
        4.2.4 DNA溶液的配制第88页
        4.2.5 α-溶血素七聚体蛋白质(WT)_7的制备第88页
        4.2.6 检测方法第88-89页
        4.2.7 数据处理第89页
    4.3 结果与讨论第89-103页
        4.3.1 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析新体系检测和鉴别甲基化与未甲基化的发卡DNA第89-95页
        4.3.2 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析体系中DNA的序列环境对甲基化检测的影响第95-98页
        4.3.3 (α-HL)_7/TMA-Cl纳米通道分析体系检测p16基因片段的甲基化第98-103页
    4.4 结论第103页
    参考文献第103-109页
第五章 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系的建立及应用第109-125页
    5.1 引言第109-111页
        5.1.1 环糊精药物释放体系第109-110页
        5.1.2 Trp-cage miniprotein简介第110-111页
    5.2 实验部分第111-113页
        5.2.1 实验试剂第111-112页
        5.2.2 实验仪器第112页
        5.2.3 检测方法第112-113页
        5.2.4 数据处理第113页
    5.3 结果与讨论第113-121页
        5.3.1 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系的建立第113-114页
        5.3.2 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系检测βCD第114-117页
        5.3.3 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系检测βCD与AdNH_2·HCl的复合物第117-118页
        5.3.4 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系中AdNH_2·HCl分子的信号分析第118-120页
        5.3.5 (α-HL)_7/GdnHCl纳米通道分析新体系研究Trp-cage miniprotein的构象第120-121页
    5.4 总结第121页
    参考文献第121-125页
第六章 总结第125-127页
致谢第127-129页
攻读博士学位期间取得的科研成果第129-131页
作者简介第131页

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