中华蜜蜂转录组测序及雌性蜜蜂基因表达分析
摘要 | 第1-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第一章 文献综述 | 第9-13页 |
1 中华蜜蜂的概况 | 第9页 |
2 雌性蜜蜂基因差异表达研究进展 | 第9-10页 |
3 DNA甲基化转移酶 | 第10-11页 |
4 蜜蜂中Dnmt3的研究进展 | 第11页 |
5 Illumina RNA测序技术 | 第11-12页 |
6 DGE | 第12页 |
7 本论文的研究内容 | 第12-13页 |
第二章 中华蜜蜂转录组测序和数字基因表达谱分析 | 第13-33页 |
1 引言 | 第13页 |
2 材料与方法 | 第13-21页 |
·实验材料 | 第13页 |
·实验蜂群 | 第13页 |
·实验器材及试剂 | 第13页 |
·实验方法 | 第13-21页 |
·创建CDNA文库和转录组序列 | 第13-15页 |
·Illumina序列结果的分析 | 第15-16页 |
·创建DGE文库并测序 | 第16-17页 |
·DGE测序文库与参考转录组数据库比对分析 | 第17-18页 |
·差异表达基因的筛选及功能注释 | 第18-20页 |
·qRT-PCR验证 | 第20-21页 |
3 结果 | 第21-31页 |
·Illumina测序和序列组装 | 第21-22页 |
·预测蛋白质的功能注释 | 第22-24页 |
·DGE标签测序文库 | 第24-26页 |
·DGE标签数据库与参考标签数据库进行比对 | 第26-27页 |
·中蜂蜂王与工蜂间差异表达基因 | 第27-30页 |
·差异表达基因的qRT-PCR验证 | 第30-31页 |
4 讨论 | 第31-33页 |
第三章 中华蜜蜂Dnmt3基因克隆及表达分析 | 第33-46页 |
1 引言 | 第33页 |
2 材料与方法 | 第33-39页 |
·实验材料 | 第33-34页 |
·实验蜂群 | 第33页 |
·实验试剂及仪器 | 第33-34页 |
·培养基和主要溶液的配制 | 第34页 |
·实验方法 | 第34-39页 |
·总RNA的提取 | 第34-35页 |
·实验器具的处理与准备 | 第34页 |
·试剂配制和准备 | 第34页 |
·提取步骤 | 第34-35页 |
·RNA质量检测 | 第35页 |
·反转录合成第一链CDNA | 第35-36页 |
·引物设计与合成 | 第36页 |
·PCR扩增 | 第36页 |
·PCR产物回收 | 第36-37页 |
·PCR产物的克隆 | 第37页 |
·序列的测定和分析 | 第37-38页 |
·荧光定量PCR | 第38-39页 |
·定量引物设计 | 第38页 |
·反转录反应 | 第38页 |
·标准品的制作 | 第38-39页 |
·实时荧光定量PCR | 第39页 |
·数据统计与分析 | 第39页 |
3. 结果与分析 | 第39-44页 |
·中蜂Dnmt3基因的扩增与鉴定 | 第39页 |
·中蜂Dnmt3基因与其编码蛋白比较分析 | 第39-42页 |
·中蜂Dnmt3基因的转录表达 | 第42-44页 |
4. 讨论 | 第44-46页 |
第四章 结论与展望 | 第46-47页 |
1 主要结论 | 第46页 |
2 研究展望 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-52页 |
附件1 Unigene代谢通路 | 第52-60页 |
攻读硕士期间发表论文情况 | 第60-61页 |
致谢 | 第61页 |