| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 第一篇 文献综述 | 第11-20页 |
| 1 呼吸道病毒概述 | 第11-12页 |
| ·犬瘟热病毒 | 第11页 |
| ·犬腺病毒 | 第11-12页 |
| ·犬副流感病毒 | 第12页 |
| ·犬冠状病毒 | 第12页 |
| 2 芯片技术简述 | 第12-14页 |
| ·芯片技术的优势 | 第12-13页 |
| ·芯片技术的类型 | 第13-14页 |
| ·点样芯片(Spotted DNA arrays) | 第13页 |
| ·原位合成芯片(Oligonucleotide arrays) | 第13-14页 |
| ·芯片技术操作步骤 | 第14页 |
| ·芯片数据的分析和解释 | 第14页 |
| 3 芯片技术在病原体研究中的应用 | 第14-17页 |
| ·微生物检测 | 第14-15页 |
| ·未知病原体的筛查 | 第15-16页 |
| ·疫苗研制 | 第16页 |
| ·流行病学调查 | 第16页 |
| ·历史回顾性调查 | 第16-17页 |
| ·微生物进化 | 第17页 |
| 4 基因芯片的新方法 | 第17-19页 |
| ·纳米技术与芯片 | 第17页 |
| ·半导体基础的光电二级管生物芯片 | 第17-18页 |
| ·芯片实验室 | 第18-19页 |
| 5 结语 | 第19-20页 |
| 第二篇 实验研究 | 第20-54页 |
| 第1章 犬呼吸道病毒寡核苷酸探针的设计及验证 | 第20-26页 |
| 1 材料 | 第20页 |
| 2 方法 | 第20-21页 |
| ·犬呼吸道病毒基因序列的下载 | 第20页 |
| ·犬呼吸道病毒基因组序列的比对 | 第20页 |
| ·犬呼吸道病毒特异性探针的设计 | 第20-21页 |
| ·探针的筛选和特异性生物学验证 | 第21页 |
| 3 结果 | 第21-24页 |
| ·犬呼吸道病毒基因序列下载 | 第21页 |
| ·犬呼吸道病毒基因组保守区比对 | 第21-22页 |
| ·犬呼吸道病毒各病毒种保守性探针设计结果 | 第22-24页 |
| 4 讨论 | 第24-25页 |
| 5 小结 | 第25-26页 |
| 第2章 犬呼吸道病毒多重PCR基因芯片检测方法的建立 | 第26-46页 |
| 1 材料 | 第26-27页 |
| ·病毒株及细胞株 | 第26页 |
| ·试剂与仪器 | 第26-27页 |
| ·其它材料 | 第27页 |
| 2 方法 | 第27-31页 |
| ·引物设计 | 第27-28页 |
| ·核酸提取—使用SPIN技术从动物细胞中纯化总RNA | 第28-29页 |
| ·逆转录 | 第29页 |
| ·DNA的提取 | 第29页 |
| ·PCR扩增 | 第29页 |
| ·扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测 | 第29-30页 |
| ·测序 | 第30页 |
| ·多重PCR扩增方法的建立 | 第30-31页 |
| 3 基因芯片制备 | 第31-35页 |
| ·基因芯片点样模式 | 第31-32页 |
| ·点样后芯片的后处理 | 第32页 |
| ·芯片的杂交 | 第32-34页 |
| ·结果扫描及分析 | 第34页 |
| ·单一病毒样品多重PCR-基因芯片检测 | 第34页 |
| ·基因芯片检测特异性验证 | 第34-35页 |
| ·基因芯片检测灵敏度验证 | 第35页 |
| ·基因芯片稳定性验证 | 第35页 |
| ·基因芯片探针稳定性验证 | 第35页 |
| ·临床样本的验证 | 第35页 |
| 4 结果 | 第35-43页 |
| ·犬呼吸道病毒多重PCR扩增结果 | 第35-37页 |
| ·多重PCR体系扩增特异性验证结果 | 第37页 |
| ·犬呼吸道病毒多重PCR体系扩增灵敏度验证结果 | 第37-38页 |
| ·犬呼吸道病毒多重PCR扩增体系重复性结果 | 第38页 |
| ·生物公司测序结果 | 第38-39页 |
| ·单病毒基因芯片检测结果 | 第39-40页 |
| ·基因芯片检测特异性验证 | 第40-41页 |
| ·基因芯片检测灵敏度验证 | 第41-42页 |
| ·基因芯片稳定性验证 | 第42页 |
| ·基因芯片探针稳定性验证 | 第42-43页 |
| ·临床样本的验证 | 第43页 |
| 5 讨论 | 第43-45页 |
| 6 小结 | 第45-46页 |
| 第3章 犬呼吸道病毒随机引物PCR基因芯片的建立 | 第46-54页 |
| 1 材料 | 第46-47页 |
| ·病毒株与细胞株 | 第46页 |
| ·PCR试剂与仪器 | 第46-47页 |
| ·其它材料 | 第47页 |
| 2. 方法 | 第47-49页 |
| ·核酸提取 | 第47页 |
| ·反转录 | 第47页 |
| ·样本cDNA进行随机引物PCR扩增 | 第47-48页 |
| ·芯片的洗涤 | 第48页 |
| ·芯片扫描分析 | 第48页 |
| ·PCR产物与芯片杂交条件的优化 | 第48页 |
| ·随机引物PCR基因芯片特异性实验 | 第48页 |
| ·随机引物PCR基因芯片灵敏度实验 | 第48-49页 |
| ·随机引物PCR基因芯片应用 | 第49页 |
| 3 结果 | 第49-52页 |
| ·随机引物扩增结果 | 第49页 |
| ·PCR产物与芯片杂交条件的优化 | 第49-50页 |
| ·随机引物PCR基因芯片特异性验证 | 第50-51页 |
| ·随机引物PCR基因芯片灵敏度的验证结果 | 第51页 |
| ·随机引物PCR基因芯片的应用 | 第51-52页 |
| 4 讨论 | 第52-53页 |
| 5 小结 | 第53-54页 |
| 总结 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 个人简历 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |