| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-14页 |
| 中英文缩略词表 | 第14-15页 |
| 前言 | 第15-24页 |
| 1 新发与未知病原体概要 | 第15-16页 |
| 2 发现病毒的主要方法 | 第16-18页 |
| 3 新病原疾病相关性的确定 | 第18-20页 |
| 4 病毒宏基因组学 | 第20-22页 |
| 5 本研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 第一部分 454高通量测序、信息分析与潜在新病毒相关研究方法的建立 | 第24-57页 |
| 1 背景 | 第24-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-39页 |
| ·实验材料 | 第26-29页 |
| ·实验方法 | 第29-39页 |
| ·进化分析 | 第39页 |
| 3 实验结果 | 第39-51页 |
| ·454高通量测序样品的准备 | 第39-40页 |
| ·测序所获序列信息 | 第40页 |
| ·潜在新病毒序列 | 第40-41页 |
| ·潜在新病毒的进化分析 | 第41-42页 |
| ·潜在新病毒序列的确证与筛查 | 第42-43页 |
| ·猪标本所得序列宏基因组分析 | 第43-44页 |
| ·PLV-CHN全长基因组的扩增 | 第44-45页 |
| ·PLV-CHN基因组结构与编码区 | 第45-46页 |
| ·PLV-CHN的分子流行病学 | 第46-47页 |
| ·PLV-CHN的进化分析 | 第47-49页 |
| ·细胞培养 | 第49页 |
| ·PLV-CHN在人群中的血清流行病学 | 第49-51页 |
| 4 讨论 | 第51-55页 |
| 5 小结 | 第55-57页 |
| 第二部分 儿童腹泻病例对照粪便标本病毒宏基因组的研究 | 第57-78页 |
| 1 背景 | 第57-59页 |
| 2 材料与方法 | 第59-64页 |
| ·材料 | 第59-60页 |
| ·高通量序列信息分析平台 | 第60页 |
| ·实验方法 | 第60-64页 |
| ·统计学分析 | 第64页 |
| 3 实验结果 | 第64-75页 |
| ·两组人群基本信息 | 第64-65页 |
| ·两组人群测序获得的基本信息 | 第65-68页 |
| ·各样本中初始读长序列的数量分布 | 第68页 |
| ·两组人群的总病原种类分析 | 第68-69页 |
| ·与病毒没有同源性的序列 | 第69页 |
| ·与病毒有同源性的序列 | 第69-70页 |
| ·病毒种类分析 | 第70-72页 |
| ·腹泻和健康两组儿童粪便标本中相关病毒的比对 | 第72-73页 |
| ·病例中主要病毒感染儿童的性别分析 | 第73-74页 |
| ·潜在新病毒 | 第74-75页 |
| 4 讨论 | 第75-77页 |
| 5 小结 | 第77-78页 |
| 论文参考文献 | 第78-86页 |
| 综述 | 第86-95页 |
| 综述参考文献 | 第91-95页 |
| 附录1 | 第95-98页 |
| 附录2 | 第98-100页 |
| 附录3 | 第100-101页 |
| 附录4 | 第101-106页 |
| 致谢 | 第106-108页 |
| 个人简历 | 第108页 |