| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 引言 | 第7-9页 |
| 1 基本理论 | 第9-20页 |
| ·构象 | 第9-11页 |
| ·肽简介 | 第11-13页 |
| ·分子力场方法(MM) | 第13-14页 |
| ·密度泛函理论 | 第14-15页 |
| ·ABEEMσπ 方法 | 第15-17页 |
| ·ABEEMσπ/MM方法 | 第17-20页 |
| 2 以缬氨酸分子为例用从头算方法和ABEEMσπ/MM，OPLS/AA和AMBER力场方法探究其稳定构象 | 第20-31页 |
| ·从头算方法 | 第20-24页 |
| ·确定缬氨酸二肽稳定构象的方法 | 第20-21页 |
| ·扫描寻找缬氨酸三肽稳定构象 | 第21-22页 |
| ·优化缬氨酸三肽分子不同构象 | 第22-24页 |
| ·应用ABEEMσπ/MM，OPLS/AA和AMBER力场方法优化得到的缬氨酸二肽及三肽分子不同稳定构象 | 第24-31页 |
| ·缬氨酸二肽分子不同稳定构象 | 第24-25页 |
| ·缬氨酸三肽分子不同稳定构象 | 第25-31页 |
| 3 ABEEMσπ/MM方法计算缬氨酸二肽及三肽不同构象的总能量 | 第31-41页 |
| ·利用ABEEMσπ/MM方法对缬氨酸二肽及三肽进行能量计算 | 第31-33页 |
| ·利用修正的ABEEMσπ/MM方法对缬氨酸二肽及三肽进行能量计算 | 第33-38页 |
| ·ABEEMσπ/MM方法与从头算MP2/6-311++G(d,p)方法计算分子总能量的时间比较 | 第38-39页 |
| ·几种力场方法与从头算MP2/6-311++G(d,p)方法获得的缬氨酸二肽及三肽构象能的比较 | 第39-41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第45-46页 |
| 致谢 | 第46页 |
