| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 符号说明(英文缩略词) | 第9-10页 |
| 第一部分 文献综述 | 第10-30页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-30页 |
| 1 数量性状遗传体系 | 第11-13页 |
| ·数量性状 | 第11页 |
| ·数量性状遗传体系 | 第11-13页 |
| 2 分子标记 | 第13-16页 |
| ·分子标记的种类 | 第13页 |
| ·SNP标记 | 第13-16页 |
| 3 连锁图谱 | 第16-17页 |
| ·连锁图构建的原理 | 第16页 |
| ·连锁图谱构建的影响因素 | 第16-17页 |
| ·连锁图谱构建的软件 | 第17页 |
| 4 关联分析的产生、发展与展望 | 第17-23页 |
| ·关联分析的产生 | 第18页 |
| ·关联分析的研究进展 | 第18-22页 |
| ·关联分析的展望 | 第22页 |
| ·连锁分析与关联分析的关系 | 第22-23页 |
| 5 植物籽粒大小与形状性状的研究进展 | 第23-29页 |
| ·拟南芥、水稻籽粒大小与形状性状的研究进展 | 第24-26页 |
| ·大豆籽粒大小与形状性状的研究进展 | 第26-29页 |
| 6 本研究的目的与研究内容 | 第29-30页 |
| 第二部分 研究报告 | 第30-89页 |
| 第二章 大豆籽粒大小与形状性状的全基因组关联分析 | 第31-76页 |
| 摘要 | 第31页 |
| 1 引言 | 第31-32页 |
| 2 实验材料和方法 | 第32-36页 |
| ·实验材料 | 第32-33页 |
| ·籽粒大小与形状性状的测定 | 第33页 |
| ·SNP标记的获得 | 第33-35页 |
| ·分析方法及相关软件 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-66页 |
| ·品种群体籽粒粒形的表型特征和相关分析 | 第36-37页 |
| ·SNP的筛选及分布特征 | 第37页 |
| ·品种群体结构分析 | 第37-38页 |
| ·全基因组关联分析 | 第38-42页 |
| ·优异等位基因的挖掘和设计聚合育种 | 第42-57页 |
| ·候选基因预测 | 第57页 |
| ·GO富集分析 | 第57-66页 |
| 4 讨论 | 第66-76页 |
| ·检测结果的可靠性 | 第66-70页 |
| ·表型相关的遗传学解释 | 第70页 |
| ·优异等位基因与设计育种 | 第70-71页 |
| ·籽粒大小与形状基因的鉴定及其控制途径 | 第71-76页 |
| 第三章 偏分离群体连锁图矫正和QTL定位软件包DistortedMap的研制 | 第76-87页 |
| 摘要 | 第76页 |
| l前言 | 第76-77页 |
| 2 软件目标和计算流程 | 第77页 |
| 3 算法与代码实现 | 第77-81页 |
| 4 软件的界面与功能 | 第81-86页 |
| ·软件的主界面 | 第81-82页 |
| ·主菜单及下拉菜单选项 | 第82-86页 |
| 5 讨论 | 第86-87页 |
| 第四章 全文结论与创新点 | 第87-89页 |
| 1 全文结论 | 第87页 |
| ·通过全基因组关联分析挖掘到335个优异等位基因,并挖掘出与籽粒大小性状相关的162个候选基因 | 第87页 |
| ·软件DistortedMap的研制 | 第87页 |
| 2 创新点 | 第87-89页 |
| 参考文献 | 第89-105页 |
| 附表 | 第105-123页 |
| 致谢 | 第123-125页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第125页 |